MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017934	CATTAT	2	12	56808	56819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017934	TTATGC	2	12	56874	56885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017934	CTTCGC	2	12	94521	94532	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017934	GATCTT	2	12	95225	95236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017934	AAATAT	2	12	108828	108839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017934	GCAGAA	2	12	127376	127387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017934	CTAAAG	2	12	131793	131804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017934	TTAACT	2	12	150771	150782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017934	GTTCTT	2	12	162540	162551	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017934	GGATCT	2	12	194428	194439	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017934	GGATCT	2	12	194680	194691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017934	AAGAAC	2	12	201859	201870	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017934	TCTTGC	2	12	215518	215529	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017934	TACCTT	2	12	218681	218692	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017934	GTAGGA	2	12	220178	220189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017934	CGCTAA	2	12	220573	220584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017934	TTTTGC	2	12	258185	258196	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017934	ATGATC	2	12	276342	276353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017934	ATGTTG	2	12	355950	355961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017934	GCGTTT	2	12	450618	450629	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017934	TCATAT	2	12	455914	455925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017934	TTCTTT	2	12	648545	648556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017934	GTTTTG	2	12	680980	680991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017934	CTTTGA	2	12	686935	686946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017934	AGGAAA	2	12	812271	812282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017934	TAAGCA	2	12	887708	887719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017934	CTGGAT	2	12	891250	891261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017934	GATAGA	2	12	891663	891674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017934	AATGAA	2	12	900878	900889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017934	TTCCCT	2	12	917553	917564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017934	TTACAA	2	12	945146	945157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017934	TAGATT	2	12	1003120	1003131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017934	CATTAT	2	12	1041624	1041635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017934	TTGATA	2	12	1071863	1071874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017934	TTCCTT	2	12	1209669	1209680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017934	TGAGAC	2	12	1214792	1214803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017934	GAACAT	2	12	1216198	1216209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017934	GTCCTT	2	12	1231238	1231249	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017934	CGGTGA	2	12	1265735	1265746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017934	AAATCT	2	12	1353538	1353549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017934	AAACAA	2	12	1402696	1402707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017934	AAGATC	2	12	1511215	1511226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017934	TATCGA	2	12	1577783	1577794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017934	GAGAAA	2	12	1599214	1599225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017934	AGATCT	2	12	1608270	1608281	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017934	GATCTT	2	12	1611226	1611237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017934	TACCTT	2	12	1614377	1614388	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017934	GTAGGA	2	12	1615698	1615709	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017934	CGCTAA	2	12	1616093	1616104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017934	CTGAAG	2	12	1689884	1689895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017934	ATCCAG	2	12	1704410	1704421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017934	ATCCAG	2	12	1712333	1712344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017934	GAAATA	2	12	1725963	1725974	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017934	TGTCCC	2	12	1743375	1743386	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017934	CTTCGC	2	12	1795120	1795131	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017934	AAGATC	2	12	1795261	1795272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017934	ATCCAG	2	12	1797079	1797090	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017934	CTTCGC	2	12	1803133	1803144	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017934	CTGGAT	2	12	1805433	1805444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017934	ATCCAG	2	12	1808896	1808907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017934	ATCCAG	2	12	1838901	1838912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017934	CTTCGC	2	12	1881651	1881662	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017934	AAGATC	2	12	1881792	1881803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017934	ATCCAG	2	12	1915204	1915215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017934	ATCCAG	2	12	1928330	1928341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017934	AAGATC	2	12	1954026	1954037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017934	GAAGAT	2	12	1985469	1985480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017934	AGATAA	2	12	2046306	2046317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017934	ATCTTG	2	12	2050519	2050530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017934	GAATTT	2	12	2062923	2062934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017934	CGACCC	2	12	2077592	2077603	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017934	CTTTTT	2	12	2096771	2096782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017934	GAGGTT	2	12	2096943	2096954	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017934	TGCAGT	2	12	2132235	2132246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017934	TATAAG	2	12	2215227	2215238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017934	CTTCAT	2	12	2215464	2215475	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017934	GAAATG	2	12	2220705	2220716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017934	GTGCGT	2	12	2221897	2221908	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017934	TCTTTT	2	12	2243094	2243105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017934	ACATTA	2	12	2298137	2298148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017934	AAGTTT	2	12	2391726	2391737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017934	TTCTCA	2	12	2407739	2407750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017934	TCCCAT	2	12	2447754	2447765	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017934	ACAATT	2	12	2448311	2448322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017934	CGAGAA	2	12	2474728	2474739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017934	CTGAAT	2	12	2484365	2484376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017934	CAGTTT	2	12	2487079	2487090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017934	GTAGCT	2	12	2487982	2487993	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017934	CCAGTT	2	12	2489380	2489391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017934	ACCTAG	2	12	2490849	2490860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017934	AAAATC	2	12	2500691	2500702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017934	AAAAGA	2	12	2502886	2502897	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017934	TAGTTC	2	12	2510435	2510446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017934	ATCCAG	2	12	2519500	2519511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017934	CTCACC	2	12	2551049	2551060	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017934	AGTGAA	2	12	2561861	2561872	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017934	TAGTCT	2	12	2563291	2563302	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017934	CTCGAT	2	12	2607503	2607514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017934	TTTGGT	2	12	2617593	2617604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017934	TCTTTT	2	12	2617748	2617759	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017934	AATTAT	2	12	2617811	2617822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017934	AAGAAA	2	12	2637747	2637758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017934	TCTATC	2	12	2639033	2639044	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017934	ATCCAG	2	12	2639447	2639458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017934	GGCGAA	2	12	2650644	2650655	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017934	ACAAGA	2	12	2653342	2653353	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017934	TGGAAA	2	12	2659582	2659593	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017934	AAAAAG	2	12	2694438	2694449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017934	AAGAGC	2	12	2706121	2706132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017934	GGCGAA	2	12	2707171	2707182	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017934	TGAGGA	2	12	2719555	2719566	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017934	TAGGAG	2	12	2724823	2724834	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017934	ATCCAG	2	12	2773559	2773570	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017934	GTTCAA	2	12	2800070	2800081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017934	CAATTC	2	12	2863959	2863970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017934	AGTCTC	2	12	2893006	2893017	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017934	CTTTGC	2	12	2928168	2928179	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017934	TAAAGA	2	12	2956873	2956884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017934	CTTCAT	2	12	2959522	2959533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017934	ATCCAG	2	12	2961288	2961299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017934	GTTAAC	2	12	2962218	2962229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017934	GTTAAC	2	12	2962231	2962242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.