MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	TCCT	2	8	45	52	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017858	GCCC	2	8	2342	2349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017858	GTTC	2	8	2911	2918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017858	CAAA	2	8	3073	3080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017858	GGGA	2	8	3277	3284	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017858	GGCT	2	8	3646	3653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017858	CAAC	2	8	3766	3773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017858	CCCT	2	8	3819	3826	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017858	TCCC	2	8	6043	6050	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017858	ACGC	2	8	12302	12309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017858	ATCA	2	8	14956	14963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017858	AAAT	2	8	18315	18322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017858	CTGC	2	8	20290	20297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017858	TCAT	2	8	22047	22054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017858	GAAA	2	8	22837	22844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017858	TAAA	2	8	23033	23040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017858	GTCA	2	8	27174	27181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017858	TCCC	2	8	33994	34001	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017858	CAGG	2	8	39486	39493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017858	GGTC	2	8	42810	42817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017858	GGGT	2	8	44111	44118	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017858	CTTT	2	8	44353	44360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017858	TCCT	2	8	47417	47424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.