MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017857	TCG	2	6	1310712	1310717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017857	A	6	6	1310795	1310800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017857	TG	3	6	1310979	1310984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017857	CAT	2	6	1311019	1311024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017857	ATC	2	6	1311050	1311055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017857	GGT	2	6	1311062	1311067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017857	CAC	2	6	1311068	1311073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_017857	CTTT	2	8	1311087	1311094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_017857	TCA	3	9	1311123	1311131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017857	CAG	2	6	1311161	1311166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017857	TCT	2	6	1311213	1311218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017857	CCG	2	6	1311277	1311282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_017857	GTG	2	6	1311286	1311291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017857	CAT	2	6	1311358	1311363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_017857	ATC	3	9	1311372	1311380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017857	GA	3	6	1311446	1311451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017857	GTT	2	6	1311460	1311465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017857	TCC	2	6	1311516	1311521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_017857	T	6	6	1311530	1311535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017857	CT	3	6	1311625	1311630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_017857	ATG	2	6	1311693	1311698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017857	GTT	2	6	1311706	1311711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017857	CTT	2	6	1311733	1311738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017857	CTG	2	6	1311798	1311803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017857	CACC	2	8	1311826	1311833	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3027	NC_017857	CAC	2	6	1311854	1311859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3029	NC_017857	GGC	2	6	1311875	1311880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017857	TGG	2	6	1311889	1311894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017857	ATA	2	6	1311906	1311911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017857	TC	3	6	1315818	1315823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_017857	CCA	2	6	1315828	1315833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_017857	CTG	2	6	1315834	1315839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017857	TG	3	6	1315849	1315854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017857	CTC	2	6	1316226	1316231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3038	NC_017857	TTCC	2	8	1317789	1317796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_017857	CAA	2	6	1317841	1317846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017857	AATG	2	8	1317876	1317883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017857	T	6	6	1317920	1317925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017857	A	7	7	1317931	1317937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3045	NC_017857	AGTC	2	8	1322902	1322909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_017857	TCAG	2	8	1322920	1322927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_017857	TGG	2	6	1322992	1322997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_017857	AAG	2	6	1323059	1323064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017857	GGC	2	6	1323083	1323088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017857	GGCG	2	8	1323171	1323178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_017857	CTTGT	2	10	1323240	1323249	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3053	NC_017857	TAAT	2	8	1323281	1323288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017857	T	6	6	1323325	1323330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3058	NC_017857	A	7	7	1323452	1323458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017857	T	7	7	1325348	1325354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017857	GAAT	2	8	1327008	1327015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017857	GTTT	2	8	1327496	1327503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017857	T	6	6	1327526	1327531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017857	GGC	2	6	1327544	1327549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3067	NC_017857	TTGG	2	8	1328189	1328196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017857	TCT	2	6	1328208	1328213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017857	ATG	2	6	1328318	1328323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017857	CAAT	2	8	1328346	1328353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_017857	TAT	2	6	1328416	1328421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017857	GAC	2	6	1328424	1328429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3074	NC_017857	CAGG	2	8	1335722	1335729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_017857	T	6	6	1335730	1335735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017857	TTTA	2	8	1337541	1337548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_017857	ATT	2	6	1338362	1338367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017857	TTG	2	6	1338434	1338439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017857	TTG	2	6	1338454	1338459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3084	NC_017857	GAG	2	6	1338511	1338516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017857	ATGG	2	8	1338585	1338592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_017857	CCG	2	6	1338741	1338746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_017857	GCC	2	6	1338773	1338778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3092	NC_017857	CAG	2	6	1338837	1338842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017857	CAA	2	6	1338942	1338947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_017857	GA	4	8	1338971	1338978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017857	ACA	2	6	1339003	1339008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_017857	AGT	2	6	1339021	1339026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017857	ATCGC	2	10	1339088	1339097	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3098	NC_017857	GAC	2	6	1339146	1339151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017857	ACA	2	6	1340416	1340421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017857	A	8	8	1342402	1342409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017857	T	7	7	1342425	1342431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3104	NC_017857	CAA	2	6	1342484	1342489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017857	AAT	2	6	1342501	1342506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017857	TTG	2	6	1342566	1342571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017857	AC	3	6	1342638	1342643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_017857	T	7	7	1343313	1343319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017857	TTG	2	6	1343434	1343439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017857	TAA	2	6	1343497	1343502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017857	GAAC	2	8	1343609	1343616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_017857	TTGA	2	8	1343627	1343634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017857	GCC	2	6	1343648	1343653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3117	NC_017857	GCA	2	6	1343939	1343944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017857	TGGG	2	8	1343972	1343979	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017857	T	6	6	1343981	1343986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017857	T	6	6	1344023	1344028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017857	GCAAT	2	10	1344030	1344039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3122	NC_017857	TTC	2	6	1344112	1344117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_017857	GTA	2	6	1344474	1344479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017857	AAT	2	6	1344482	1344487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017857	GCTG	2	8	1344595	1344602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_017857	TGT	3	9	1344622	1344630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017857	TGGG	2	8	1344665	1344672	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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