MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017857	CCA	2	6	3085302	3085307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_017857	CAC	2	6	3085315	3085320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_017857	A	6	6	3085373	3085378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017857	CAAG	2	8	3085391	3085398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_017857	A	7	7	3085431	3085437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017857	TTAA	2	8	3087765	3087772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017857	AGCGAA	2	12	3087789	3087800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7008	NC_017857	TAC	2	6	3089034	3089039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_017857	AGT	2	6	3091002	3091007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017857	CT	3	6	3091010	3091015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_017857	ATT	2	6	3094480	3094485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_017857	A	7	7	3094487	3094493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017857	TCT	2	6	3094503	3094508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_017857	GCA	2	6	3094871	3094876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_017857	A	6	6	3094882	3094887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017857	TCA	2	6	3094919	3094924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_017857	A	7	7	3094941	3094947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017857	TGA	2	6	3095799	3095804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017857	CATT	2	8	3095875	3095882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7020	NC_017857	CCTT	2	8	3095894	3095901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7021	NC_017857	CAC	2	6	3095934	3095939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_017857	ATT	2	6	3095993	3095998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017857	CTTA	2	8	3097135	3097142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7024	NC_017857	TCA	2	6	3098028	3098033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_017857	GAC	2	6	3098035	3098040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_017857	TAA	2	6	3099607	3099612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017857	TTAAA	2	10	3099686	3099695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017857	ATTT	2	8	3099706	3099713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017857	CAA	2	6	3099738	3099743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_017857	TTC	2	6	3099786	3099791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_017857	ATT	2	6	3101378	3101383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017857	A	6	6	3102179	3102184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017857	CAAA	2	8	3102191	3102198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7034	NC_017857	GTA	2	6	3102296	3102301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017857	A	6	6	3102308	3102313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017857	TTG	2	6	3102370	3102375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017857	TTTA	2	8	3102384	3102391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017857	CCAG	2	8	3102405	3102412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_017857	AATT	2	8	3102489	3102496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017857	GAAC	2	8	3102518	3102525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_017857	AAG	2	6	3102766	3102771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_017857	ATC	2	6	3102783	3102788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_017857	AATA	2	8	3103209	3103216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017857	AAC	2	6	3103249	3103254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_017857	AGAC	2	8	3103283	3103290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7046	NC_017857	CAC	2	6	3105298	3105303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7047	NC_017857	T	6	6	3105316	3105321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017857	CAG	2	6	3106009	3106014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_017857	CTA	2	6	3106037	3106042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_017857	ATG	2	6	3106377	3106382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017857	CTGG	2	8	3106786	3106793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7052	NC_017857	TAA	2	6	3106847	3106852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017857	AGG	2	6	3106886	3106891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017857	CAA	2	6	3107845	3107850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_017857	CAG	2	6	3107887	3107892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_017857	TTA	2	6	3107899	3107904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017857	TTG	2	6	3107919	3107924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017857	CCT	2	6	3110012	3110017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_017857	GTTT	2	8	3110080	3110087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_017857	TCTG	2	8	3110097	3110104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7061	NC_017857	TGAA	2	8	3110121	3110128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017857	AGT	2	6	3110169	3110174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017857	AACAG	2	10	3110206	3110215	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7064	NC_017857	CAA	2	6	3110223	3110228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_017857	AGC	2	6	3110348	3110353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7067	NC_017857	CAC	2	6	3110511	3110516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_017857	TCA	2	6	3112753	3112758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_017857	AATA	2	8	3112774	3112781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_017857	CAT	2	6	3112845	3112850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_017857	CTG	2	6	3112879	3112884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_017857	AG	3	6	3112944	3112949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_017857	A	7	7	3113035	3113041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_017857	T	7	7	3113058	3113064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_017857	TA	3	6	3113076	3113081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_017857	GATT	2	8	3115148	3115155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7078	NC_017857	C	6	6	3115209	3115214	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7079	NC_017857	CAG	2	6	3117012	3117017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_017857	GAC	2	6	3117908	3117913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_017857	CAC	2	6	3117917	3117922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7082	NC_017857	AAT	2	6	3118072	3118077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_017857	AT	3	6	3119424	3119429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_017857	AAT	2	6	3119472	3119477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_017857	TGA	2	6	3119557	3119562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7087	NC_017857	A	7	7	3119630	3119636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_017857	T	6	6	3120180	3120185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_017857	GACTC	2	10	3120268	3120277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7090	NC_017857	TTG	2	6	3120283	3120288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_017857	TTAC	2	8	3122425	3122432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_017857	CTG	2	6	3122444	3122449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7097	NC_017857	GCA	2	6	3122535	3122540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7099	NC_017857	CAG	3	9	3122782	3122790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_017857	TTG	2	6	3122863	3122868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_017857	GCC	2	6	3122874	3122879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_017857	C	7	7	3122946	3122952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7104	NC_017857	T	7	7	3123036	3123042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_017857	TGA	2	6	3123076	3123081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7108	NC_017857	GCA	2	6	3123158	3123163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_017857	GCCT	2	8	3123166	3123173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7110	NC_017857	ATC	2	6	3123439	3123444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_017857	ACC	2	6	3123446	3123451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_017857	AGT	2	6	3124759	3124764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_017857	AAT	2	6	3124767	3124772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_017857	TTG	2	6	3124806	3124811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_017857	TTA	2	6	3124847	3124852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7117	NC_017857	TAA	2	6	3126974	3126979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_017857	CTTA	2	8	3127030	3127037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7119	NC_017857	TAT	2	6	3127081	3127086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_017857	ATC	2	6	3127109	3127114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7122	NC_017857	TCT	2	6	3127156	3127161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_017857	CTT	2	6	3127165	3127170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7125	NC_017857	CAG	2	6	3127250	3127255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_017857	T	6	6	3127275	3127280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_017857	AAT	2	6	3127401	3127406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017857	TGGA	2	8	3127410	3127417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_017857	T	6	6	3127484	3127489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_017857	TTG	2	6	3127526	3127531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7132	NC_017857	T	6	6	3127593	3127598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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