MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017857	G	6	6	2396113	2396118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017857	TGCT	2	8	2396221	2396228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_017857	ATC	2	6	2396291	2396296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017857	GGC	2	6	2396324	2396329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_017857	AAT	2	6	2396340	2396345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017857	T	6	6	2396354	2396359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017857	TTCA	2	8	2403341	2403348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_017857	CAT	2	6	2405848	2405853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017857	GCTT	2	8	2407208	2407215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_017857	T	7	7	2407224	2407230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017857	GTTA	2	8	2407237	2407244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017857	TTG	2	6	2407292	2407297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017857	TTTG	2	8	2407314	2407321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017857	CCT	2	6	2407356	2407361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_017857	CAG	2	6	2407372	2407377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017857	TAA	2	6	2407390	2407395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017857	TTA	2	6	2407429	2407434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017857	CAA	2	6	2407490	2407495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017857	TTG	2	6	2407554	2407559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017857	T	6	6	2407578	2407583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017857	AAT	2	6	2407995	2408000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017857	CTT	2	6	2408023	2408028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_017857	CCA	2	6	2408061	2408066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_017857	GAG	2	6	2408155	2408160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017857	AGT	2	6	2408210	2408215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017857	C	7	7	2408235	2408241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5527	NC_017857	A	7	7	2408337	2408343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017857	CAT	2	6	2408350	2408355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017857	CGGC	2	8	2411629	2411636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_017857	TCA	2	6	2412768	2412773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_017857	A	6	6	2413599	2413604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017857	T	7	7	2413619	2413625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017857	AAT	2	6	2414818	2414823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017857	CGC	2	6	2414839	2414844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_017857	ATT	2	6	2414866	2414871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017857	TAG	2	6	2416172	2416177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017857	TGT	2	6	2421332	2421337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017857	T	6	6	2421356	2421361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017857	T	6	6	2421369	2421374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017857	CAATA	2	10	2421379	2421388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5541	NC_017857	TTGC	2	8	2421910	2421917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_017857	TTG	2	6	2427130	2427135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017857	AT	3	6	2429762	2429767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017857	T	6	6	2429774	2429779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017857	TAAA	2	8	2429806	2429813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017857	AGTT	2	8	2431414	2431421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017857	A	7	7	2431425	2431431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017857	CAT	2	6	2432194	2432199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017857	TCC	2	6	2434035	2434040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_017857	ATT	2	6	2435034	2435039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017857	T	7	7	2435051	2435057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017857	CAT	2	6	2435108	2435113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017857	AAT	2	6	2436037	2436042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017857	T	6	6	2436048	2436053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017857	TAT	2	6	2441153	2441158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017857	TAT	2	6	2447982	2447987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017857	CCA	2	6	2457737	2457742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_017857	TC	3	6	2458552	2458557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_017857	T	6	6	2459335	2459340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017857	ATCA	2	8	2459351	2459358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_017857	CAA	2	6	2462208	2462213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_017857	CAT	2	6	2462237	2462242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017857	ATT	2	6	2462263	2462268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017857	CTG	2	6	2462349	2462354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5567	NC_017857	AAG	2	6	2469416	2469421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017857	A	7	7	2469433	2469439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017857	T	6	6	2469457	2469462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017857	TTAA	2	8	2469471	2469478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017857	CAA	2	6	2472452	2472457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017857	A	6	6	2472499	2472504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017857	AT	3	6	2472530	2472535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017857	A	6	6	2472548	2472553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_017857	CGG	2	6	2477384	2477389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_017857	ATC	2	6	2480008	2480013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_017857	CTT	2	6	2483922	2483927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_017857	ACA	2	6	2483961	2483966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_017857	AAT	2	6	2484117	2484122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017857	A	7	7	2484146	2484152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017857	CTG	2	6	2484166	2484171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5594	NC_017857	TAT	2	6	2486480	2486485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017857	ATT	2	6	2486537	2486542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017857	CAA	2	6	2486549	2486554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_017857	ATT	2	6	2486569	2486574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_017857	TTG	2	6	2486684	2486689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017857	CCA	2	6	2486695	2486700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_017857	AGC	3	9	2486720	2486728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5602	NC_017857	G	6	6	2489354	2489359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017857	GAT	2	6	2489367	2489372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5605	NC_017857	T	7	7	2489397	2489403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017857	CAGT	2	8	2490416	2490423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_017857	AC	3	6	2490447	2490452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_017857	TAT	2	6	2491505	2491510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017857	GTT	2	6	2491527	2491532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5611	NC_017857	TA	3	6	2497171	2497176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017857	TAA	2	6	2498067	2498072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017857	CAA	2	6	2501441	2501446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_017857	TCG	2	6	2503164	2503169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_017857	TCA	2	6	2504808	2504813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5622	NC_017857	CAT	2	6	2512902	2512907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_017857	TGAAA	2	10	2512930	2512939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017857	TTTC	2	8	2512946	2512953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_017857	TTA	2	6	2513046	2513051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017857	ATT	2	6	2513058	2513063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017857	CT	4	8	2514115	2514122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_017857	ATT	2	6	2516869	2516874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_017857	AT	3	6	2516881	2516886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017857	TAC	2	6	2520321	2520326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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