MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017857	GTT	2	6	2185624	2185629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017857	TCG	2	6	2185716	2185721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017857	TTTA	2	8	2185722	2185729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017857	CTC	2	6	2185746	2185751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_017857	GGC	2	6	2185786	2185791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017857	TTATT	2	10	2187724	2187733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017857	CTA	2	6	2187780	2187785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017857	ATG	2	6	2188828	2188833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017857	AT	3	6	2188846	2188851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017857	GCA	2	6	2190627	2190632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017857	TTG	2	6	2190677	2190682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017857	ATCA	2	8	2190720	2190727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_017857	GAG	2	6	2190734	2190739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017857	A	6	6	2190791	2190796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017857	ATGG	2	8	2190807	2190814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017857	TAAA	2	8	2190873	2190880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017857	CGA	2	6	2190881	2190886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017857	CA	3	6	2190936	2190941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_017857	GCC	2	6	2190991	2190996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_017857	CAG	2	6	2191142	2191147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017857	TGG	2	6	2191148	2191153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017857	CAA	2	6	2191165	2191170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017857	CCA	2	6	2191201	2191206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_017857	TA	3	6	2191225	2191230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017857	ATT	2	6	2191285	2191290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017857	GTT	2	6	2191350	2191355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017857	AGC	2	6	2191369	2191374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017857	CAA	2	6	2191406	2191411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017857	A	7	7	2191466	2191472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017857	TAG	2	6	2191798	2191803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017857	TAAA	2	8	2195242	2195249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017857	GTG	2	6	2195266	2195271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017857	T	7	7	2195305	2195311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017857	CAT	2	6	2195354	2195359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017857	T	6	6	2195518	2195523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017857	ATATA	2	10	2195777	2195786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017857	AT	3	6	2195798	2195803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017857	AT	4	8	2196164	2196171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017857	CCA	2	6	2199380	2199385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_017857	CTG	2	6	2199386	2199391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017857	TG	3	6	2199591	2199596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017857	T	6	6	2200319	2200324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017857	TTA	2	6	2200334	2200339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017857	AT	4	8	2200415	2200422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017857	AGC	2	6	2200926	2200931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017857	CAGA	2	8	2200974	2200981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_017857	TTA	2	6	2200992	2200997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017857	CTT	2	6	2201015	2201020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017857	ATT	2	6	2201053	2201058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017857	GCG	2	6	2201083	2201088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_017857	TAT	2	6	2201096	2201101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017857	GAA	2	6	2201130	2201135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017857	ATTT	2	8	2202169	2202176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017857	TCCA	2	8	2202178	2202185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_017857	TGA	2	6	2202191	2202196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017857	TGT	2	6	2202214	2202219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017857	CAC	2	6	2202229	2202234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_017857	CAG	2	6	2202279	2202284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017857	TGA	2	6	2202291	2202296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017857	T	7	7	2202331	2202337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017857	TAA	2	6	2202409	2202414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017857	TC	3	6	2202470	2202475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_017857	TAT	2	6	2204951	2204956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017857	TTG	2	6	2204958	2204963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017857	CAGA	2	8	2204975	2204982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_017857	TC	3	6	2205454	2205459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_017857	CCA	2	6	2205484	2205489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_017857	CTG	2	6	2205490	2205495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017857	GGC	2	6	2205641	2205646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017857	CGCTAT	2	12	2205716	2205727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017857	CAT	2	6	2205760	2205765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017857	GC	3	6	2205772	2205777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_017857	GC	3	6	2205787	2205792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_017857	TCG	2	6	2205806	2205811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017857	TCCA	2	8	2205877	2205884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_017857	CTC	2	6	2205953	2205958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_017857	TTGA	2	8	2205964	2205971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017857	TGA	2	6	2206053	2206058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017857	GCC	2	6	2207875	2207880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_017857	GTC	2	6	2207929	2207934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017857	T	7	7	2207955	2207961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017857	ACC	2	6	2207983	2207988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_017857	ATAA	2	8	2208011	2208018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017857	AAT	2	6	2208075	2208080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017857	TAAC	2	8	2208683	2208690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_017857	A	6	6	2208728	2208733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017857	CCA	2	6	2208758	2208763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_017857	AAC	2	6	2208843	2208848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017857	AT	3	6	2208871	2208876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017857	ATAA	2	8	2208973	2208980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017857	TTGA	2	8	2209036	2209043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017857	T	6	6	2209672	2209677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017857	GTA	2	6	2209701	2209706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017857	GTT	2	6	2210096	2210101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017857	CGG	2	6	2210112	2210117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_017857	TCC	2	6	2210128	2210133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_017857	A	6	6	2210156	2210161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017857	T	6	6	2218395	2218400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017857	T	7	7	2219331	2219337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017857	GTT	2	6	2221421	2221426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017857	ATT	2	6	2221501	2221506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017857	CTT	2	6	2221573	2221578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017857	CTTG	2	8	2221583	2221590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_017857	CAA	2	6	2221643	2221648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017857	TATTTT	2	12	2221673	2221684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017857	GCC	2	6	2221723	2221728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_017857	CCA	2	6	2221731	2221736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_017857	GAC	2	6	2221741	2221746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_017857	CTT	2	6	2224266	2224271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017857	A	8	8	2224301	2224308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017857	AGTC	2	8	2226232	2226239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_017857	CCT	2	6	2228242	2228247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_017857	GCA	2	6	2230320	2230325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017857	TAT	2	6	2230375	2230380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017857	TAA	2	6	2230398	2230403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017857	ATCG	2	8	2230459	2230466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_017857	AATT	2	8	2231314	2231321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017857	AACA	2	8	2231340	2231347	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_017857	TAA	2	6	2231388	2231393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017857	ATTG	2	8	2232387	2232394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017857	TAT	2	6	2232401	2232406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017857	AAT	2	6	2232410	2232415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017857	GTT	2	6	2232427	2232432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017857	CAA	2	6	2232443	2232448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017857	TAA	2	6	2233469	2233474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017857	GTCCT	2	10	2233653	2233662	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5127	NC_017857	T	7	7	2233712	2233718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017857	CTG	2	6	2233748	2233753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017857	ACA	2	6	2233759	2233764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017857	AT	3	6	2233767	2233772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_017857	AGA	2	6	2233820	2233825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_017857	CTTTT	2	10	2286176	2286185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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