MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	AATT	2	8	5191	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017856	TGTC	2	8	14810	14817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017856	TGGT	2	8	30877	30884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017856	TTAC	2	8	30913	30920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017856	GATG	2	8	44488	44495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017856	CGGT	2	8	59460	59467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017856	TGTC	2	8	59648	59655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017856	ACAA	2	8	59675	59682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017856	AATT	2	8	60504	60511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017856	AATA	2	8	62464	62471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017856	ATTT	2	8	63260	63267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017856	ATTT	2	8	67450	67457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017856	GTCA	2	8	67661	67668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017856	TCAA	2	8	80514	80521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017856	CAAC	2	8	81817	81824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017856	GTCA	2	8	82626	82633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017856	TTCC	2	8	82634	82641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017856	AATA	2	8	84242	84249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017856	CGTT	2	8	84254	84261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017856	TTTA	2	8	84392	84399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017856	AAAC	2	8	84796	84803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017856	ATTA	2	8	87597	87604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017856	TTAT	2	8	89792	89799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017856	TAAA	2	8	89863	89870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017856	GCCG	2	8	99536	99543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017856	GTTG	2	8	103078	103085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017856	GATT	2	8	108387	108394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017856	GCTG	2	8	140880	140887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017856	TTTA	2	8	160239	160246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017856	CTGC	2	8	168550	168557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017856	CTGA	2	8	178844	178851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017856	ATTG	2	8	189960	189967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017856	GAAC	2	8	193682	193689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017856	CAGG	2	8	198786	198793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017856	ATTG	2	8	200041	200048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017856	CCGA	2	8	200098	200105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017856	CACT	2	8	207952	207959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017856	TTGC	2	8	218390	218397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017856	ATAG	2	8	223377	223384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017856	AATC	2	8	224984	224991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017856	ATTT	2	8	230432	230439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017856	TGAC	2	8	230459	230466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017856	AAAT	2	8	231345	231352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017856	TTCG	2	8	232760	232767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017856	AAGG	2	8	232801	232808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017856	AGCC	2	8	232952	232959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017856	ACTC	2	8	234147	234154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017856	ATTT	2	8	234762	234769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017856	AAAG	2	8	265722	265729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017856	GCCC	2	8	265740	265747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017856	TATT	2	8	267269	267276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017856	TTTA	2	8	267319	267326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017856	AATT	2	8	267383	267390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017856	CTTA	2	8	269501	269508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017856	CTGT	2	8	269519	269526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017856	TTTA	2	8	273756	273763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017856	ACTT	2	8	282809	282816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017856	CCAT	2	8	286646	286653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017856	ATTA	2	8	291571	291578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017856	CTGC	2	8	303830	303837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017856	TAAA	2	8	307546	307553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017856	CAGT	2	8	308416	308423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017856	AAAG	2	8	318431	318438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017856	CCCA	2	8	319117	319124	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017856	TGGG	2	8	325512	325519	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017856	ACAA	2	8	326718	326725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017856	TTGG	2	8	335423	335430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017856	GTGC	2	8	338804	338811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017856	ATTA	2	8	341378	341385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017856	GATG	2	8	348561	348568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017856	CAAA	2	8	352027	352034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017856	TGCC	2	8	355310	355317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017856	TTTA	2	8	357419	357426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017856	TGTC	2	8	360826	360833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017856	GCTT	2	8	369743	369750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017856	ATCT	2	8	371216	371223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017856	TTTA	2	8	371535	371542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017856	AATA	2	8	371543	371550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017856	GCCC	2	8	376375	376382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017856	AATT	2	8	381665	381672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017856	CTTT	2	8	412726	412733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017856	CAAA	2	8	414278	414285	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017856	CCAA	2	8	416550	416557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017856	GCAA	2	8	420630	420637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017856	CTTT	2	8	420693	420700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017856	AGCC	2	8	420812	420819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017856	TTGA	2	8	429296	429303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017856	TTGT	2	8	429611	429618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017856	ATGA	2	8	429633	429640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017856	TGTC	2	8	441725	441732	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017856	TGTT	2	8	444445	444452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017856	TAAA	2	8	444476	444483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017856	TAAA	2	8	446524	446531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017856	TTGA	2	8	452828	452835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017856	GATT	2	8	460988	460995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017856	TATG	2	8	461976	461983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017856	ACAA	2	8	462337	462344	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017856	TATT	2	8	463600	463607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017856	TTTA	2	8	463659	463666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017856	ATCA	2	8	469523	469530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017856	CAGT	2	8	495408	495415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017856	AGTT	2	8	495515	495522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017856	CAAT	2	8	497309	497316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017856	GTTC	2	8	499350	499357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017856	ACTT	2	8	501448	501455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017856	AGAT	2	8	507875	507882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017856	TGAA	2	8	511739	511746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017856	CCTA	2	8	516138	516145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017856	GCCA	2	8	516258	516265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017856	CGTG	2	8	521652	521659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017856	TTGA	2	8	544005	544012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017856	AGGG	2	8	544090	544097	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017856	GTTT	2	8	544948	544955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017856	TGTA	2	8	552213	552220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017856	GCTC	2	8	552229	552236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017856	ACTG	2	8	560509	560516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017856	AACC	2	8	560590	560597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017856	GCTT	2	8	560621	560628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017856	CCAA	2	8	560776	560783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017856	GCCT	2	8	561023	561030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017856	TTGA	2	8	561080	561087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017856	TAGA	2	8	572221	572228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017856	TCAT	2	8	579119	579126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017856	TACC	2	8	590956	590963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017856	TTAT	2	8	598671	598678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017856	AATC	2	8	598783	598790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017856	TAAT	2	8	598844	598851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017856	GCGA	2	8	600751	600758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017856	AAAC	2	8	600882	600889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017856	ATTA	2	8	600893	600900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017856	TTGA	2	8	603519	603526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017856	TGAC	2	8	606926	606933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017856	TCAA	2	8	609111	609118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017856	TGCT	2	8	609148	609155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017856	GAAC	2	8	623636	623643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017856	CGGA	2	8	623691	623698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017856	TTTG	2	8	623763	623770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017856	ATGG	2	8	630729	630736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017856	ATTT	2	8	638292	638299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017856	AATA	2	8	638491	638498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017856	GATT	2	8	641378	641385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017856	ATTT	2	8	641394	641401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017856	GATT	2	8	641411	641418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017856	ATCA	2	8	641441	641448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017856	ACAA	2	8	642121	642128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017856	CAGC	2	8	656998	657005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017856	CCTG	2	8	661349	661356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017856	TTTG	2	8	669433	669440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017856	TTGC	2	8	669803	669810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_017856	AGAT	2	8	683972	683979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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