MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 2308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	TGA	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017856	TGT	2	6	42	47	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017856	GGA	2	6	122	127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017856	GTG	2	6	8111	8116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017856	ATA	2	6	11910	11915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017856	GTA	2	6	14782	14787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017856	ACA	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017856	ACA	2	6	19937	19942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017856	GTC	2	6	19954	19959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017856	GAG	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017856	GTT	2	6	26602	26607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017856	GAA	2	6	30921	30926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017856	ATC	2	6	31141	31146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017856	GAT	2	6	31159	31164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017856	ACT	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017856	TAA	2	6	32231	32236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017856	AGT	2	6	32247	32252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017856	CTG	2	6	32305	32310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017856	CTG	2	6	32323	32328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017856	ATC	2	6	32467	32472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017856	CTT	2	6	32479	32484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017856	ATG	2	6	38257	38262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017856	TGT	2	6	42397	42402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017856	GGC	2	6	43599	43604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017856	GCA	2	6	50778	50783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017856	GTT	2	6	51817	51822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017856	ATT	2	6	51852	51857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017856	AAC	2	6	51898	51903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017856	ATC	2	6	53545	53550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017856	TGA	2	6	58520	58525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017856	CGG	2	6	59493	59498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017856	TGA	2	6	60431	60436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017856	TGA	2	6	62422	62427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017856	AAT	2	6	67399	67404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017856	TGC	2	6	67415	67420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017856	ATT	2	6	67494	67499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017856	AAT	2	6	67545	67550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017856	GAT	2	6	67594	67599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017856	CAC	2	6	67644	67649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017856	CAA	2	6	67674	67679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017856	AAT	2	6	68210	68215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017856	AAC	2	6	70680	70685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017856	AGC	2	6	70749	70754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017856	CCG	2	6	70769	70774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017856	TAT	2	6	70776	70781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017856	AAC	3	9	70788	70796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017856	ACC	2	6	70857	70862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017856	TTA	2	6	70880	70885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017856	AGG	2	6	70974	70979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017856	TAA	2	6	71002	71007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017856	TTA	2	6	71045	71050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017856	AAG	2	6	71238	71243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017856	ATA	2	6	71251	71256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017856	TAT	2	6	71303	71308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017856	ATC	2	6	71398	71403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017856	CAA	2	6	71469	71474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017856	TGG	2	6	71488	71493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017856	ATT	2	6	71494	71499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017856	AAC	2	6	75109	75114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017856	CAA	2	6	75898	75903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017856	TCT	2	6	79295	79300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017856	ATC	2	6	80317	80322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017856	CTT	2	6	80345	80350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017856	TAT	2	6	81836	81841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017856	ATT	2	6	82605	82610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017856	TTG	2	6	82718	82723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017856	ATA	2	6	82730	82735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017856	TAA	2	6	84163	84168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017856	GTG	2	6	84193	84198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017856	TTA	2	6	84429	84434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017856	GTC	2	6	84607	84612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017856	AGC	2	6	84789	84794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017856	AAT	2	6	87422	87427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017856	TTA	2	6	87444	87449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017856	TAC	2	6	87769	87774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017856	TCG	2	6	87806	87811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017856	GTT	2	6	89904	89909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017856	TTC	2	6	91264	91269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017856	AAC	2	6	91307	91312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017856	AAC	2	6	94962	94967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017856	CCG	2	6	99414	99419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017856	ATC	2	6	99461	99466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017856	TGA	2	6	99505	99510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017856	TTG	2	6	100504	100509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017856	CAT	2	6	102301	102306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017856	GAA	2	6	103046	103051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017856	GCC	2	6	105786	105791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017856	CGA	2	6	105827	105832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017856	CTG	2	6	112758	112763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017856	TTC	2	6	112768	112773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017856	ATT	2	6	114066	114071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017856	CTT	2	6	120674	120679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017856	TAA	3	9	120698	120706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017856	GCC	2	6	120771	120776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017856	TGC	2	6	120777	120782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017856	TAA	2	6	123390	123395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017856	ATG	2	6	123531	123536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017856	TTC	2	6	133824	133829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017856	TAA	2	6	134638	134643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017856	CGC	2	6	138742	138747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017856	ATG	2	6	138749	138754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017856	CGG	2	6	140646	140651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017856	TAT	2	6	140927	140932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017856	CTT	2	6	142145	142150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017856	TGA	2	6	142962	142967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017856	CAT	2	6	154888	154893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017856	CGA	2	6	156059	156064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017856	TAA	2	6	156065	156070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017856	CGC	2	6	156074	156079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017856	GCG	2	6	156085	156090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017856	GCT	2	6	156998	157003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017856	CGG	2	6	158124	158129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017856	TGG	2	6	161516	161521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017856	ACA	2	6	166120	166125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017856	GCA	2	6	166132	166137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017856	CGC	2	6	166764	166769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017856	CAT	2	6	166787	166792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017856	GAG	2	6	170258	170263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017856	CCT	2	6	174023	174028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017856	ATA	2	6	174037	174042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017856	CTG	2	6	176696	176701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017856	TTC	2	6	178763	178768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017856	AAC	2	6	178807	178812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017856	CGC	2	6	179049	179054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017856	CCA	2	6	179057	179062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017856	TCA	2	6	179111	179116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017856	TGT	2	6	179138	179143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017856	TCA	2	6	179684	179689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017856	CAT	2	6	181383	181388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017856	CAT	2	6	181593	181598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017856	GCC	2	6	181620	181625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017856	TTA	2	6	181712	181717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017856	CTG	2	6	181786	181791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017856	ATA	3	9	182947	182955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017856	AGC	2	6	185118	185123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017856	GCT	2	6	185134	185139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017856	GAT	2	6	189992	189997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017856	AGC	2	6	190036	190041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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