MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 8737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	A	7	7	4	10	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017527	AAG	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017527	AGA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017527	CAT	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017527	TCC	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017527	TTA	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017527	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017527	GCCA	2	8	3466	3473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017527	GCC	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017527	CCTTC	2	10	3519	3528	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017527	GTGAG	2	10	3537	3546	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017527	AGAGA	2	10	3553	3562	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017527	TA	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017527	CGG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017527	GCC	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017527	TCC	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017527	GGC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017527	CGT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017527	CGG	2	6	5098	5103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017527	AT	3	6	6244	6249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017527	TTG	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017527	T	6	6	6301	6306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017527	CCACC	2	10	7567	7576	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_017527	CCGG	2	8	7626	7633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017527	GGGCC	2	10	10733	10742	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017527	GGC	2	6	12194	12199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017527	GTC	2	6	12293	12298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017527	CGG	2	6	12300	12305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017527	TAA	2	6	15612	15617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017527	TTC	2	6	15637	15642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017527	CCGG	2	8	15659	15666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017527	TCA	2	6	15671	15676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017527	TAA	2	6	17775	17780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017527	CGG	2	6	17782	17787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017527	AGATC	2	10	18270	18279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017527	GA	3	6	19643	19648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017527	GA	3	6	22220	22225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017527	GAA	2	6	22260	22265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017527	GCC	2	6	22266	22271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017527	CGG	2	6	22286	22291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017527	C	6	6	22296	22301	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_017527	AGGG	2	8	23474	23481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017527	GGGC	2	8	23514	23521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017527	GGA	2	6	23553	23558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017527	ATATG	2	10	24176	24185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017527	AGA	2	6	24257	24262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017527	GAG	2	6	24281	24286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017527	TTA	2	6	24300	24305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017527	TCC	2	6	24314	24319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017527	ATC	2	6	25834	25839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017527	A	8	8	25861	25868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017527	AGA	2	6	25880	25885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017527	GAG	2	6	27702	27707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017527	ACC	2	6	30185	30190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017527	A	6	6	30262	30267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017527	G	7	7	31456	31462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017527	TGG	2	6	33461	33466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017527	G	6	6	33512	33517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017527	AGG	2	6	33552	33557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017527	GGA	2	6	33626	33631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017527	TCA	2	6	33703	33708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017527	GCC	3	9	35134	35142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017527	A	7	7	35143	35149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017527	GTC	2	6	35153	35158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017527	T	6	6	39166	39171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017527	ATG	2	6	39182	39187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017527	AAC	2	6	39201	39206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017527	AGA	2	6	39225	39230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017527	CGGAG	2	10	41585	41594	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017527	TTA	2	6	41625	41630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017527	ATT	2	6	41647	41652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017527	TTC	2	6	41760	41765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017527	ATT	2	6	41803	41808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017527	ATT	2	6	41816	41821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017527	TAT	2	6	41826	41831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017527	ATA	3	9	41876	41884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017527	TCG	2	6	41966	41971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017527	GCTG	2	8	41989	41996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017527	CGC	2	6	41997	42002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017527	CTT	2	6	42024	42029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017527	GAG	2	6	42035	42040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017527	GA	3	6	42060	42065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017527	CT	3	6	42149	42154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017527	CTA	2	6	42230	42235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017527	TCCC	2	8	42268	42275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_017527	GAA	2	6	42278	42283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017527	ATCCT	2	10	42338	42347	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017527	GA	3	6	42354	42359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017527	G	6	6	42395	42400	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017527	CGAT	2	8	42411	42418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017527	CGATCC	2	12	42424	42435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017527	C	7	7	42439	42445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_017527	CGT	2	6	42502	42507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017527	CAA	2	6	42519	42524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017527	GGA	2	6	42544	42549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017527	AGA	2	6	42630	42635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017527	GCG	2	6	42679	42684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017527	CGC	2	6	42689	42694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017527	ATA	2	6	45665	45670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017527	GCCC	2	8	48579	48586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_017527	ATC	2	6	48620	48625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017527	CCG	2	6	48668	48673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017527	AAG	2	6	48761	48766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017527	GCC	2	6	49124	49129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017527	CCT	2	6	49187	49192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017527	T	6	6	49742	49747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017527	GAT	2	6	53384	53389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017527	GCC	2	6	53459	53464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017527	AGA	2	6	53469	53474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017527	A	6	6	53511	53516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017527	TTC	2	6	53974	53979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017527	AT	3	6	53993	53998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017527	CCG	2	6	54008	54013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017527	G	7	7	54013	54019	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017527	AG	3	6	54030	54035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017527	GGA	2	6	54048	54053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017527	GCCC	2	8	54095	54102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_017527	GCC	2	6	54117	54122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017527	ATC	2	6	54535	54540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017527	AAGAG	2	10	56809	56818	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017527	GGCA	2	8	56821	56828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017527	GGCAG	2	10	59853	59862	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017527	GA	3	6	60986	60991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017527	GATC	2	8	60994	61001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017527	GGC	2	6	61094	61099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017527	AG	3	6	61116	61121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017527	CA	3	6	61167	61172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017527	GCT	2	6	61196	61201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017527	CAG	3	9	61232	61240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017527	GAC	2	6	61261	61266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017527	ATCT	2	8	61271	61278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017527	ACC	2	6	61293	61298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017527	ACT	2	6	61369	61374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017527	AGG	2	6	61486	61491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017527	AAC	2	6	62540	62545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017527	A	6	6	62577	62582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017527	AAT	2	6	63444	63449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017527	TTTAA	2	10	63461	63470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017527	GGT	2	6	65600	65605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017527	ATC	2	6	68905	68910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017527	A	6	6	69688	69693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017527	GAT	2	6	69712	69717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017527	GCCCG	2	10	69728	69737	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_017527	CTC	2	6	69742	69747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017527	AGA	2	6	69760	69765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017527	GA	3	6	69764	69769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017527	GTG	2	6	69794	69799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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