MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 8737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017527	CCG	2	6	148546	148551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_017527	GCC	2	6	148554	148559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017527	CGC	2	6	151887	151892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017527	TA	3	6	151983	151988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017527	AGTTG	2	10	152004	152013	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017527	AGA	2	6	152025	152030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017527	CCA	2	6	152047	152052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_017527	TGG	2	6	152090	152095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017527	AGA	2	6	152096	152101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017527	AAG	2	6	152119	152124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017527	TGG	2	6	152206	152211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017527	AGT	2	6	152628	152633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017527	ACA	2	6	153622	153627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017527	GA	3	6	153650	153655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017527	CAC	2	6	153660	153665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017527	CCGA	2	8	153669	153676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_017527	TCGC	2	8	153714	153721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017527	TAAGA	2	10	153750	153759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017527	TTC	2	6	155675	155680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017527	CTG	2	6	155687	155692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017527	CAG	2	6	155726	155731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017527	TCA	2	6	155761	155766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017527	GAA	2	6	155771	155776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017527	ACTA	2	8	155790	155797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_017527	CAC	2	6	155835	155840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_017527	GCC	2	6	155908	155913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_017527	GGA	2	6	155936	155941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017527	T	6	6	155955	155960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017527	GAAC	2	8	156053	156060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_017527	GGAT	2	8	156083	156090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017527	ATC	2	6	156091	156096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017527	ATG	2	6	156158	156163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017527	GTT	2	6	157510	157515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017527	TAC	2	6	157582	157587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017527	ATC	2	6	157921	157926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017527	AAG	2	6	157992	157997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017527	TAA	2	6	158000	158005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017527	TA	3	6	159549	159554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017527	GAT	2	6	159643	159648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017527	TTA	2	6	159667	159672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017527	TTGA	2	8	159685	159692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017527	CAA	2	6	159734	159739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017527	GCC	2	6	159846	159851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017527	CATT	2	8	159887	159894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_017527	A	8	8	159912	159919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017527	CAC	2	6	163310	163315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_017527	GGC	2	6	163337	163342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017527	TCT	2	6	163363	163368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017527	GCC	3	9	163472	163480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017527	TCC	2	6	163483	163488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_017527	CCG	2	6	164325	164330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017527	GGA	2	6	164335	164340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017527	TCC	2	6	164362	164367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_017527	CTC	2	6	164425	164430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017527	CCG	3	9	167148	167156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017527	AT	4	8	167189	167196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017527	TCG	2	6	167200	167205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017527	G	6	6	167205	167210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017527	CCG	3	9	167212	167220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_017527	TCC	2	6	167249	167254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_017527	TCC	2	6	167528	167533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_017527	AT	3	6	167575	167580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017527	GGA	2	6	167599	167604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017527	AGGG	2	8	167610	167617	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017527	TCC	2	6	167623	167628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017527	CCG	2	6	167629	167634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_017527	G	9	9	167634	167642	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017527	GAA	2	6	171412	171417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017527	C	6	6	171424	171429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
570	NC_017527	CGA	2	6	171606	171611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017527	C	6	6	171639	171644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
572	NC_017527	CCG	2	6	171687	171692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_017527	GCC	2	6	172349	172354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_017527	GATC	2	8	172358	172365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_017527	GCTCC	2	10	172373	172382	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
576	NC_017527	GGT	2	6	172455	172460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017527	GCT	2	6	173478	173483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017527	GATC	2	8	173575	173582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_017527	ATT	2	6	173592	173597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017527	ACGA	2	8	174694	174701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_017527	TCA	2	6	175464	175469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017527	CA	3	6	175468	175473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_017527	GCTG	2	8	175527	175534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_017527	AGG	2	6	175538	175543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017527	GCA	2	6	175561	175566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017527	CGT	2	6	175630	175635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017527	CCTT	2	8	180332	180339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_017527	CCG	3	9	180352	180360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017527	GAC	2	6	180366	180371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017527	AGG	3	9	180391	180399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017527	TCG	2	6	182996	183001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017527	GCG	2	6	183011	183016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017527	TCG	2	6	183033	183038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017527	CTCCGC	2	12	183045	183056	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_017527	CGA	2	6	183063	183068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017527	GAC	2	6	183145	183150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017527	GTG	2	6	183176	183181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017527	GATA	2	8	183187	183194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017527	CCT	2	6	183252	183257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_017527	GAG	3	9	183258	183266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017527	CGG	2	6	183277	183282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017527	GCC	2	6	183295	183300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_017527	GAT	2	6	184748	184753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017527	CCG	2	6	184782	184787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017527	GGC	2	6	184792	184797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017527	GGGCCT	2	12	184807	184818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017527	AGG	2	6	184839	184844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017527	CGGC	2	8	184971	184978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017527	GAG	3	9	185021	185029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017527	GTA	2	6	185075	185080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017527	C	7	7	185084	185090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
612	NC_017527	GCC	2	6	185091	185096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_017527	AGG	2	6	185115	185120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017527	CGCCCC	2	12	185138	185149	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
615	NC_017527	GGACCT	2	12	185186	185197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017527	AT	3	6	188697	188702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017527	ATCG	2	8	188753	188760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_017527	TCT	2	6	188791	188796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017527	GGT	2	6	188866	188871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017527	GGC	2	6	188932	188937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017527	AT	4	8	189135	189142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017527	GAA	2	6	189224	189229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017527	GC	3	6	189337	189342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_017527	CGT	2	6	189351	189356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017527	CTT	2	6	189358	189363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017527	GAT	2	6	189369	189374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017527	AG	3	6	189738	189743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017527	AG	3	6	190294	190299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017527	CAGG	2	8	190371	190378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
630	NC_017527	CTA	2	6	190411	190416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017527	CCA	2	6	190432	190437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_017527	CCA	2	6	190494	190499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_017527	TAC	2	6	190511	190516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017527	TTG	2	6	190572	190577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017527	ATT	2	6	190587	190592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017527	TA	3	6	190604	190609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017527	GAG	2	6	190673	190678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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