MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017524	C	6	6	23207	23212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_017524	G	6	6	33203	33208	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017524	G	6	6	34191	34196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017524	G	6	6	53500	53505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017524	C	6	6	53547	53552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_017524	G	6	6	130905	130910	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017524	C	7	7	191147	191153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_017524	G	6	6	230569	230574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017524	G	6	6	243038	243043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017524	C	6	6	286898	286903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017524	G	6	6	301475	301480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017524	G	6	6	336034	336039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017524	G	6	6	338993	338998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017524	G	7	7	366832	366838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017524	A	6	6	483494	483499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017524	C	6	6	506749	506754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_017524	C	6	6	629400	629405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_017524	A	6	6	771651	771656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017524	C	6	6	780610	780615	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_017524	A	7	7	794860	794866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017524	C	6	6	810244	810249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_017524	G	6	6	833983	833988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017524	A	6	6	835374	835379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017524	C	9	9	854735	854743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_017524	C	6	6	887586	887591	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_017524	G	6	6	904011	904016	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017524	C	7	7	911820	911826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017524	G	6	6	994255	994260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017524	G	7	7	1027335	1027341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017524	G	6	6	1124053	1124058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017524	G	6	6	1148433	1148438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017524	G	6	6	1152125	1152130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017524	T	6	6	1163954	1163959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017524	T	6	6	1173263	1173268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017524	A	6	6	1200919	1200924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017524	C	6	6	1215656	1215661	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_017524	T	6	6	1300635	1300640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017524	T	6	6	1336820	1336825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017524	T	6	6	1339207	1339212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017524	G	6	6	1354551	1354556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017524	C	6	6	1357613	1357618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_017524	G	6	6	1377315	1377320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017524	G	6	6	1413494	1413499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017524	G	6	6	1420715	1420720	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017524	C	6	6	1477012	1477017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017524	C	6	6	1477178	1477183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_017524	G	6	6	1563317	1563322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017524	G	6	6	1605236	1605241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017524	A	7	7	1729079	1729085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017524	C	6	6	1757875	1757880	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_017524	G	6	6	1797386	1797391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017524	T	6	6	1806034	1806039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017524	C	6	6	1819385	1819390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_017524	T	7	7	1843428	1843434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017524	C	7	7	1849960	1849966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_017524	C	6	6	1872937	1872942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_017524	C	6	6	1879432	1879437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_017524	C	6	6	1907638	1907643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_017524	G	6	6	1907679	1907684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017524	C	6	6	1907999	1908004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_017524	C	6	6	1914158	1914163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_017524	A	6	6	1926598	1926603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017524	G	6	6	1949958	1949963	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017524	C	6	6	1989785	1989790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_017524	C	6	6	1992056	1992061	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_017524	T	6	6	2020441	2020446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017524	C	6	6	2031845	2031850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_017524	C	6	6	2033446	2033451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_017524	T	7	7	2034968	2034974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017524	C	6	6	2049293	2049298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_017524	G	6	6	2144561	2144566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017524	G	6	6	2201200	2201205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017524	G	6	6	2211212	2211217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017524	G	7	7	2227812	2227818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017524	C	6	6	2266827	2266832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_017524	C	6	6	2356929	2356934	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_017524	C	6	6	2357139	2357144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_017524	T	6	6	2365306	2365311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017524	G	6	6	2367016	2367021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017524	C	6	6	2400551	2400556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_017524	C	6	6	2401336	2401341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_017524	T	6	6	2408179	2408184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017524	G	7	7	2437321	2437327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017524	G	7	7	2533649	2533655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017524	T	7	7	2562182	2562188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017524	G	6	6	2597004	2597009	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017524	G	6	6	2629397	2629402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017524	A	6	6	2630692	2630697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017524	C	6	6	2631616	2631621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_017524	A	6	6	2633850	2633855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017524	T	6	6	2643004	2643009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017524	C	6	6	2672201	2672206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_017524	C	6	6	2676331	2676336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_017524	G	6	6	2676910	2676915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017524	C	6	6	2688984	2688989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_017524	C	6	6	2694719	2694724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_017524	C	6	6	2755878	2755883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_017524	C	6	6	2790218	2790223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_017524	C	6	6	2879300	2879305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017524	C	6	6	2960294	2960299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_017524	C	7	7	2970103	2970109	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_017524	C	7	7	2993690	2993696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_017524	C	6	6	3108520	3108525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_017524	C	6	6	3170961	3170966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_017524	C	6	6	3210503	3210508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_017524	A	6	6	3239810	3239815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017524	C	6	6	3279034	3279039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_017524	C	6	6	3331911	3331916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_017524	A	6	6	3359488	3359493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017524	C	6	6	3373409	3373414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_017524	C	6	6	3375845	3375850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_017524	C	6	6	3383479	3383484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_017524	C	6	6	3410656	3410661	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_017524	C	6	6	3457622	3457627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_017524	G	6	6	3498391	3498396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017524	G	6	6	3563322	3563327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017524	C	6	6	3563424	3563429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_017524	G	7	7	3741406	3741412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017524	C	6	6	3765559	3765564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_017524	C	6	6	3841248	3841253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_017524	G	6	6	3870836	3870841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017524	C	6	6	3870847	3870852	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_017524	G	6	6	3870865	3870870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017524	G	6	6	3870876	3870881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017524	A	6	6	3872369	3872374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017524	C	6	6	3898342	3898347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_017524	C	6	6	3911758	3911763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_017524	C	6	6	3913169	3913174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_017524	C	7	7	4011888	4011894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_017524	T	7	7	4042057	4042063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017524	C	6	6	4084927	4084932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_017524	G	7	7	4086335	4086341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017524	G	6	6	4086372	4086377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017524	T	6	6	4108704	4108709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017524	T	6	6	4201897	4201902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017524	C	6	6	4304346	4304351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_017524	G	7	7	4310344	4310350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017524	C	6	6	4323567	4323572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_017524	A	6	6	4327150	4327155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017524	C	6	6	4327168	4327173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.