MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	ACCGCG	2	12	31089	31100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017524	CGTCGG	2	12	66737	66748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017524	CAACGG	2	12	76259	76270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017524	TCACCT	2	12	80425	80436	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017524	GCGGTG	2	12	104773	104784	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017524	CTCGGT	2	12	149405	149416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017524	GCCGCG	2	12	180688	180699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017524	ACAGCC	2	12	218235	218246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017524	CCCCGA	2	12	293386	293397	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017524	AGATTC	2	12	330118	330129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017524	GGTCGC	2	12	344640	344651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017524	CCGATA	2	12	476199	476210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017524	ATAGTC	2	12	542692	542703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017524	ACCAGT	2	12	590579	590590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017524	CGCCGT	2	12	719580	719591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017524	CGCGGG	2	12	830225	830236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017524	CCGGCG	2	12	863642	863653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017524	ACCGGG	2	12	870363	870374	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017524	GCGGCC	2	12	907253	907264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017524	ACAGCA	2	12	908626	908637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017524	CTGGGT	2	12	923465	923476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017524	CAGTCG	2	12	931074	931085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017524	TCGGGT	2	12	965986	965997	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017524	CAACGG	2	12	1029776	1029787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017524	GATCGA	2	12	1029827	1029838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017524	GACTGC	2	12	1034231	1034242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017524	CGCCGG	2	12	1053095	1053106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017524	GGCGCA	2	12	1094890	1094901	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017524	CAATGC	2	12	1124077	1124088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017524	TTGGTG	2	12	1152212	1152223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017524	TTCCGT	2	12	1162905	1162916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017524	TAGCCA	2	12	1196677	1196688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017524	AGTTAC	2	12	1222306	1222317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017524	AGGACG	2	12	1283299	1283310	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017524	AGGCCA	2	12	1341658	1341669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017524	TCGACA	2	12	1369108	1369119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017524	CCGAGT	2	12	1420186	1420197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017524	CACGCG	2	12	1525312	1525323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017524	ATATTC	2	12	1560331	1560342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017524	GCCCCT	2	12	1633784	1633795	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017524	GCCCCT	2	12	1637385	1637396	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017524	TGAACC	2	12	1694536	1694547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017524	CGAGTG	2	12	1781358	1781369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017524	GGCGCC	2	12	1827583	1827594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017524	GTGTTT	2	12	1880787	1880798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017524	CCGCGG	2	12	1892669	1892680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017524	TAGCGG	2	12	1919774	1919785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017524	ACCGCA	2	12	1921711	1921722	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017524	AGCGGC	2	12	2031901	2031912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017524	TCGGCG	2	12	2032004	2032015	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017524	TGCGGC	2	12	2032444	2032455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017524	GGTGAT	2	12	2035469	2035480	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017524	GCCGTC	2	12	2047132	2047143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017524	TTCGGC	2	12	2049378	2049389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017524	AGAGGG	2	12	2069542	2069553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017524	ACCGTG	2	12	2136016	2136027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017524	GCTGGG	2	12	2138647	2138658	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017524	CGCGAG	2	12	2170092	2170103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017524	CGGTTG	2	12	2224508	2224519	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017524	GCCGCA	2	12	2227413	2227424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017524	CGGCTC	2	12	2256726	2256737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017524	GGCGTC	2	12	2267325	2267336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017524	CCCTGA	2	12	2321298	2321309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017524	TGCACT	2	12	2338509	2338520	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017524	ATAGAA	2	12	2365555	2365566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017524	CTCAAC	2	12	2408071	2408082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017524	CCGCTG	2	12	2428674	2428685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017524	CACCGC	2	12	2437131	2437142	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017524	GCGTCG	2	12	2489446	2489457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017524	CACGAC	2	12	2507616	2507627	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017524	CTGCGC	2	12	2630410	2630421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017524	GCAACC	2	12	2630582	2630593	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017524	CACGTG	2	12	2711671	2711682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017524	GAGGTC	2	12	2715283	2715294	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017524	CCGGCA	2	12	2729334	2729345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017524	CGCCAC	2	12	2787523	2787534	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017524	TCAAAC	2	12	2789276	2789287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017524	GCACCC	2	12	2817298	2817309	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017524	CGACGG	2	12	2865578	2865589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017524	GCCCGA	2	12	2872673	2872684	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017524	GTATTG	2	12	2911109	2911120	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017524	CCGTTG	2	12	2921045	2921056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017524	GGCGCC	2	12	2940733	2940744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017524	CGGAAG	2	12	2948202	2948213	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017524	GTTCGG	2	12	2954955	2954966	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017524	CATATT	2	12	3008780	3008791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017524	CCGGCA	2	12	3072857	3072868	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017524	CGTTGC	2	12	3093871	3093882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017524	CATCGA	2	12	3116937	3116948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017524	CATCAC	2	12	3181050	3181061	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017524	TCGCCG	2	12	3287590	3287601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017524	CGCCAC	2	12	3303611	3303622	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017524	GGCCGG	2	12	3309310	3309321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017524	TCACCG	2	12	3310302	3310313	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017524	CACCGA	2	12	3373586	3373597	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017524	CGTAGG	2	12	3377613	3377624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017524	CGTGAC	2	12	3389363	3389374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017524	CGATGC	2	12	3411551	3411562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017524	TGTACA	2	12	3426811	3426822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017524	ACCAAC	2	12	3432160	3432171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017524	ACGCCG	2	12	3447594	3447605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017524	CCGTTG	2	12	3453190	3453201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017524	GCTCCT	2	12	3484922	3484933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017524	GTCGAC	2	12	3500185	3500196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017524	TCCGCT	2	12	3544155	3544166	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017524	GCCTCC	2	12	3634685	3634696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017524	ATCCAG	2	12	3678704	3678715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017524	TGTCGA	2	12	3694867	3694878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017524	TCAGTG	2	12	3709948	3709959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017524	TGCCGC	2	12	3736561	3736572	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017524	CGCAGC	2	12	3753806	3753817	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017524	GCGCAG	2	12	3776831	3776842	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017524	TGTACA	2	12	3796169	3796180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017524	CACGTT	2	12	3867027	3867038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017524	TCCTCT	2	12	3872325	3872336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017524	TCGGAG	2	12	3896607	3896618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017524	CCGCTC	2	12	3900636	3900647	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017524	CGTTGG	2	12	3913276	3913287	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017524	CGGCCG	2	12	3917416	3917427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017524	CGGCGA	2	12	3994112	3994123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017524	CGAACA	2	12	4001896	4001907	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017524	GGCGAG	2	12	4097719	4097730	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017524	GCGCCG	2	12	4138065	4138076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017524	TGGCGG	2	12	4186117	4186128	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017524	CTGCGG	2	12	4208800	4208811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017524	AACGCG	2	12	4209510	4209521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017524	CTCATC	2	12	4253658	4253669	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017524	GGGTTG	2	12	4310923	4310934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.