MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 6431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017524	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017524	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017524	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017524	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017524	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017524	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017524	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017524	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017524	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017524	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017524	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017524	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017524	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017524	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017524	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017524	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017524	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017524	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017524	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017524	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017524	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017524	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017524	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017524	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017524	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017524	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017524	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017524	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017524	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017524	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017524	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017524	CAC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017524	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017524	GAC	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017524	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017524	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017524	TCG	2	6	25476	25481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017524	CCG	2	6	25577	25582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017524	CTA	2	6	25612	25617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017524	TCC	2	6	25629	25634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017524	GTT	2	6	25636	25641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017524	TCG	3	9	25756	25764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017524	GCC	2	6	25770	25775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017524	AAC	2	6	26882	26887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017524	CGT	2	6	26900	26905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017524	CTT	2	6	26951	26956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017524	CCT	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017524	GTA	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017524	GCG	2	6	31083	31088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017524	CGG	2	6	31135	31140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017524	CAA	2	6	31170	31175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017524	GAG	2	6	31176	31181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017524	GGC	2	6	31873	31878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017524	TCG	2	6	31933	31938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017524	TGC	3	9	31942	31950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017524	CAC	2	6	32005	32010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017524	GAT	2	6	32034	32039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017524	TGG	2	6	33199	33204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017524	CGG	2	6	33914	33919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017524	GCG	2	6	33935	33940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017524	TGG	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017524	CGG	2	6	34067	34072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017524	GGT	2	6	34129	34134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017524	CCA	2	6	34151	34156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017524	TCA	2	6	38964	38969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017524	CAC	2	6	39831	39836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017524	TCG	2	6	39853	39858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017524	GCC	2	6	41227	41232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017524	GGT	2	6	41288	41293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017524	GAT	2	6	41296	41301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017524	CCG	3	9	41920	41928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017524	AGC	2	6	41939	41944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017524	GCC	2	6	42369	42374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017524	CGT	2	6	43404	43409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017524	GTG	2	6	43481	43486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017524	CGG	2	6	46480	46485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017524	CGC	2	6	46535	46540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017524	CGG	2	6	46547	46552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017524	GCT	2	6	47337	47342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017524	GTG	2	6	50001	50006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017524	CCT	2	6	51736	51741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017524	ACG	2	6	51767	51772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017524	ACA	2	6	51815	51820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017524	TAG	2	6	52707	52712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017524	CCG	2	6	52741	52746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017524	CAA	2	6	52755	52760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017524	GGT	2	6	52779	52784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017524	CGT	2	6	52793	52798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017524	GTC	2	6	53264	53269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017524	GCG	2	6	53272	53277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017524	CGA	2	6	53324	53329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017524	TCC	2	6	53344	53349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017524	CGC	2	6	53437	53442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017524	GAG	2	6	53454	53459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017524	GCC	2	6	53475	53480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017524	CCG	2	6	53493	53498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017524	TGG	2	6	53513	53518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017524	GCC	2	6	53537	53542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017524	TGC	2	6	57400	57405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017524	CGC	2	6	58027	58032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017524	TCG	2	6	58036	58041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017524	GGT	2	6	58064	58069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017524	CCT	2	6	58136	58141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017524	AGG	2	6	58174	58179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017524	TGA	2	6	58180	58185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017524	GAA	3	9	58537	58545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017524	GCC	2	6	58554	58559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017524	AGG	2	6	58576	58581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017524	ATG	2	6	63067	63072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017524	CGG	2	6	63105	63110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017524	CGT	2	6	63134	63139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017524	AGG	3	9	63897	63905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017524	TCG	2	6	64980	64985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017524	GCC	2	6	65534	65539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017524	GGT	2	6	66822	66827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017524	TGC	2	6	66860	66865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017524	CTG	2	6	68467	68472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017524	CTG	2	6	68486	68491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017524	GCC	3	9	68510	68518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017524	GCC	2	6	68533	68538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017524	TCG	2	6	68586	68591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017524	AGG	2	6	68610	68615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017524	CGG	2	6	71843	71848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017524	CGT	2	6	72288	72293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017524	GCG	2	6	74602	74607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017524	CGA	3	9	74658	74666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017524	GAG	2	6	75328	75333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017524	CGG	2	6	79018	79023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017524	CGA	2	6	79100	79105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017524	GCG	2	6	79165	79170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017524	CAT	2	6	79174	79179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017524	CGG	2	6	79244	79249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017524	GAG	2	6	79280	79285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017524	CGG	2	6	79486	79491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017524	GGC	2	6	79504	79509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017524	ACC	2	6	80223	80228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017524	GGC	2	6	80287	80292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017524	GCA	2	6	80309	80314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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