MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017524	TGG	2	6	4305326	4305331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017524	GTG	2	6	4305363	4305368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_017524	TGG	2	6	4305489	4305494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017524	GCA	2	6	4305512	4305517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_017524	ATC	2	6	4305545	4305550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_017524	CG	3	6	4305566	4305571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_017524	CGC	2	6	4305580	4305585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_017524	GAT	2	6	4305598	4305603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_017524	CCGG	2	8	4305612	4305619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_017524	CACG	2	8	4305658	4305665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9011	NC_017524	TGGG	2	8	4305675	4305682	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_017524	TCA	2	6	4305703	4305708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_017524	ACA	2	6	4305711	4305716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_017524	CAA	2	6	4305749	4305754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_017524	GCC	2	6	4306705	4306710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_017524	TTG	2	6	4306713	4306718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_017524	CGA	2	6	4306782	4306787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_017524	AC	5	10	4306920	4306929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_017524	CGA	2	6	4306958	4306963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_017524	AGC	2	6	4306973	4306978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_017524	GCA	2	6	4306997	4307002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_017524	ACA	2	6	4307003	4307008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_017524	ACGGC	2	10	4307011	4307020	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9024	NC_017524	AGC	2	6	4307021	4307026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_017524	CCG	2	6	4307125	4307130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9026	NC_017524	TCGG	2	8	4307221	4307228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9027	NC_017524	CCGG	2	8	4307290	4307297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9028	NC_017524	CCT	2	6	4307335	4307340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9029	NC_017524	CTT	3	9	4307384	4307392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_017524	CCCA	2	8	4307394	4307401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9031	NC_017524	CA	3	6	4307418	4307423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_017524	GTT	2	6	4307569	4307574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017524	AGCC	2	8	4307618	4307625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9034	NC_017524	CG	3	6	4307644	4307649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_017524	GAAG	2	8	4307678	4307685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_017524	ATTT	2	8	4308474	4308481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_017524	GCG	2	6	4309085	4309090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_017524	AGT	2	6	4309177	4309182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_017524	TCG	2	6	4309189	4309194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_017524	GTC	2	6	4309283	4309288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_017524	CG	3	6	4310256	4310261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9042	NC_017524	TCG	2	6	4310303	4310308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_017524	G	7	7	4310344	4310350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_017524	ATAC	2	8	4310439	4310446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9045	NC_017524	ACCG	2	8	4310895	4310902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_017524	GGGTTG	2	12	4310923	4310934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_017524	GGC	2	6	4310993	4310998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_017524	CGG	2	6	4311662	4311667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_017524	ATG	2	6	4312002	4312007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_017524	CGA	2	6	4312034	4312039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_017524	TGC	2	6	4312043	4312048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_017524	GTA	2	6	4314522	4314527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017524	TCGG	2	8	4315196	4315203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9054	NC_017524	GCC	2	6	4315353	4315358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_017524	GC	3	6	4316984	4316989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9056	NC_017524	CAG	2	6	4323087	4323092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_017524	GCC	2	6	4323105	4323110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_017524	GCA	2	6	4323218	4323223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_017524	CGG	2	6	4323320	4323325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_017524	ACCG	2	8	4323351	4323358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_017524	GCCA	2	8	4323421	4323428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_017524	AAC	2	6	4323497	4323502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_017524	CGG	2	6	4323511	4323516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_017524	TGT	2	6	4323524	4323529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_017524	GCC	2	6	4323541	4323546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9066	NC_017524	CGA	2	6	4323548	4323553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_017524	C	6	6	4323567	4323572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9068	NC_017524	CAGC	2	8	4323617	4323624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_017524	AGTC	2	8	4323625	4323632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9070	NC_017524	TCA	2	6	4323698	4323703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_017524	ATCG	2	8	4323740	4323747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9072	NC_017524	GAG	2	6	4323758	4323763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_017524	TCC	2	6	4325534	4325539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9074	NC_017524	CTGC	2	8	4325541	4325548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9075	NC_017524	TGC	2	6	4325556	4325561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_017524	GC	3	6	4325592	4325597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9077	NC_017524	CCG	2	6	4325599	4325604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9078	NC_017524	CGTCG	2	10	4325776	4325785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9079	NC_017524	CG	4	8	4327082	4327089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9080	NC_017524	A	6	6	4327150	4327155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_017524	C	6	6	4327168	4327173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9082	NC_017524	GCT	2	6	4327181	4327186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_017524	ATG	2	6	4327218	4327223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9085	NC_017524	AGG	2	6	4328540	4328545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_017524	CGA	2	6	4335724	4335729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_017524	GAG	3	9	4335746	4335754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_017524	CGA	2	6	4335777	4335782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_017524	GAG	3	9	4335799	4335807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_017524	GC	3	6	4335810	4335815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9091	NC_017524	ATT	2	6	4337593	4337598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_017524	GTTT	2	8	4337665	4337672	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_017524	AGGG	2	8	4337713	4337720	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_017524	AAG	2	6	4337721	4337726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_017524	GGAG	2	8	4338048	4338055	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_017524	ACA	2	6	4339183	4339188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_017524	AG	3	6	4339244	4339249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_017524	AGT	2	6	4339252	4339257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_017524	TGC	2	6	4343612	4343617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_017524	CGCA	2	8	4344550	4344557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9101	NC_017524	CG	3	6	4346898	4346903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_017524	ATG	2	6	4346905	4346910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_017524	GGT	2	6	4346932	4346937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_017524	GGT	2	6	4346978	4346983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_017524	AGCT	2	8	4347025	4347032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9106	NC_017524	GC	3	6	4347123	4347128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9107	NC_017524	GCG	2	6	4347143	4347148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_017524	ACC	2	6	4347170	4347175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9109	NC_017524	CAA	2	6	4347177	4347182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_017524	ATC	2	6	4348920	4348925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_017524	TCG	2	6	4348948	4348953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_017524	GCC	2	6	4348985	4348990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_017524	TG	3	6	4351823	4351828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_017524	AAC	2	6	4351853	4351858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_017524	CCG	2	6	4351879	4351884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9116	NC_017524	CGC	3	9	4353828	4353836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9117	NC_017524	GT	3	6	4353855	4353860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_017524	AGC	2	6	4360642	4360647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_017524	CG	3	6	4360667	4360672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_017524	CGGC	2	8	4360706	4360713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9122	NC_017524	GCC	2	6	4362698	4362703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_017524	GC	4	8	4362704	4362711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9124	NC_017524	GTC	2	6	4363066	4363071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_017524	CGC	2	6	4363101	4363106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9126	NC_017524	GGA	2	6	4363166	4363171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_017524	CG	3	6	4363174	4363179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9128	NC_017524	GC	3	6	4363228	4363233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9129	NC_017524	GACCA	2	10	4369875	4369884	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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9131	NC_017524	GCA	2	6	4371048	4371053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_017524	CGC	2	6	4371068	4371073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9133	NC_017524	AGC	2	6	4373316	4373321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9134	NC_017524	CGT	2	6	4373336	4373341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9135	NC_017524	CGC	2	6	4373830	4373835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9137	NC_017524	AC	3	6	4373921	4373926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9164	NC_017524	TCGG	2	8	4395302	4395309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9165	NC_017524	CACT	2	8	4397963	4397970	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9171	NC_017524	CAA	2	6	4398460	4398465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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