MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017524	GCG	2	6	3798642	3798647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017524	CTC	2	6	3801854	3801859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_017524	ATC	2	6	3801871	3801876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_017524	CG	3	6	3802633	3802638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_017524	CCG	2	6	3802650	3802655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_017524	TCG	3	9	3805506	3805514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_017524	CGG	2	6	3806449	3806454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_017524	CCT	2	6	3808699	3808704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_017524	TTAG	2	8	3809447	3809454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017524	CGG	2	6	3809473	3809478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_017524	GCC	2	6	3809550	3809555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_017524	CAGT	2	8	3811138	3811145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_017524	TCC	2	6	3812059	3812064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_017524	GCC	2	6	3814285	3814290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_017524	GAG	3	9	3817482	3817490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017524	GAG	3	9	3817539	3817547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017524	CCAG	2	8	3817557	3817564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_017524	GAG	3	9	3817655	3817663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017524	GGC	2	6	3817806	3817811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_017524	TCG	2	6	3819120	3819125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_017524	CAT	2	6	3819171	3819176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_017524	GCAC	2	8	3819257	3819264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_017524	GCC	2	6	3819328	3819333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_017524	GCG	2	6	3819381	3819386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_017524	AGC	2	6	3819393	3819398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_017524	CATT	2	8	3822481	3822488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_017524	TC	3	6	3825941	3825946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_017524	GC	3	6	3828764	3828769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_017524	GAA	2	6	3828785	3828790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017524	CGA	2	6	3828807	3828812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_017524	TCA	2	6	3831710	3831715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017524	TGG	2	6	3831725	3831730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017524	TTC	2	6	3831732	3831737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017524	CTTT	2	8	3831760	3831767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_017524	GCG	2	6	3831840	3831845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_017524	GGC	2	6	3831848	3831853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_017524	GCG	2	6	3831858	3831863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017524	CCACT	2	10	3831983	3831992	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8039	NC_017524	CG	3	6	3832007	3832012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_017524	AG	3	6	3832048	3832053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017524	CG	3	6	3832375	3832380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_017524	CTG	2	6	3832430	3832435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_017524	CTC	2	6	3834068	3834073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_017524	GCC	2	6	3834100	3834105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_017524	GTG	2	6	3834119	3834124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017524	CCGGA	2	10	3834505	3834514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8047	NC_017524	CGGT	2	8	3834520	3834527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8048	NC_017524	CGT	2	6	3834592	3834597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_017524	GGT	2	6	3838676	3838681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017524	ATG	2	6	3838726	3838731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017524	CGGC	2	8	3838755	3838762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_017524	GT	3	6	3838823	3838828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017524	CAG	2	6	3839349	3839354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_017524	ACA	2	6	3839370	3839375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_017524	TCA	2	6	3839380	3839385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_017524	AACA	2	8	3839402	3839409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8057	NC_017524	CGC	2	6	3841075	3841080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_017524	GC	3	6	3841160	3841165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_017524	CGC	2	6	3841223	3841228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_017524	GCC	2	6	3841238	3841243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_017524	C	6	6	3841248	3841253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8062	NC_017524	ACG	2	6	3841284	3841289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_017524	CGC	2	6	3841304	3841309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_017524	TCA	2	6	3841349	3841354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017524	CGC	2	6	3841388	3841393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_017524	CGA	2	6	3841441	3841446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017524	CAG	2	6	3842397	3842402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_017524	CCT	2	6	3842508	3842513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_017524	CGGAC	2	10	3842524	3842533	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8070	NC_017524	CGA	3	9	3842547	3842555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_017524	CCT	2	6	3842586	3842591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8072	NC_017524	TTG	2	6	3844019	3844024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8074	NC_017524	ATC	2	6	3847162	3847167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_017524	GCC	2	6	3847229	3847234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_017524	CGC	2	6	3852241	3852246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_017524	CGA	2	6	3853696	3853701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_017524	CA	3	6	3853705	3853710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_017524	CTT	2	6	3854646	3854651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_017524	TC	3	6	3854653	3854658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_017524	CGG	2	6	3854700	3854705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_017524	CGAC	2	8	3854717	3854724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_017524	AGC	2	6	3854761	3854766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_017524	CGA	2	6	3854771	3854776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_017524	TG	3	6	3854800	3854805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017524	CA	3	6	3854833	3854838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_017524	GC	3	6	3854849	3854854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_017524	CCG	2	6	3860512	3860517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_017524	GC	3	6	3864758	3864763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_017524	TTC	2	6	3864798	3864803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_017524	GCC	2	6	3866383	3866388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_017524	GCC	3	9	3866417	3866425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_017524	CCG	3	9	3866439	3866447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_017524	CGCC	2	8	3866491	3866498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8095	NC_017524	GC	3	6	3866501	3866506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8096	NC_017524	CCG	2	6	3866538	3866543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_017524	GGAAG	2	10	3866576	3866585	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017524	GAG	2	6	3866638	3866643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017524	CTA	2	6	3866991	3866996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_017524	CACGTT	2	12	3867027	3867038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_017524	TCT	2	6	3867041	3867046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_017524	TCT	2	6	3870759	3870764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_017524	GCG	2	6	3870809	3870814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8107	NC_017524	GGGTT	2	10	3870855	3870864	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017524	G	6	6	3870865	3870870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017524	G	6	6	3870876	3870881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017524	TCCTCT	2	12	3872325	3872336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_017524	A	6	6	3872369	3872374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017524	TCCG	2	8	3872399	3872406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_017524	CTC	3	9	3872490	3872498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_017524	TCG	2	6	3872519	3872524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8116	NC_017524	GGT	2	6	3872977	3872982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017524	ACCGC	2	10	3873045	3873054	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8118	NC_017524	GCG	2	6	3875729	3875734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_017524	TTG	2	6	3875736	3875741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017524	CAG	2	6	3877166	3877171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_017524	CGC	2	6	3877191	3877196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_017524	TGA	2	6	3879358	3879363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017524	CG	3	6	3879373	3879378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8124	NC_017524	CAC	2	6	3881590	3881595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_017524	CA	3	6	3881600	3881605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_017524	AC	3	6	3882146	3882151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_017524	CGA	2	6	3883010	3883015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_017524	GCCCG	2	10	3883026	3883035	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8129	NC_017524	TCCA	2	8	3883182	3883189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8131	NC_017524	CCG	2	6	3884673	3884678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8132	NC_017524	GTC	2	6	3884870	3884875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8134	NC_017524	GGCG	2	8	3884899	3884906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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