MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 12977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017523	TTAC	2	8	3520711	3520718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10502	NC_017523	AAT	2	6	3520754	3520759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_017523	AGT	2	6	3520807	3520812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_017523	TCG	2	6	3520824	3520829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_017523	GGC	2	6	3520832	3520837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_017523	CGT	2	6	3520859	3520864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_017523	GGC	2	6	3520898	3520903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_017523	ACC	2	6	3520911	3520916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10509	NC_017523	CTC	2	6	3520931	3520936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_017523	GTG	2	6	3520950	3520955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_017523	CCCG	2	8	3520963	3520970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10512	NC_017523	TCG	2	6	3521003	3521008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_017523	GTA	2	6	3521116	3521121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_017523	CGA	2	6	3521148	3521153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_017523	AGC	2	6	3521177	3521182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_017523	GCC	2	6	3521213	3521218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_017523	CCAT	2	8	3521251	3521258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10518	NC_017523	ACA	2	6	3521899	3521904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_017523	AGG	2	6	3521957	3521962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_017523	CGC	2	6	3524127	3524132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10521	NC_017523	GGC	2	6	3524152	3524157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_017523	GCCA	2	8	3524963	3524970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_017523	CAG	2	6	3524999	3525004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_017523	CG	3	6	3525018	3525023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10525	NC_017523	GCG	2	6	3525026	3525031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_017523	CGT	2	6	3525059	3525064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_017523	TGA	2	6	3525104	3525109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_017523	GC	3	6	3525110	3525115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10529	NC_017523	CG	3	6	3525132	3525137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10530	NC_017523	ACC	2	6	3526153	3526158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10531	NC_017523	CGC	2	6	3526185	3526190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_017523	TCC	2	6	3526191	3526196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10533	NC_017523	CACCG	2	10	3526239	3526248	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10534	NC_017523	GTC	2	6	3526781	3526786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_017523	CGC	2	6	3526792	3526797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10536	NC_017523	GGC	2	6	3526805	3526810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_017523	TCCGCT	2	12	3526842	3526853	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_017523	CGG	2	6	3526858	3526863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_017523	CGG	2	6	3526872	3526877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_017523	AGA	2	6	3526888	3526893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_017523	GAG	2	6	3526928	3526933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_017523	GACG	2	8	3526975	3526982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10543	NC_017523	GAC	2	6	3527081	3527086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_017523	AC	3	6	3527150	3527155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10545	NC_017523	ATC	2	6	3527217	3527222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_017523	TG	3	6	3527255	3527260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_017523	CGA	2	6	3527325	3527330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_017523	ATC	2	6	3528789	3528794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_017523	GGC	2	6	3528809	3528814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_017523	CG	3	6	3528861	3528866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10551	NC_017523	CCA	2	6	3528900	3528905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_017523	AAC	2	6	3529002	3529007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_017523	CT	3	6	3529056	3529061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10554	NC_017523	CGG	2	6	3529078	3529083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_017523	GTA	2	6	3529103	3529108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_017523	CGG	2	6	3529127	3529132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_017523	CGC	2	6	3529138	3529143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_017523	GGC	2	6	3529156	3529161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_017523	GC	3	6	3529184	3529189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_017523	CCGA	2	8	3529308	3529315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10561	NC_017523	TGCC	2	8	3529324	3529331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10562	NC_017523	CGCT	2	8	3529342	3529349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10563	NC_017523	TGG	2	6	3529387	3529392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_017523	CTT	2	6	3529418	3529423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_017523	TGA	2	6	3529984	3529989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_017523	GCG	2	6	3530400	3530405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_017523	CAGCG	2	10	3531023	3531032	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10568	NC_017523	TGA	2	6	3531061	3531066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_017523	TCGA	2	8	3531089	3531096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10570	NC_017523	GC	4	8	3531112	3531119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10571	NC_017523	TGCG	2	8	3531189	3531196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10572	NC_017523	ACG	3	9	3531200	3531208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_017523	GA	3	6	3531210	3531215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_017523	GTG	2	6	3531302	3531307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_017523	GGT	2	6	3531429	3531434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_017523	CGA	2	6	3531500	3531505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_017523	CCG	2	6	3531516	3531521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10578	NC_017523	CCA	2	6	3531522	3531527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10579	NC_017523	CCGG	2	8	3532256	3532263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10580	NC_017523	TCC	2	6	3532379	3532384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10581	NC_017523	TC	3	6	3532458	3532463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10582	NC_017523	CGGT	2	8	3532470	3532477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10583	NC_017523	CCG	2	6	3532504	3532509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10584	NC_017523	CCG	2	6	3532521	3532526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_017523	CTGTT	2	10	3532555	3532564	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10586	NC_017523	CAG	2	6	3532591	3532596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10588	NC_017523	GCA	2	6	3532683	3532688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_017523	TCA	2	6	3532710	3532715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10590	NC_017523	GTA	2	6	3532741	3532746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_017523	GGA	2	6	3532761	3532766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_017523	CACCG	2	10	3533140	3533149	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10593	NC_017523	CCT	2	6	3533205	3533210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10594	NC_017523	CCCG	2	8	3533219	3533226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10595	NC_017523	ACC	2	6	3533241	3533246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10596	NC_017523	GTT	2	6	3533305	3533310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_017523	TCG	2	6	3533319	3533324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_017523	CGC	2	6	3533354	3533359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_017523	GTCG	2	8	3533360	3533367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10600	NC_017523	TG	3	6	3533774	3533779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_017523	GCC	2	6	3533861	3533866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10602	NC_017523	GGC	2	6	3533891	3533896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_017523	CGG	2	6	3535209	3535214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_017523	ATGCA	2	10	3535224	3535233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10605	NC_017523	CGTCG	2	10	3535262	3535271	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10606	NC_017523	CGA	2	6	3535310	3535315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_017523	ACA	2	6	3535421	3535426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_017523	AGCGA	2	10	3535499	3535508	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10609	NC_017523	GCC	2	6	3535526	3535531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10610	NC_017523	ATC	2	6	3535578	3535583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_017523	GCC	2	6	3535657	3535662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10612	NC_017523	TGG	2	6	3535692	3535697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_017523	GGT	2	6	3535708	3535713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_017523	CGG	2	6	3535740	3535745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_017523	ACC	2	6	3537084	3537089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10616	NC_017523	AGT	2	6	3537202	3537207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_017523	GGC	2	6	3537243	3537248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_017523	GCC	2	6	3537257	3537262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10619	NC_017523	GAC	2	6	3537299	3537304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_017523	TGC	2	6	3537307	3537312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_017523	GCT	2	6	3537329	3537334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_017523	TCC	2	6	3537373	3537378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10623	NC_017523	CGG	2	6	3537379	3537384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_017523	GGCGC	2	10	3537415	3537424	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10625	NC_017523	CCA	2	6	3537449	3537454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10626	NC_017523	GC	3	6	3537501	3537506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10628	NC_017523	ACC	2	6	3537537	3537542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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