MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 12977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017523	GGTT	2	8	3326711	3326718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017523	CGT	2	6	3326848	3326853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_017523	TCG	2	6	3326889	3326894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_017523	TCG	2	6	3326957	3326962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017523	CGGCGT	2	12	3326982	3326993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_017523	TGA	2	6	3326997	3327002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_017523	ACC	2	6	3327048	3327053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_017523	GGTC	2	8	3327060	3327067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_017523	GCT	2	6	3327100	3327105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_017523	CGTCC	2	10	3327164	3327173	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10011	NC_017523	CGC	2	6	3327181	3327186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_017523	GCC	2	6	3327188	3327193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_017523	GCG	2	6	3327194	3327199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_017523	GTT	2	6	3327202	3327207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_017523	CGG	2	6	3327216	3327221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_017523	TGC	2	6	3327249	3327254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_017523	GGC	2	6	3327382	3327387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_017523	CAC	2	6	3327418	3327423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_017523	GGC	2	6	3327424	3327429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_017523	GT	3	6	3327456	3327461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_017523	GCT	2	6	3327496	3327501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_017523	ATC	2	6	3331614	3331619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_017523	GC	3	6	3331632	3331637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_017523	GGC	2	6	3331640	3331645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_017523	GCG	2	6	3331647	3331652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_017523	GAG	2	6	3331742	3331747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_017523	GCATG	2	10	3331941	3331950	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10028	NC_017523	CCA	2	6	3332036	3332041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_017523	GGAG	2	8	3332076	3332083	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_017523	GCG	2	6	3332099	3332104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_017523	CGA	2	6	3332151	3332156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017523	GCC	2	6	3332176	3332181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_017523	GGT	2	6	3332182	3332187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_017523	GC	3	6	3332188	3332193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_017523	GGT	2	6	3332200	3332205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_017523	GCG	2	6	3332228	3332233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_017523	CGC	2	6	3332258	3332263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_017523	CGAGTT	2	12	3332268	3332279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10039	NC_017523	GGT	2	6	3332281	3332286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017523	AGG	2	6	3332288	3332293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_017523	CGC	2	6	3334357	3334362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_017523	CTT	2	6	3334490	3334495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_017523	GTC	3	9	3334496	3334504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_017523	CGG	2	6	3334599	3334604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_017523	TC	3	6	3335667	3335672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_017523	TGT	2	6	3338048	3338053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017523	TGG	2	6	3338083	3338088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017523	A	6	6	3338094	3338099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_017523	CAGCT	2	10	3338107	3338116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10050	NC_017523	TAC	2	6	3338178	3338183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_017523	CA	3	6	3338233	3338238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_017523	CAG	2	6	3338242	3338247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_017523	CCA	2	6	3338344	3338349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_017523	GAT	2	6	3338358	3338363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017523	ATC	2	6	3339552	3339557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10058	NC_017523	CAC	2	6	3341417	3341422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_017523	GGT	2	6	3341431	3341436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_017523	TCG	2	6	3341454	3341459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_017523	ATCAC	2	10	3341472	3341481	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10062	NC_017523	CAT	2	6	3341482	3341487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_017523	TCT	2	6	3341502	3341507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10067	NC_017523	CAC	2	6	3341658	3341663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_017523	CGC	2	6	3341669	3341674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_017523	GTC	2	6	3341715	3341720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10072	NC_017523	TGG	2	6	3343709	3343714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10078	NC_017523	GCC	2	6	3344937	3344942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_017523	GGCAC	2	10	3346580	3346589	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10080	NC_017523	CGGG	2	8	3346599	3346606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10081	NC_017523	TGACGT	2	12	3346607	3346618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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10083	NC_017523	CG	3	6	3347586	3347591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_017523	CGG	2	6	3347988	3347993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10088	NC_017523	CTG	2	6	3350777	3350782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_017523	TGCGC	2	10	3351509	3351518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10090	NC_017523	GAC	2	6	3351519	3351524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10092	NC_017523	CG	3	6	3351547	3351552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_017523	TCGA	2	8	3351964	3351971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10094	NC_017523	ACCC	2	8	3353312	3353319	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10095	NC_017523	GTGCG	2	10	3353356	3353365	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10096	NC_017523	GCG	2	6	3353400	3353405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_017523	CCG	2	6	3353431	3353436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_017523	GGC	2	6	3353441	3353446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_017523	CAC	2	6	3353477	3353482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_017523	TCCT	2	8	3353489	3353496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_017523	TGT	2	6	3353541	3353546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10104	NC_017523	TCAGA	2	10	3354935	3354944	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10105	NC_017523	GGC	2	6	3356418	3356423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10107	NC_017523	CCA	3	9	3356474	3356482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10109	NC_017523	CGC	2	6	3356535	3356540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_017523	GCC	2	6	3356542	3356547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_017523	AGC	2	6	3356578	3356583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10113	NC_017523	TCCT	2	8	3356951	3356958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_017523	CA	3	6	3356966	3356971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_017523	ATT	2	6	3357006	3357011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10118	NC_017523	CCCCG	2	10	3357167	3357176	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10119	NC_017523	CGT	2	6	3357197	3357202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10121	NC_017523	AGC	2	6	3357236	3357241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_017523	GTG	2	6	3357277	3357282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017523	ACACC	2	10	3358673	3358682	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10124	NC_017523	GCG	2	6	3361039	3361044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_017523	GC	3	6	3361056	3361061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10126	NC_017523	GCA	2	6	3361073	3361078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_017523	CTGG	2	8	3361092	3361099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10128	NC_017523	C	6	6	3362970	3362975	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10149	NC_017523	CCG	2	6	3373139	3373144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10157	NC_017523	GGCC	2	8	3383950	3383957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10235	NC_017523	CCT	2	6	3406269	3406274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10239	NC_017523	ACC	2	6	3407870	3407875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10241	NC_017523	GCC	2	6	3411512	3411517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10242	NC_017523	ACCAAC	2	12	3411635	3411646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10243	NC_017523	CA	3	6	3412243	3412248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10244	NC_017523	CCA	2	6	3412668	3412673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10245	NC_017523	ACG	2	6	3418565	3418570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_017523	CGGC	2	8	3418574	3418581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10247	NC_017523	CAC	2	6	3421952	3421957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10248	NC_017523	CGCA	2	8	3422020	3422027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10249	NC_017523	GCC	2	6	3423235	3423240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10250	NC_017523	GC	3	6	3423241	3423246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_017523	CAC	2	6	3423325	3423330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10252	NC_017523	CCT	2	6	3424361	3424366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10253	NC_017523	TCC	2	6	3424416	3424421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_017523	CCA	2	6	3428827	3428832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10255	NC_017523	AG	3	6	3428844	3428849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_017523	TCG	2	6	3433285	3433290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10370	NC_017523	CGGCG	2	10	3463911	3463920	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10371	NC_017523	TGA	2	6	3463949	3463954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10373	NC_017523	GTAG	2	8	3463994	3464001	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10374	NC_017523	GTT	2	6	3464033	3464038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10375	NC_017523	AAC	2	6	3464044	3464049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10376	NC_017523	CGGT	2	8	3464512	3464519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10377	NC_017523	CTC	2	6	3464590	3464595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10380	NC_017523	CCG	2	6	3465033	3465038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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