MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma haemofelis Ohio2 chromosome

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017520	TTAA	2	8	1280	1287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017520	TCAA	2	8	5285	5292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017520	TACC	2	8	5300	5307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017520	CATT	2	8	5366	5373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017520	ATGC	2	8	17811	17818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017520	ATTT	2	8	17948	17955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017520	CCGA	2	8	55686	55693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017520	ATTT	2	8	55839	55846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017520	CTTA	2	8	70091	70098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017520	TCTT	2	8	73585	73592	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017520	TGCC	2	8	73869	73876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017520	TTAA	2	8	74063	74070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017520	CAAC	2	8	74125	74132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017520	AAAT	2	8	74182	74189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017520	AGAA	2	8	74508	74515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017520	AGGG	2	8	88057	88064	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017520	CCTT	2	8	113033	113040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017520	TAAA	2	8	113169	113176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017520	GTAG	2	8	113298	113305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017520	TCCC	2	8	113365	113372	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017520	TAAT	2	8	113725	113732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017520	CTAT	2	8	115754	115761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017520	ACAT	2	8	115965	115972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017520	TCCT	2	8	116626	116633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017520	CTAG	2	8	116662	116669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017520	CCTA	2	8	116989	116996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017520	ATGG	2	8	117754	117761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017520	CTTC	2	8	118049	118056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017520	ATCT	2	8	118184	118191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017520	AACT	2	8	118293	118300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017520	TACA	2	8	118330	118337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017520	TCCA	2	8	118727	118734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017520	GATT	2	8	119586	119593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017520	CTAA	2	8	120652	120659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017520	ATTC	2	8	120825	120832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017520	AGAT	2	8	120968	120975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017520	TCTG	2	8	121026	121033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017520	TATT	2	8	121043	121050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017520	CTTC	2	8	121325	121332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017520	GGTA	2	8	155599	155606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017520	AGAT	2	8	155689	155696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017520	TCCC	2	8	155708	155715	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017520	TGGA	2	8	157467	157474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017520	GTCC	2	8	157843	157850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017520	CCTT	2	8	157899	157906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017520	TTAC	2	8	157943	157950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017520	TATG	2	8	158356	158363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017520	ATAA	2	8	160344	160351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017520	TTTA	2	8	160933	160940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017520	CTTT	2	8	166808	166815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017520	TTAG	2	8	167008	167015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017520	CTTC	2	8	167194	167201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017520	TATC	2	8	176131	176138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017520	TAAA	2	8	176141	176148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017520	ATTC	2	8	176183	176190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017520	GTAG	2	8	180808	180815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017520	TAAA	2	8	183488	183495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017520	GTAG	2	8	183572	183579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017520	CTTT	2	8	185348	185355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017520	TTAT	2	8	185490	185497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017520	AAAC	2	8	187987	187994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017520	GGTA	2	8	188309	188316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017520	AGTA	2	8	188627	188634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017520	TTAC	2	8	199676	199683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017520	GGAA	2	8	211455	211462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017520	TATT	2	8	211990	211997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017520	ATTC	2	8	212485	212492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017520	GAAG	2	8	212654	212661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017520	CTTC	2	8	212963	212970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017520	TGAA	2	8	213265	213272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017520	CCTT	2	8	213413	213420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017520	TAAG	2	8	215732	215739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017520	CTAG	2	8	223146	223153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017520	TTAA	3	12	223308	223319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017520	AAAG	2	8	223954	223961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017520	AAAG	2	8	224027	224034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017520	TTTA	2	8	224124	224131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017520	TCTT	2	8	224507	224514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017520	TAGA	2	8	224526	224533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017520	CTTC	2	8	224547	224554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017520	TAAG	2	8	224595	224602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017520	TTTC	2	8	224890	224897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017520	GGAA	2	8	228084	228091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017520	GACA	2	8	230163	230170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017520	GCTT	2	8	230287	230294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017520	ATGA	2	8	235634	235641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017520	ACCC	2	8	236686	236693	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017520	CTTT	2	8	248124	248131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017520	AAGA	2	8	248598	248605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017520	GTTA	2	8	256467	256474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017520	AATT	2	8	258698	258705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017520	AGTA	2	8	275747	275754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017520	TGGA	2	8	275924	275931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017520	GTTA	2	8	281582	281589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017520	CTTC	2	8	289446	289453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017520	CCCT	2	8	289679	289686	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_017520	TTGC	2	8	289781	289788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017520	TATT	2	8	289801	289808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017520	AAAG	2	8	289942	289949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017520	CTTT	2	8	298063	298070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017520	CTTT	2	8	303656	303663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017520	TTCT	2	8	303951	303958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017520	CTGA	2	8	310445	310452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017520	TTCT	2	8	318032	318039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017520	CTTT	2	8	318119	318126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017520	ATAG	2	8	321434	321441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017520	ATTC	2	8	321493	321500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017520	AATT	2	8	323834	323841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017520	ATTT	2	8	324426	324433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017520	AGAT	2	8	324499	324506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017520	ATCT	2	8	332625	332632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017520	AAAT	2	8	332698	332705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017520	TAGT	2	8	336497	336504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017520	ATTT	2	8	336549	336556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017520	GGAA	2	8	346787	346794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017520	TACT	2	8	353030	353037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017520	CTTT	2	8	376647	376654	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017520	ATTA	2	8	389867	389874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017520	TTAA	2	8	394907	394914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017520	TAAA	2	8	395005	395012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017520	TTAA	2	8	399271	399278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017520	GGTA	2	8	402389	402396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017520	AAAG	2	8	403213	403220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017520	TATG	2	8	407562	407569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017520	GGTG	2	8	416179	416186	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017520	AAGA	2	8	416335	416342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017520	GTTT	2	8	418962	418969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017520	AATG	2	8	430896	430903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017520	ATCT	2	8	433139	433146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017520	GTTT	2	8	435452	435459	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017520	CCTT	2	8	446157	446164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017520	TTCT	2	8	449613	449620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017520	CTTA	2	8	452895	452902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017520	CCCT	2	8	466514	466521	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_017520	GGGA	2	8	474047	474054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017520	AAGT	2	8	474057	474064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017520	AATG	2	8	475797	475804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017520	ATCC	2	8	476834	476841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017520	GGCT	2	8	480798	480805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017520	AAAG	2	8	481206	481213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017520	TTGA	2	8	494415	494422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017520	TCCA	2	8	496385	496392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017520	TCTT	2	8	496516	496523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017520	GAAA	2	8	497013	497020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017520	ATTT	2	8	497034	497041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017520	TAAA	2	8	498673	498680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017520	AAAT	2	8	498725	498732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017520	TGTC	2	8	499755	499762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017520	AATT	2	8	499776	499783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017520	ACTT	2	8	500735	500742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017520	ATAG	2	8	513247	513254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_017520	AATG	2	8	1054361	1054368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017520	GCTA	2	8	1054378	1054385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
301	NC_017520	CTAA	2	8	1066491	1066498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
302	NC_017520	TAAA	2	8	1067063	1067070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017520	ATTA	2	8	1067342	1067349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017520	AAAC	2	8	1083737	1083744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
305	NC_017520	AGCA	2	8	1091511	1091518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
306	NC_017520	AGAT	2	8	1099920	1099927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017520	CCTT	2	8	1100863	1100870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
308	NC_017520	TAAG	2	8	1141991	1141998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017520	AAGG	2	8	1142029	1142036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_017520	AAAT	2	8	1151382	1151389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.