MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	CCAT	2	8	1506	1513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017519	GAAA	2	8	2338	2345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017519	TTTA	2	8	4165	4172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017519	TTTA	2	8	4636	4643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017519	AAAT	2	8	4697	4704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017519	TAAA	2	8	4756	4763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017519	GATT	2	8	5357	5364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017519	AAAC	2	8	5375	5382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017519	ATTT	2	8	5760	5767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017519	ATAA	2	8	5770	5777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017519	AAAC	2	8	7124	7131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017519	AGAA	2	8	7925	7932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017519	AAAT	2	8	15582	15589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017519	AAAG	2	8	31582	31589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017519	TAAA	2	8	35922	35929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017519	AATT	2	8	37126	37133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017519	TAAC	2	8	38601	38608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017519	TAAA	2	8	40342	40349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017519	ATTA	2	8	40506	40513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017519	ATTT	2	8	40574	40581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017519	TAAA	2	8	40664	40671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017519	TAAA	2	8	41241	41248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017519	AATT	2	8	41532	41539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017519	TTAA	2	8	42263	42270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017519	TTAT	3	12	42305	42316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017519	CTAA	2	8	43660	43667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017519	TATT	4	16	43752	43767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017519	TATT	2	8	43840	43847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017519	TAAT	2	8	43852	43859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017519	TAAT	2	8	43870	43877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017519	TAAA	2	8	44043	44050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017519	AATT	2	8	47862	47869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017519	AGAC	2	8	48178	48185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017519	ATCA	2	8	48286	48293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017519	TAAT	2	8	48349	48356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017519	TATT	2	8	48874	48881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017519	CAAA	2	8	49153	49160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017519	GAAA	2	8	49545	49552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017519	GTTT	2	8	57408	57415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017519	TCTT	2	8	58663	58670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017519	ATAA	2	8	64851	64858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017519	TAAT	2	8	74837	74844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017519	TTGA	2	8	76410	76417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017519	CATT	2	8	76425	76432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017519	TATG	2	8	76523	76530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017519	AAAT	2	8	78745	78752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017519	TCTT	2	8	86501	86508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017519	AATA	2	8	88764	88771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017519	TTTA	2	8	88916	88923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017519	TAAA	2	8	103370	103377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017519	ATTT	2	8	103409	103416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017519	CTTT	2	8	103429	103436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017519	TAAG	2	8	103521	103528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017519	TAAA	2	8	107816	107823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017519	AATT	2	8	113092	113099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017519	TTTA	2	8	119112	119119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017519	TAAA	2	8	119126	119133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017519	TTTA	2	8	121301	121308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017519	ACAA	2	8	121840	121847	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017519	CTTC	2	8	121878	121885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017519	CAAA	2	8	122487	122494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017519	CAAA	2	8	122554	122561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017519	TAAA	2	8	123259	123266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017519	AACA	2	8	125102	125109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017519	TAAA	2	8	125117	125124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017519	AATT	3	12	125170	125181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017519	TAAA	2	8	125187	125194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017519	AATA	2	8	125664	125671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017519	CTTT	2	8	126259	126266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017519	ATTT	2	8	126272	126279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017519	ATTT	2	8	126311	126318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017519	TTGT	2	8	129603	129610	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017519	ATTT	2	8	129627	129634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017519	GAAT	2	8	134969	134976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017519	TTAA	2	8	136184	136191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017519	TAAA	2	8	136347	136354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017519	AATT	2	8	136432	136439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017519	ATAA	2	8	145971	145978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017519	AACA	2	8	149376	149383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017519	AGTT	2	8	149413	149420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017519	TAAT	2	8	153046	153053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017519	TTTA	2	8	156858	156865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	GTTT	2	8	157279	157286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017519	TATT	2	8	163714	163721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017519	AAAC	2	8	163811	163818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017519	TTAA	2	8	164500	164507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017519	AAAG	2	8	164971	164978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017519	TTGT	2	8	165120	165127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017519	TATT	2	8	175867	175874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017519	TAAA	2	8	178356	178363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017519	AAAG	2	8	178364	178371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017519	AATT	2	8	182153	182160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017519	CAAG	2	8	182331	182338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017519	TTTA	2	8	184822	184829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017519	AAAG	2	8	198327	198334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017519	TATT	2	8	198442	198449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017519	TTTA	2	8	200480	200487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017519	TATT	2	8	203234	203241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017519	TTAA	2	8	203263	203270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017519	TAAA	2	8	206472	206479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017519	TTTG	2	8	207773	207780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017519	AAAC	2	8	209120	209127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017519	AAAG	2	8	209292	209299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017519	TTGT	2	8	209302	209309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017519	TGAT	2	8	209314	209321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017519	AAAG	2	8	210020	210027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017519	GATT	2	8	210071	210078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017519	TAAT	2	8	210464	210471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017519	TACA	2	8	211199	211206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017519	ATGG	2	8	211313	211320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017519	AGAA	2	8	213081	213088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017519	TATT	2	8	232965	232972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017519	CATT	2	8	233036	233043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017519	TAAT	2	8	233052	233059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017519	TAAA	2	8	246846	246853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017519	GATT	2	8	248489	248496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017519	TAAA	2	8	248558	248565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017519	ATTT	2	8	250019	250026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017519	TTGA	2	8	250810	250817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017519	AATT	2	8	250971	250978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017519	ACTT	2	8	251660	251667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017519	TAAA	2	8	258022	258029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017519	TATT	2	8	258090	258097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017519	AATT	2	8	258145	258152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017519	TAAA	2	8	259756	259763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017519	TCAA	2	8	260780	260787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017519	ATTT	2	8	261373	261380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017519	AATA	2	8	263052	263059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017519	TTAA	2	8	263832	263839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017519	AATT	2	8	264092	264099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017519	TAAT	2	8	264424	264431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017519	AAAT	2	8	264434	264441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017519	TAAT	2	8	264480	264487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017519	TTTA	2	8	264501	264508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017519	ATAG	2	8	266050	266057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017519	CATA	2	8	266101	266108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017519	CATA	2	8	266118	266125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017519	TAAA	2	8	266576	266583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017519	TCTT	2	8	266607	266614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017519	TAAA	3	12	266726	266737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017519	ATTA	2	8	266771	266778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017519	TAAA	2	8	267030	267037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017519	ATTT	2	8	267251	267258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017519	AATT	2	8	267452	267459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017519	AATT	2	8	267695	267702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017519	AATC	2	8	268075	268082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017519	ATTA	2	8	269216	269223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017519	TAAA	2	8	277301	277308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017519	ATTT	2	8	294841	294848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017519	ACAG	2	8	295050	295057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017519	AATT	2	8	305305	305312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017519	ATTT	2	8	307348	307355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.