MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 454

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	TAAA	2	8	1491	1498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017509	CTTT	2	8	7916	7923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017509	CAAA	2	8	7927	7934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017509	TAAA	2	8	8926	8933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017509	ATTT	2	8	8951	8958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017509	TAAT	2	8	16893	16900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017509	ATTA	2	8	17445	17452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017509	ACCA	2	8	17465	17472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017509	TTAA	2	8	19918	19925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017509	ATTA	2	8	22928	22935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017509	TTGT	2	8	23128	23135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017509	TGTT	2	8	23194	23201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017509	TTAC	2	8	23538	23545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017509	GGTT	2	8	24377	24384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017509	AATT	2	8	24778	24785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017509	ATTA	2	8	25867	25874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017509	AAAT	2	8	25953	25960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017509	TTAT	2	8	26613	26620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017509	TAAG	2	8	29657	29664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017509	ATTT	2	8	29730	29737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017509	AATT	2	8	36250	36257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017509	AGTA	2	8	39428	39435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017509	AACC	2	8	40127	40134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017509	AATC	2	8	40137	40144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017509	TTAG	2	8	40175	40182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017509	ATTT	2	8	47638	47645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017509	AATC	2	8	53625	53632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017509	AATA	2	8	59536	59543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017509	AATT	2	8	60736	60743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017509	TCTT	2	8	70311	70318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017509	AAAT	2	8	80507	80514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017509	TATT	2	8	89623	89630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017509	AATT	2	8	89863	89870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017509	ATAA	2	8	94529	94536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017509	AATT	2	8	94626	94633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017509	ATTT	2	8	96256	96263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017509	ATTT	2	8	103726	103733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017509	CTAC	2	8	103882	103889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017509	AAAT	2	8	104788	104795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017509	GAAT	2	8	109667	109674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017509	TTTA	2	8	110104	110111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017509	AAAC	2	8	110205	110212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017509	ATGT	2	8	111232	111239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017509	ATTT	2	8	111322	111329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017509	TAAA	2	8	116702	116709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017509	AAAG	2	8	116824	116831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017509	AAAT	2	8	119828	119835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017509	TTAA	2	8	119838	119845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017509	GTTT	2	8	120509	120516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017509	ATTA	2	8	120563	120570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017509	CATC	2	8	120738	120745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017509	TTAA	2	8	120850	120857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017509	AAAT	2	8	131467	131474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017509	TTAA	2	8	132435	132442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017509	TTTA	2	8	133030	133037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017509	AAAC	2	8	133153	133160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017509	TGAT	2	8	133210	133217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017509	CCAA	2	8	133762	133769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017509	AAAT	2	8	133770	133777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017509	TTCC	2	8	133829	133836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017509	AATT	2	8	134169	134176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017509	TATT	2	8	134939	134946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017509	TTTA	2	8	135460	135467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017509	CTTG	2	8	135698	135705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017509	ATAA	2	8	135812	135819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017509	AATT	2	8	136111	136118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017509	AAAT	2	8	139516	139523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017509	ATTT	2	8	139607	139614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017509	ATTT	2	8	139750	139757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017509	TAAA	2	8	139782	139789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017509	GAGT	2	8	140823	140830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017509	GTTC	2	8	140859	140866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017509	TAAA	2	8	147951	147958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017509	TAAA	2	8	153775	153782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017509	TTCG	2	8	156013	156020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017509	ATTA	2	8	156554	156561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017509	AATT	2	8	156563	156570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017509	TTCA	2	8	162602	162609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017509	TAAA	2	8	168170	168177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017509	AAAT	2	8	168236	168243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017509	TAAA	2	8	168296	168303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017509	ATTA	2	8	168517	168524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017509	TAAT	2	8	177485	177492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017509	TTAA	2	8	186835	186842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017509	ATTA	2	8	189757	189764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017509	ATTA	2	8	190823	190830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017509	CTAA	2	8	190870	190877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017509	AATT	2	8	194670	194677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017509	ACAA	2	8	196287	196294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017509	AAAG	2	8	197266	197273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017509	ATTA	2	8	199697	199704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017509	TTGT	2	8	199745	199752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017509	TAAA	2	8	199938	199945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017509	TACT	2	8	200172	200179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017509	ATTA	2	8	202066	202073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017509	TTGT	2	8	202114	202121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017509	TTAA	2	8	202193	202200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017509	ACAT	2	8	202247	202254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017509	TTAT	2	8	202690	202697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	TTAA	2	8	205089	205096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017509	ATTA	2	8	207250	207257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017509	GCAG	2	8	208479	208486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017509	TAAT	2	8	210411	210418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017509	TAAT	2	8	214265	214272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017509	TAAT	2	8	214275	214282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017509	TTTG	2	8	214404	214411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017509	TAAA	2	8	221662	221669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017509	ATTT	2	8	238101	238108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017509	TTAA	2	8	238167	238174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017509	TAAA	2	8	253695	253702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017509	TAAT	2	8	253905	253912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017509	TAAA	2	8	253950	253957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017509	AACT	2	8	254136	254143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017509	TATT	2	8	254198	254205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017509	TAAA	2	8	254237	254244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017509	AAAT	2	8	254313	254320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017509	TAAT	2	8	263666	263673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017509	AAGG	2	8	263700	263707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017509	AAAT	2	8	271541	271548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017509	AAAT	2	8	271765	271772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017509	TTAA	2	8	271920	271927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017509	AATT	2	8	273118	273125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017509	ATTT	2	8	273145	273152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017509	AAAT	2	8	273308	273315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017509	ACTT	2	8	275440	275447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017509	TAAT	2	8	275450	275457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017509	ATTA	2	8	275458	275465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017509	AATT	2	8	277453	277460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017509	TAAA	2	8	277485	277492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017509	ATAA	2	8	281918	281925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017509	TAAT	2	8	281940	281947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017509	CAAG	2	8	293094	293101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017509	TCAA	2	8	297329	297336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017509	ATTT	2	8	298557	298564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017509	TTTC	2	8	298583	298590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017509	GGAA	2	8	300665	300672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017509	CTAA	2	8	300723	300730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017509	TAAT	2	8	309417	309424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017509	TAAT	2	8	309427	309434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017509	TGAA	2	8	319503	319510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017509	ATAA	2	8	322182	322189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017509	ATTT	15	60	322219	322278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017509	TTTA	2	8	324999	325006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017509	AATT	2	8	325058	325065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017509	TTAT	2	8	325066	325073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017509	ATTT	2	8	325080	325087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017509	ATTT	2	8	327305	327312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017509	GATA	2	8	340154	340161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017509	AATA	2	8	340196	340203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017509	TTAA	2	8	346891	346898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017509	TTAT	2	8	350246	350253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017509	AATT	3	12	350468	350479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017509	TATT	2	8	354819	354826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017509	ATAA	2	8	910832	910839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017509	ATTA	2	8	910940	910947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017509	GATT	2	8	922971	922978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017509	TAAA	2	8	925476	925483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.