MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. R(high) chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017502	ATCAT	2	10	1093	1102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017502	AAAGT	2	10	1582	1591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017502	ATATT	2	10	1858	1867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017502	CTGAT	2	10	6272	6281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017502	TTAAA	2	10	20567	20576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017502	TTCCA	2	10	30252	30261	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017502	ATTTT	2	10	36650	36659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017502	TTAAT	2	10	49841	49850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017502	TTAGC	2	10	63830	63839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017502	TTTAT	2	10	64381	64390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017502	GCAAA	2	10	68452	68461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017502	CTAAA	2	10	78928	78937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017502	ATTTA	2	10	80142	80151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017502	CAAAC	2	10	80244	80253	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017502	ATCAA	2	10	80458	80467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017502	ATATA	2	10	80473	80482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017502	CTCAT	2	10	83034	83043	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017502	CTTCC	2	10	83308	83317	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017502	TAATA	2	10	87047	87056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017502	TAAAA	2	10	94966	94975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017502	ATATA	2	10	105290	105299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017502	GAGAT	2	10	118530	118539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017502	ATCTC	2	10	118556	118565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017502	GTTTT	2	10	118721	118730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017502	ACATA	2	10	122804	122813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017502	TTTGC	2	10	122970	122979	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017502	ATTTT	2	10	134715	134724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017502	TATTT	2	10	136209	136218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017502	TTATA	2	10	136983	136992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017502	CATCT	2	10	148125	148134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017502	GTTAG	2	10	150778	150787	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017502	CATTT	2	10	151229	151238	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017502	TCTTA	2	10	170600	170609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017502	TTTTA	2	10	175920	175929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017502	TAAAG	2	10	181222	181231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017502	TTTTA	2	10	182742	182751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017502	TGATC	2	10	184188	184197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017502	TAAAA	2	10	197781	197790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017502	TAGCT	2	10	198589	198598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017502	TATAT	2	10	208014	208023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017502	TCTTT	2	10	248175	248184	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017502	TTTTA	2	10	303757	303766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017502	AGAGA	2	10	320870	320879	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017502	ATATT	2	10	326641	326650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017502	AGTTA	2	10	326753	326762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017502	TAATT	2	10	328926	328935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017502	TCTAG	2	10	334750	334759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017502	TCGTG	2	10	335169	335178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017502	TAGGG	2	10	335550	335559	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017502	ATCAA	2	10	336229	336238	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017502	ATATA	2	10	336244	336253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017502	CTCAT	2	10	338805	338814	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017502	CTTCC	2	10	339079	339088	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017502	AATTA	2	10	364162	364171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017502	ATTAT	2	10	364191	364200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017502	TAAAT	2	10	368964	368973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017502	ATTAA	2	10	368975	368984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017502	TATTT	2	10	376799	376808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017502	AGATG	2	10	378287	378296	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017502	TAAAA	2	10	378400	378409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017502	AGTTA	2	10	395692	395701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017502	ATTAA	2	10	396652	396661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017502	ATTTT	2	10	398141	398150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017502	ATTAA	2	10	406164	406173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017502	AAATT	2	10	406280	406289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017502	TAGTT	2	10	408557	408566	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017502	TAAAA	2	10	413091	413100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017502	AAGTT	2	10	413376	413385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017502	AAAAT	2	10	414200	414209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017502	AAATT	2	10	423863	423872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017502	AAGAA	2	10	442596	442605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017502	ATATA	2	10	466431	466440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017502	GTCAG	2	10	468223	468232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017502	ATATA	2	10	478347	478356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017502	ATTTT	2	10	505059	505068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017502	TTAAC	2	10	509140	509149	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017502	ATTGT	2	10	520804	520813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017502	TAAAA	2	10	526783	526792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017502	AAGAC	2	10	536718	536727	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017502	TAAAA	2	10	574230	574239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017502	ATCTT	2	10	575044	575053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017502	TTAGT	2	10	590019	590028	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017502	TAACC	2	10	590258	590267	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017502	TAATT	2	10	602605	602614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017502	TTTAT	2	10	604167	604176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017502	TAAAT	2	10	618344	618353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017502	TTTAT	2	10	626478	626487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017502	TAGTC	2	10	627031	627040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017502	TAATT	2	10	627758	627767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017502	TGAAA	2	10	632233	632242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017502	AAATT	2	10	633948	633957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017502	ATTTA	2	10	633972	633981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017502	AAATC	2	10	635264	635273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017502	ATAAA	2	10	635316	635325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017502	TAATT	2	10	639241	639250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017502	CATTT	2	10	646430	646439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017502	AAATG	2	10	646446	646455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017502	TTAAT	2	10	672776	672785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017502	TAATT	2	10	672788	672797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017502	AAATA	2	10	674385	674394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017502	CTTAT	2	10	675659	675668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017502	ATTAT	2	10	678824	678833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017502	TTAAC	2	10	693095	693104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017502	TAATA	2	10	706178	706187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017502	TTTAA	2	10	706603	706612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017502	AGATC	2	10	730722	730731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017502	TGTAT	2	10	731966	731975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017502	TTAAG	2	10	732656	732665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017502	TTTTG	2	10	732697	732706	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017502	AAAAT	2	10	732822	732831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017502	AGTTT	2	10	733254	733263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017502	ATAAC	2	10	738304	738313	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017502	ATTTA	2	10	738350	738359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017502	ATTTA	2	10	738563	738572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017502	CAAAA	2	10	748767	748776	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017502	TATAA	2	10	753653	753662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017502	TTTTG	2	10	755124	755133	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017502	AATCT	2	10	755153	755162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017502	AAATT	2	10	756684	756693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017502	TATTT	2	10	763081	763090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017502	TAATA	2	10	818511	818520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017502	TTTTG	2	10	845147	845156	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017502	TTTTA	2	10	858801	858810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017502	ATTAA	2	10	868171	868180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017502	CCCTA	2	10	872648	872657	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017502	CACGA	2	10	873029	873038	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017502	CTAGA	2	10	873448	873457	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017502	TATCT	2	10	883055	883064	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017502	ACTTC	2	10	891286	891295	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017502	AGATC	2	10	904430	904439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017502	TTAAT	2	10	910414	910423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017502	CAATT	2	10	918358	918367	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017502	TAAAC	2	10	926747	926756	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017502	TAAAC	2	10	928463	928472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017502	ATTTA	2	10	930638	930647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017502	ATATA	2	10	930772	930781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017502	TAACT	2	10	931017	931026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017502	TTGTT	2	10	933822	933831	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017502	ATCAG	2	10	934076	934085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017502	AAAAT	2	10	940572	940581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017502	TAAAT	2	10	940627	940636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017502	ATTAA	2	10	940652	940661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017502	AGATG	2	10	945697	945706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017502	TAAAA	2	10	946571	946580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017502	AATTA	2	10	961805	961814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017502	ATGAC	2	10	962484	962493	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017502	AAAAG	2	10	962551	962560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017502	ATGTT	2	10	965887	965896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017502	TGATT	2	10	966200	966209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017502	TCCTT	2	10	969913	969922	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_017502	AATTT	2	10	970121	970130	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017502	AATCA	2	10	984061	984070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017502	TAACC	2	10	999207	999216	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.