MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC 49840

Total Repeats: 5623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017067	CAC	2	6	3918121	3918126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_017067	CGG	2	6	3918149	3918154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017067	TGA	2	6	3918217	3918222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017067	TGT	2	6	3918252	3918257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017067	TCC	2	6	3918315	3918320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_017067	CTG	2	6	3918401	3918406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017067	TCGC	2	8	3918432	3918439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_017067	TCG	2	6	3918604	3918609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017067	TCC	2	6	3918632	3918637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_017067	GCCCTT	2	12	3918658	3918669	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_017067	CGA	2	6	3918716	3918721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017067	CA	3	6	3918740	3918745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_017067	ACC	2	6	3918796	3918801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_017067	CCCAG	2	10	3918824	3918833	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5515	NC_017067	CGA	2	6	3918857	3918862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017067	CACC	2	8	3918902	3918909	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5517	NC_017067	ATT	2	6	3918913	3918918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017067	CAT	2	6	3918956	3918961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017067	TGA	2	6	3919043	3919048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017067	AG	3	6	3920245	3920250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017067	A	6	6	3920347	3920352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017067	CCTT	2	8	3920863	3920870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_017067	GCA	2	6	3920886	3920891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_017067	GC	3	6	3920893	3920898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_017067	GTA	2	6	3920925	3920930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017067	T	6	6	3920966	3920971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017067	TAGAT	2	10	3921329	3921338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017067	GTGA	2	8	3921378	3921385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017067	AGT	2	6	3921389	3921394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017067	CCA	2	6	3921546	3921551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_017067	AACG	2	8	3921553	3921560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_017067	GCG	2	6	3921641	3921646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_017067	TGC	2	6	3921662	3921667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017067	GCA	2	6	3922056	3922061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017067	CCA	2	6	3922095	3922100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_017067	CA	3	6	3922108	3922113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_017067	GTAAA	2	10	3922124	3922133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017067	GGT	2	6	3922230	3922235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017067	C	6	6	3922249	3922254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5540	NC_017067	CTC	2	6	3922296	3922301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_017067	GCC	2	6	3922325	3922330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_017067	CAG	2	6	3924521	3924526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017067	CAC	2	6	3924539	3924544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_017067	CCG	2	6	3924550	3924555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_017067	CCGC	2	8	3924610	3924617	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5546	NC_017067	CAA	2	6	3924653	3924658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017067	GGT	2	6	3925447	3925452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017067	GGC	2	6	3925484	3925489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017067	GCGG	2	8	3925503	3925510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_017067	TGGG	2	8	3926553	3926560	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017067	CGG	2	6	3926592	3926597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_017067	CAACCG	2	12	3928164	3928175	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_017067	CAA	2	6	3931509	3931514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017067	A	7	7	3931528	3931534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017067	G	6	6	3935621	3935626	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017067	GAT	2	6	3935794	3935799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017067	AT	3	6	3935815	3935820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017067	TA	3	6	3935846	3935851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017067	ACC	2	6	3935907	3935912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_017067	GAAT	2	8	3935922	3935929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017067	CGC	2	6	3935974	3935979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_017067	A	7	7	3936661	3936667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017067	CAA	2	6	3940548	3940553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017067	CGG	2	6	3945463	3945468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_017067	GCTCC	2	10	3945523	3945532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5566	NC_017067	CTTTT	2	10	3950922	3950931	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5567	NC_017067	TTC	2	6	3952510	3952515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_017067	GGT	2	6	3952594	3952599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017067	ACG	2	6	3952671	3952676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017067	GCG	2	6	3952688	3952693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_017067	CAA	2	6	3952738	3952743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017067	ATC	2	6	3952754	3952759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_017067	AC	3	6	3952785	3952790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_017067	TCAT	2	8	3959062	3959069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_017067	CAT	2	6	3959107	3959112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5577	NC_017067	GA	3	6	3959188	3959193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017067	A	6	6	3959197	3959202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017067	GCTG	2	8	3959207	3959214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_017067	GC	3	6	3959217	3959222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_017067	A	6	6	3962524	3962529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017067	A	6	6	3963085	3963090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_017067	CGG	2	6	3965461	3965466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5586	NC_017067	CTC	2	6	3968391	3968396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_017067	T	7	7	3968399	3968405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017067	GTTT	2	8	3968419	3968426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017067	GTAC	2	8	3969669	3969676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_017067	GAA	2	6	3969689	3969694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017067	GC	3	6	3969723	3969728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_017067	CAC	2	6	3969848	3969853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5596	NC_017067	A	7	7	3974228	3974234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017067	GCG	2	6	3974239	3974244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5600	NC_017067	CGC	2	6	3974351	3974356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_017067	A	6	6	3974431	3974436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017067	CA	3	6	3974454	3974459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_017067	TAAA	2	8	3974504	3974511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017067	TTA	2	6	3974516	3974521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5606	NC_017067	CCG	2	6	3981084	3981089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_017067	CA	4	8	3981107	3981114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_017067	CCAA	2	8	3981129	3981136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_017067	GAT	2	6	3981142	3981147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017067	TCCCG	2	10	3983002	3983011	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5613	NC_017067	GTT	2	6	3985026	3985031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5615	NC_017067	CTT	2	6	3985091	3985096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5617	NC_017067	GTCTG	2	10	3988259	3988268	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5618	NC_017067	AGT	2	6	3988269	3988274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017067	GTTCC	2	10	3988331	3988340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5623	NC_017067	ATGGTT	2	12	3989196	3989207	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.