MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocella conradii HZ254 chromosome

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017034	TTTCTA	2	12	7481	7492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017034	GAGCAC	2	12	16207	16218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017034	CATCTT	2	12	16267	16278	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017034	CTTAGC	2	12	44900	44911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017034	AAGCTT	2	12	52621	52632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017034	CGTTAA	2	12	58575	58586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017034	TCATGT	2	12	130148	130159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017034	TCTGTT	2	12	130192	130203	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017034	CATGAA	2	12	131594	131605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017034	TGAGCG	2	12	131935	131946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017034	GAAGGC	2	12	132061	132072	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017034	TAATGT	2	12	149655	149666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017034	ATTTTG	2	12	167907	167918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017034	TTAACG	2	12	220976	220987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017034	CCGGGA	2	12	242221	242232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017034	AAAAGG	2	12	242422	242433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017034	AAATAT	2	12	281636	281647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017034	TATTTA	2	12	284867	284878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017034	TTACGT	2	12	289334	289345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017034	TAAAGT	2	12	298799	298810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017034	TCTTTT	2	12	389177	389188	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017034	GAACCT	2	12	402867	402878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017034	CTTTCT	2	12	409321	409332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017034	TTATTT	2	12	446438	446449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017034	CCTCCA	2	12	457143	457154	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017034	AGGGGT	2	12	515302	515313	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017034	AAAACA	4	24	516329	516352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017034	ATAAAA	2	12	522280	522291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017034	GATGAG	2	12	539551	539562	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017034	ATTAAA	2	12	554828	554839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017034	TATTGA	2	12	558188	558199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017034	TAGAAG	2	12	566800	566811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017034	GAAAAA	2	12	588818	588829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017034	TAAAAA	2	12	620465	620476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017034	ATTTAT	2	12	637803	637814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017034	TAAAGT	2	12	661838	661849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017034	CCTGGA	2	12	694533	694544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017034	ACACCA	2	12	702657	702668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017034	AAAAAC	2	12	702669	702680	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017034	GAAAAA	2	12	706213	706224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017034	GTGTCA	2	12	708535	708546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017034	GGCTGG	2	12	720678	720689	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017034	CCAGCC	2	12	725222	725233	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017034	CCCTCC	2	12	767946	767957	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_017034	TGCCGT	2	12	768058	768069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017034	CATAAG	2	12	815189	815200	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017034	ACGTTT	2	12	827380	827391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017034	TAAATA	2	12	838658	838669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017034	TAAATA	2	12	843597	843608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017034	AGAAAA	2	12	877678	877689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017034	GGATGC	2	12	900251	900262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017034	AAGGTG	2	12	907941	907952	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017034	ATGCCC	2	12	908654	908665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017034	TCTATG	2	12	910181	910192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017034	TGATGG	2	12	928875	928886	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017034	TAGAAA	2	12	1032661	1032672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017034	ATCATT	2	12	1063226	1063237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017034	TAAATA	2	12	1098665	1098676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017034	TAAATA	2	12	1101255	1101266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017034	TAAATA	2	12	1105184	1105195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017034	AATTTT	2	12	1105832	1105843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017034	ATTGCC	2	12	1113534	1113545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017034	TAAAAA	2	12	1120087	1120098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017034	CATTTA	2	12	1138942	1138953	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017034	TTTATA	2	12	1140490	1140501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017034	ATAGTA	2	12	1152507	1152518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017034	TAGAAG	2	12	1160240	1160251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017034	TAGAAG	2	12	1160289	1160300	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017034	TAGAAG	2	12	1160338	1160349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017034	TAGAAG	2	12	1160387	1160398	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017034	GGGATG	2	12	1185410	1185421	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017034	AAAAGG	2	12	1208880	1208891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017034	CGATAA	2	12	1226373	1226384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017034	TAGAAG	2	12	1231188	1231199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017034	TAGAAG	2	12	1231249	1231260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017034	AAATTA	2	12	1234034	1234045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017034	CTTTAT	2	12	1239222	1239233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017034	TTTTAT	2	12	1242097	1242108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017034	TTTAAA	2	12	1247877	1247888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017034	TTTTGG	2	12	1272305	1272316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017034	GGAGGC	2	12	1324407	1324418	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017034	GCTTTA	2	12	1373335	1373346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017034	AAAAAT	2	12	1392093	1392104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017034	AAAAAT	2	12	1428085	1428096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017034	CACAGA	2	12	1428646	1428657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017034	TATTTA	2	12	1459772	1459783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017034	TGATGT	2	12	1474122	1474133	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017034	GTATAA	2	12	1476213	1476224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017034	GATAAA	2	12	1505888	1505899	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017034	TTCACG	2	12	1529270	1529281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017034	CCATCA	2	12	1532495	1532506	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017034	AATATA	2	12	1547630	1547641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017034	TCTAAG	2	12	1557251	1557262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017034	CTTAGA	2	12	1557314	1557325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017034	AGCTCC	2	12	1577029	1577040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017034	ATGAGT	2	12	1593622	1593633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017034	AATTTA	2	12	1605296	1605307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017034	AAAATA	2	12	1646659	1646670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017034	AAAAAT	2	12	1662904	1662915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017034	ATATAA	2	12	1667669	1667680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017034	GTTTTT	4	24	1677587	1677610	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017034	ACCCCT	2	12	1678625	1678636	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017034	TAAGGA	2	12	1725883	1725894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017034	ATAGGC	2	12	1726251	1726262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017034	TCTTTT	2	12	1753103	1753114	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017034	TGAAAA	2	12	1788579	1788590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017034	AGGGGA	2	12	1803585	1803596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017034	AAGGTG	2	12	1803785	1803796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017034	GATTTC	2	12	1845771	1845782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017034	GCCTTT	2	12	1879329	1879340	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017034	AGAAAA	2	12	1884573	1884584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017034	TGGTCT	2	12	1887454	1887465	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017034	TACCCG	2	12	1888987	1888998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017034	AGAAAA	2	12	1956813	1956824	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017034	TCTGCT	2	12	2058308	2058319	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017034	TGGTGT	2	12	2069839	2069850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017034	TAGTAA	2	12	2071013	2071024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017034	GAAATT	2	12	2089996	2090007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017034	GCGTGA	2	12	2151012	2151023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017034	TAGAAG	2	12	2200104	2200115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017034	TAAAAA	2	12	2201633	2201644	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017034	TAGAAG	2	12	2251978	2251989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017034	TAGAAG	2	12	2252041	2252052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017034	TAGAAG	2	12	2252104	2252115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017034	TAGAAG	2	12	2283663	2283674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017034	GGCGAG	2	12	2299423	2299434	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.