MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-64 chromosome

Total Repeats: 1391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016948	TCGT	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016948	GCCG	2	8	4553	4560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016948	CCGC	2	8	5212	5219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016948	GACC	2	8	7313	7320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016948	GTCG	2	8	13229	13236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016948	GGCC	2	8	15005	15012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016948	CCCG	2	8	15677	15684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016948	CGCC	2	8	15997	16004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016948	ATTC	2	8	16253	16260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016948	GTCG	2	8	16262	16269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016948	CCGG	2	8	25689	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016948	GCCG	2	8	29233	29240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016948	AGCT	2	8	32628	32635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016948	AGGG	2	8	32637	32644	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016948	TCGG	2	8	34903	34910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016948	CGCA	2	8	34915	34922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016948	CGCC	2	8	40548	40555	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_016948	GCCG	2	8	46186	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016948	CGGC	2	8	60932	60939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016948	GGTC	2	8	61325	61332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016948	AAGG	2	8	66788	66795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016948	GAAA	2	8	76050	76057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016948	ATGT	2	8	77298	77305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016948	AACG	2	8	83535	83542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016948	TCAG	2	8	84031	84038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016948	GCGT	2	8	86775	86782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016948	GAAC	2	8	86834	86841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016948	CGCC	2	8	86843	86850	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_016948	CGTA	2	8	88416	88423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016948	CACC	2	8	88443	88450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_016948	GACA	2	8	90468	90475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016948	GGTC	2	8	93040	93047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016948	GCGG	2	8	93288	93295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016948	GAAG	2	8	94008	94015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016948	CCCT	2	8	98258	98265	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_016948	GTGC	2	8	98444	98451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016948	GGGA	2	8	98460	98467	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016948	CCGG	2	8	114178	114185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016948	TGCG	2	8	115568	115575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016948	CGAC	2	8	115579	115586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016948	CAAC	2	8	121160	121167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016948	TTAG	2	8	122159	122166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016948	GGAT	2	8	122851	122858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016948	TGGA	2	8	126435	126442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016948	CTCG	2	8	132097	132104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016948	GCCG	2	8	136607	136614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016948	CGAA	2	8	141445	141452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016948	TCGG	2	8	146220	146227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016948	CGGC	2	8	148470	148477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016948	ACTC	2	8	150386	150393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016948	CGGC	2	8	150426	150433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016948	CCCG	2	8	152005	152012	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_016948	CCCA	2	8	154257	154264	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016948	GCTC	2	8	161527	161534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016948	GTTC	2	8	173611	173618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016948	GGTG	2	8	173645	173652	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016948	GGAC	2	8	173706	173713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016948	CGGC	2	8	173919	173926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016948	GGGC	2	8	184338	184345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016948	GCCG	2	8	185151	185158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016948	GTGA	2	8	187043	187050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016948	GTGG	2	8	187147	187154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016948	ACGT	2	8	190548	190555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016948	GCAC	2	8	197214	197221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016948	GCCG	2	8	200730	200737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016948	CGGC	2	8	202682	202689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016948	CTGG	2	8	208817	208824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016948	CGGC	2	8	208972	208979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016948	CGGC	2	8	215669	215676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016948	CGAA	2	8	215833	215840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016948	GCAG	2	8	215939	215946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016948	GGCC	2	8	217164	217171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016948	CCGA	2	8	219516	219523	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016948	ACTG	2	8	256738	256745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016948	TGGC	2	8	256827	256834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016948	ACTT	2	8	268877	268884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016948	GCCG	2	8	269995	270002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016948	GAAG	2	8	270376	270383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016948	TCGT	2	8	278307	278314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016948	CGTG	2	8	288342	288349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016948	GCTG	2	8	292079	292086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016948	CACC	2	8	295363	295370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016948	GCCG	2	8	295428	295435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016948	CGCC	2	8	296012	296019	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_016948	GGGC	2	8	321697	321704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016948	GGGC	2	8	323436	323443	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016948	AATC	2	8	324751	324758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016948	TTCG	3	12	324786	324797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016948	GTTC	2	8	326402	326409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016948	ACCG	2	8	326430	326437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016948	ACGT	2	8	326541	326548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016948	CCGA	2	8	326556	326563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016948	GGAA	2	8	327085	327092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016948	CCTT	2	8	327094	327101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016948	GTCG	2	8	339801	339808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016948	GGTT	2	8	340666	340673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016948	CGGG	2	8	347550	347557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016948	GTCG	2	8	351845	351852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016948	GAGT	2	8	357394	357401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016948	CGCC	2	8	368291	368298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_016948	CGGG	2	8	372133	372140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016948	CTCG	2	8	377389	377396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016948	GCCC	2	8	386094	386101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_016948	CCGG	2	8	389645	389652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016948	GCGA	2	8	389726	389733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016948	TGCG	2	8	389809	389816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016948	CTGC	2	8	389868	389875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016948	CGAC	2	8	391848	391855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016948	CGAA	2	8	391918	391925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016948	CGGC	2	8	396938	396945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016948	CCGG	2	8	399450	399457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016948	CCGA	2	8	399479	399486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016948	CTCG	2	8	401028	401035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016948	CCGA	2	8	407525	407532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016948	CCGC	2	8	411877	411884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_016948	CCCA	2	8	417916	417923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_016948	GGCC	2	8	419356	419363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016948	TCCG	2	8	419383	419390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016948	CGGC	2	8	421810	421817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016948	GTAC	2	8	423676	423683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016948	GGCA	2	8	424112	424119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016948	GCCT	2	8	424122	424129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016948	CTCG	2	8	425327	425334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016948	CGGA	2	8	425986	425993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016948	TGGT	3	12	426220	426231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016948	TGGC	2	8	427401	427408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016948	TGCC	2	8	427976	427983	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016948	TGAC	2	8	428262	428269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016948	GGCA	2	8	431836	431843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016948	CGGG	2	8	432498	432505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016948	CTCG	2	8	435289	435296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016948	TCGG	2	8	439483	439490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016948	GCCC	2	8	440598	440605	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_016948	CCCG	2	8	446561	446568	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_016948	CCGC	2	8	457163	457170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_016948	CCGG	2	8	457848	457855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016948	CCGT	2	8	458627	458634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016948	GCGG	2	8	459890	459897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016948	GCCG	2	8	460094	460101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016948	CGAT	2	8	472580	472587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016948	GAAC	2	8	474170	474177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016948	AGCC	2	8	485713	485720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016948	GGCG	2	8	490535	490542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016948	CGCC	2	8	501880	501887	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_016948	GCTG	2	8	503745	503752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016948	GCCG	2	8	503994	504001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016948	CAAG	2	8	521954	521961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016948	AAGC	2	8	528764	528771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016948	CTTG	2	8	528773	528780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016948	ATCC	2	8	549342	549349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016948	ATCC	2	8	549356	549363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_016948	ACGT	2	8	1808832	1808839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_016948	GCTG	2	8	1812615	1812622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_016948	CCGA	2	8	1814208	1814215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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482	NC_016948	GCCG	2	8	1839859	1839866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_016948	GGCA	2	8	1882670	1882677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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493	NC_016948	CCCG	2	8	1895046	1895053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
494	NC_016948	GCGG	2	8	1895743	1895750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
495	NC_016948	TGAG	2	8	1895825	1895832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
496	NC_016948	TGCC	2	8	1895919	1895926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_016948	TGGT	2	8	1900073	1900080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_016948	GTTG	2	8	1905763	1905770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_016948	CGGG	2	8	1906558	1906565	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_016948	TGCC	2	8	1907032	1907039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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