MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 1361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016947	TCGT	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016947	CCGC	2	8	5210	5217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016947	GACC	2	8	7311	7318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016947	GGCC	2	8	15003	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016947	CCCG	2	8	15675	15682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016947	CGCC	2	8	15995	16002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016947	ATTC	2	8	16251	16258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016947	GTCG	2	8	16260	16267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016947	CCGG	2	8	25687	25694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016947	GGCC	2	8	29230	29237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016947	AGCT	2	8	32627	32634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016947	AGGG	2	8	32636	32643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016947	CCGG	2	8	35106	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016947	CGCC	2	8	40622	40629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016947	GCCG	2	8	46260	46267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016947	CGGC	2	8	61012	61019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016947	GGTC	2	8	61405	61412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016947	GAAA	2	8	76109	76116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016947	ATGT	2	8	77357	77364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016947	TCAG	2	8	84090	84097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016947	GGTG	2	8	84381	84388	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016947	GCGT	2	8	86834	86841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016947	GAAC	2	8	86893	86900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016947	CGCC	2	8	86902	86909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016947	CGTA	2	8	88475	88482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016947	GACA	2	8	90527	90534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016947	GGTC	2	8	94208	94215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016947	GCGG	2	8	94456	94463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016947	GAAG	2	8	95176	95183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016947	CCCT	2	8	99426	99433	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_016947	GTGC	2	8	99612	99619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016947	GGGA	2	8	99628	99635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016947	AGTG	2	8	103129	103136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016947	ACCA	2	8	103430	103437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016947	CCGG	2	8	114907	114914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016947	TGCG	2	8	116297	116304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016947	CGAC	2	8	116308	116315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016947	CAAC	2	8	121889	121896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016947	TTAG	2	8	122888	122895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016947	GGAT	2	8	123580	123587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016947	TGGA	2	8	127164	127171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016947	CTCG	2	8	132823	132830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016947	GCCG	2	8	137333	137340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016947	CGAA	2	8	142181	142188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016947	TCGG	2	8	146956	146963	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016947	CGGC	2	8	149206	149213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016947	ACTC	2	8	151120	151127	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016947	CGGC	2	8	151161	151168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016947	CCCG	2	8	152740	152747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016947	CCCA	2	8	154992	154999	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_016947	AAAT	2	8	156584	156591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016947	GCTC	2	8	162263	162270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016947	GTTC	2	8	174341	174348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016947	GGTG	2	8	174375	174382	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016947	GGAC	2	8	174436	174443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016947	GGGC	2	8	185068	185075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016947	GCCG	2	8	185881	185888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016947	GTGA	2	8	187773	187780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016947	GTGG	2	8	187877	187884	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016947	ACGT	2	8	191278	191285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016947	GCAC	2	8	197944	197951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016947	GCCG	2	8	201460	201467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016947	CGGC	2	8	203421	203428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016947	CTGG	2	8	209556	209563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016947	CGGC	2	8	209711	209718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016947	CGGC	2	8	216458	216465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016947	CGAA	2	8	216622	216629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016947	GCAG	2	8	216728	216735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016947	GGCC	2	8	217953	217960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016947	CCGA	2	8	220305	220312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016947	ACTG	2	8	256815	256822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016947	TGGC	2	8	256904	256911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016947	TGCG	2	8	265521	265528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016947	ACTT	2	8	267650	267657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016947	GCCG	2	8	268768	268775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016947	GAAG	2	8	269149	269156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016947	CGTG	2	8	287115	287122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016947	GCTG	2	8	290762	290769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016947	CACC	2	8	294046	294053	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_016947	GCCG	2	8	294111	294118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016947	CGAC	2	8	317499	317506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016947	GGGC	2	8	320358	320365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016947	GGGC	2	8	322097	322104	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016947	AATC	2	8	323412	323419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016947	TTCG	3	12	323447	323458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016947	GTTC	2	8	323698	323705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016947	ACCG	2	8	323726	323733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016947	ACGT	2	8	323837	323844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016947	CGAC	2	8	323853	323860	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016947	GGAA	2	8	324381	324388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016947	CCTT	2	8	324390	324397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016947	GGTT	2	8	338040	338047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016947	CGGG	2	8	344900	344907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016947	GTCG	2	8	349195	349202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016947	CGCC	2	8	365668	365675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_016947	CGGG	2	8	369511	369518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016947	CTCG	2	8	374767	374774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016947	GCCC	2	8	383472	383479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_016947	CCGG	2	8	387023	387030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016947	GCGA	2	8	387104	387111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016947	TGCG	2	8	387187	387194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016947	CTGC	2	8	387247	387254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016947	GACG	2	8	389986	389993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016947	CGAA	2	8	390077	390084	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016947	CGGC	2	8	395097	395104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016947	CCGG	2	8	397609	397616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016947	CCGA	2	8	397638	397645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016947	CTCG	2	8	399206	399213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016947	CCGA	2	8	405703	405710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016947	CCGC	2	8	409999	410006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016947	CCCA	2	8	416038	416045	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_016947	GGCC	2	8	417478	417485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016947	TCCG	2	8	417505	417512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016947	CTCG	2	8	421560	421567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016947	TCGG	2	8	425754	425761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016947	GCCC	2	8	426868	426875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_016947	CCCG	2	8	432831	432838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_016947	AGCA	2	8	440468	440475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016947	AACC	2	8	440600	440607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016947	CCGC	2	8	444816	444823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_016947	CCGG	2	8	445501	445508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016947	TTGC	2	8	446539	446546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016947	GCGG	2	8	447543	447550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016947	GCCG	2	8	447747	447754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016947	CGAT	2	8	460232	460239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016947	GAAC	2	8	461822	461829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016947	GTTG	2	8	473234	473241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016947	AGCC	2	8	473365	473372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016947	GGCG	2	8	478187	478194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016947	CGCC	2	8	489532	489539	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_016947	CTGG	2	8	491398	491405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016947	GCCG	2	8	491645	491652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016947	CAAG	2	8	509606	509613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016947	CCGA	2	8	512114	512121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016947	AAGC	2	8	516351	516358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016947	CTTG	2	8	516360	516367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016947	ATCC	2	8	536909	536916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016947	ATCC	2	8	536923	536930	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016947	CTGG	2	8	538722	538729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016947	GGGC	2	8	542944	542951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016947	GCTG	2	8	542959	542966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016947	CCGG	2	8	544207	544214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016947	GGCA	2	8	544288	544295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016947	CCGC	2	8	550543	550550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_016947	CGTC	2	8	556634	556641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016947	GCCA	2	8	559395	559402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016947	CCGG	2	8	572345	572352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016947	CCTG	2	8	576921	576928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016947	CCGC	2	8	579805	579812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_016947	AGCG	2	8	579849	579856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016947	CCGA	2	8	579949	579956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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