MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016946	TGAAGG	2	12	2053	2064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016946	CGGCCG	2	12	46227	46238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016946	GCGTCG	2	12	212857	212868	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016946	GGGTCG	2	12	223567	223578	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016946	CGGCTG	2	12	274455	274466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016946	CCGCCA	2	12	292477	292488	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016946	CAGCGA	2	12	295348	295359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016946	TCGGCT	2	12	332691	332702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016946	AGGGAA	2	12	400053	400064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016946	CGGCGA	2	12	413423	413434	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016946	CGGCGA	2	12	413479	413490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016946	GCGGCT	2	12	593280	593291	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016946	CGGGCG	2	12	663344	663355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016946	ACGAGA	2	12	720371	720382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016946	GTCGAC	2	12	824198	824209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016946	TCGGGT	2	12	853265	853276	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016946	CGGCCG	2	12	871116	871127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016946	TGTTAC	2	12	906770	906781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016946	CGATCC	2	12	920069	920080	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016946	CGGCAC	2	12	927324	927335	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016946	CGATCA	2	12	1075982	1075993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016946	CCGTCG	2	12	1085168	1085179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016946	CGTCCC	2	12	1116779	1116790	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016946	GACCCG	2	12	1167646	1167657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016946	AATGAG	2	12	1278745	1278756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016946	CCGCCA	2	12	1343798	1343809	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016946	GAGGGG	2	12	1366301	1366312	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016946	CGCCAG	2	12	1465192	1465203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016946	GACGTC	2	12	1480484	1480495	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016946	GGTCGG	2	12	1530214	1530225	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016946	ATAACT	2	12	1540877	1540888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016946	TCGCTG	2	12	1549208	1549219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016946	GCTGCC	2	12	1557414	1557425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016946	GCCCGG	2	12	1579292	1579303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016946	TCTGCA	2	12	1620458	1620469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016946	GTTTGC	2	12	1622970	1622981	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016946	CGCTGC	2	12	1628503	1628514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016946	GACCGT	2	12	1768149	1768160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016946	CAGGGA	2	12	1787084	1787095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016946	CCGTCG	2	12	1800956	1800967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016946	CCGGCG	2	12	1912783	1912794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016946	ACACTG	2	12	1944496	1944507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016946	GCCCAG	2	12	2060801	2060812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016946	ACCGAG	2	12	2108184	2108195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016946	GAAAGT	2	12	2160575	2160586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016946	GGGCTG	2	12	2190076	2190087	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016946	GAGCGG	2	12	2201547	2201558	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016946	GCTGTG	2	12	2253401	2253412	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016946	CGCTGG	2	12	2352683	2352694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016946	TAACTC	2	12	2403013	2403024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016946	GGTTGA	2	12	2403028	2403039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016946	GCGCAC	2	12	2414021	2414032	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016946	CGGTGC	2	12	2416983	2416994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016946	CGGGCG	2	12	2422711	2422722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016946	GAGGCC	2	12	2433818	2433829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016946	GCGGTG	2	12	2492174	2492185	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016946	ACCAGA	2	12	2582182	2582193	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016946	GGTCGT	2	12	2642704	2642715	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016946	GCGTCC	2	12	2672530	2672541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016946	TCGCGA	2	12	2672696	2672707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016946	CGACCT	2	12	2672723	2672734	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016946	GCCACC	2	12	2686818	2686829	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016946	GCCCGC	2	12	2690579	2690590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016946	ACCGCG	2	12	2711624	2711635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016946	CCGCGG	2	12	2712458	2712469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016946	GTTTCG	2	12	2725168	2725179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016946	CCCTCT	2	12	2832970	2832981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016946	GATCGC	2	12	2967612	2967623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016946	CAAGAT	2	12	3049140	3049151	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016946	CGCCAC	2	12	3061542	3061553	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016946	ACCGTA	2	12	3061940	3061951	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016946	GTGGGA	2	12	3138048	3138059	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016946	GAGGAC	2	12	3163263	3163274	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016946	GCGCCC	2	12	3205356	3205367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016946	ACGGCG	2	12	3228594	3228605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016946	CGGTGT	2	12	3386710	3386721	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016946	CGGTTC	2	12	3570925	3570936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016946	CTGGCC	2	12	3585776	3585787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016946	CCGGCG	2	12	3612084	3612095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016946	CACCCG	2	12	3635826	3635837	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016946	GGCGCG	2	12	3664305	3664316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016946	CGACAT	2	12	3665297	3665308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016946	CATCGC	2	12	3696631	3696642	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016946	CCGAGT	2	12	3714431	3714442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016946	CGGGCG	2	12	3715010	3715021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016946	CGGGCG	2	12	3779419	3779430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016946	CAGGGC	2	12	3794934	3794945	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016946	GGCGTG	2	12	3861882	3861893	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016946	CCGTCA	2	12	3909834	3909845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016946	GGCGTT	2	12	3955295	3955306	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016946	GTCACC	2	12	3992668	3992679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016946	CACCGC	2	12	4185935	4185946	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016946	ACGGTC	2	12	4219702	4219713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016946	TGGCGG	2	12	4287573	4287584	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016946	GCGCGG	2	12	4326314	4326325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016946	CGGCGA	2	12	4389407	4389418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016946	CGGCGA	2	12	4389464	4389475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016946	GGGAAC	2	12	4453843	4453854	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016946	GCTCAC	2	12	4462956	4462967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016946	TGTTCG	2	12	4583787	4583798	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016946	TTGTCG	2	12	4591639	4591650	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016946	AGGAGC	2	12	4625128	4625139	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016946	GGGCGA	2	12	4641084	4641095	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016946	CGGCAC	2	12	4722796	4722807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016946	TACTGG	2	12	4753009	4753020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016946	GCCCCT	2	12	4775884	4775895	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016946	AACGGG	2	12	4780409	4780420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016946	GTCGGC	2	12	4916403	4916414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016946	CCTGTG	2	12	4928899	4928910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016946	CGTCGC	2	12	4935910	4935921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016946	TTCCGC	2	12	4946702	4946713	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016946	CCGAAC	2	12	4949862	4949873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016946	CTGGGC	2	12	4971025	4971036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016946	AACGCG	2	12	4971364	4971375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016946	TCATTT	2	12	5008253	5008264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016946	GAATCT	2	12	5020226	5020237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016946	GTCGGG	2	12	5051993	5052004	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016946	CGTCCC	2	12	5059238	5059249	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016946	CGGAGG	2	12	5067413	5067424	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016946	AAGTCG	2	12	5087675	5087686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016946	GGCTGC	2	12	5147354	5147365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016946	CCCGGG	2	12	5232812	5232823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016946	CGGGCT	2	12	5253296	5253307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016946	ATCGGC	2	12	5261855	5261866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016946	GCCGGA	2	12	5261928	5261939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016946	CGGCGA	2	12	5291415	5291426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016946	CACTCT	2	12	5384116	5384127	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.