MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	ATAAA	2	10	1542	1551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016829	AAATA	2	10	7224	7233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016829	GAAAC	2	10	18389	18398	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016829	AAAAC	2	10	18434	18443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016829	ACCTA	2	10	18574	18583	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016829	TCGTG	2	10	19518	19527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016829	TTAAG	2	10	19582	19591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016829	GCTAC	2	10	19807	19816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016829	TAAAT	2	10	20157	20166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016829	GAAAA	2	10	20465	20474	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016829	AAATT	2	10	23267	23276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016829	AATTT	2	10	25848	25857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016829	TTTGC	2	10	26027	26036	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016829	ATTTT	2	10	26270	26279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016829	AGAAA	2	10	27359	27368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016829	AGATT	2	10	29190	29199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016829	TTTGA	2	10	31553	31562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016829	ATTAA	2	10	32785	32794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016829	TTTTA	2	10	42685	42694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016829	ATAAA	2	10	48107	48116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016829	ATTTT	2	10	50263	50272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016829	ATTTT	2	10	53717	53726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016829	TAAAA	2	10	57021	57030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016829	ACAAA	2	10	57244	57253	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016829	ATTTA	2	10	58634	58643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016829	ATTTA	2	10	58737	58746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016829	AAAAG	2	10	58916	58925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016829	CACAA	2	10	59895	59904	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016829	ATAAA	2	10	62733	62742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016829	TTTAA	2	10	65258	65267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016829	AATTT	2	10	65942	65951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016829	ATTTT	2	10	77307	77316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016829	ATTTT	2	10	94259	94268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016829	TATAA	2	10	102988	102997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016829	TAATT	2	10	104133	104142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016829	ATAAA	2	10	104228	104237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016829	CTTAC	2	10	105028	105037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016829	ATTAA	2	10	118741	118750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016829	ATTAT	2	10	134411	134420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016829	TTTAA	2	10	137142	137151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016829	TAATA	2	10	139112	139121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016829	CATTT	2	10	147026	147035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016829	TAAAT	2	10	150783	150792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016829	ATATA	2	10	151260	151269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016829	ATTTT	2	10	160814	160823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016829	AAAAT	2	10	164479	164488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016829	TAATT	2	10	164734	164743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016829	TTTAA	2	10	165123	165132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016829	ATATA	2	10	180434	180443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016829	TTTAG	2	10	187544	187553	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016829	CAAAA	2	10	188661	188670	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016829	ATATT	2	10	188772	188781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016829	ATTAA	2	10	189404	189413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016829	TAACT	2	10	189730	189739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016829	ATACC	2	10	189915	189924	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016829	ATTAA	2	10	191381	191390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016829	ATTTA	2	10	193072	193081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016829	GAATT	2	10	193218	193227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016829	AATCA	2	10	193653	193662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016829	AAATT	2	10	194216	194225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016829	ATATA	2	10	195312	195321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016829	AATTT	2	10	195623	195632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016829	TGATT	2	10	208837	208846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016829	AACTA	2	10	210918	210927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016829	ATTTT	2	10	210983	210992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016829	AATTA	2	10	211053	211062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016829	TGATT	2	10	214513	214522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016829	ACTAA	2	10	215779	215788	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016829	ATTAA	2	10	217188	217197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016829	CAAAA	2	10	223630	223639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016829	AAAAT	2	10	227638	227647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016829	AAAAT	2	10	227837	227846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016829	TTCAA	2	10	229205	229214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016829	TAAAA	2	10	229273	229282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016829	AAATC	2	10	234242	234251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016829	AAATT	2	10	234399	234408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016829	AATCC	2	10	235949	235958	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016829	ATTTA	2	10	236729	236738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016829	ATGTT	2	10	237156	237165	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016829	AATTA	2	10	237742	237751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016829	AATTT	2	10	237780	237789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016829	CATTT	2	10	237897	237906	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016829	ATTAA	2	10	238043	238052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016829	TTTAA	2	10	238593	238602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016829	TTTTA	2	10	269284	269293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016829	AATTA	2	10	271624	271633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016829	TCTAA	2	10	272445	272454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016829	ATAAA	2	10	302842	302851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016829	GGTGA	2	10	303999	304008	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016829	ATAAA	2	10	306259	306268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016829	GGTTT	2	10	310981	310990	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016829	TTATT	2	10	311038	311047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016829	TTAAT	2	10	311122	311131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016829	TTATT	2	10	311313	311322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016829	TATCT	2	10	312869	312878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016829	CAAAA	2	10	313062	313071	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016829	CTATA	2	10	315320	315329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016829	ATTTT	2	10	315944	315953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016829	TAAAA	2	10	316197	316206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016829	ATTAT	2	10	317092	317101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016829	AAATA	2	10	317592	317601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016829	AATTT	2	10	318516	318525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016829	TGATA	2	10	319756	319765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016829	ATTTT	2	10	331051	331060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016829	AAAAT	2	10	340337	340346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016829	TAAAA	2	10	341981	341990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016829	TTTTC	2	10	343726	343735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016829	ATAAA	2	10	356024	356033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016829	AATTA	2	10	356791	356800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016829	CAAAA	2	10	357878	357887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016829	AAAAT	2	10	365074	365083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016829	ATTTT	2	10	370916	370925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016829	TTAAA	2	10	376652	376661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016829	CTCAT	2	10	379643	379652	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016829	ATATT	2	10	380280	380289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016829	ATTTA	2	10	386444	386453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016829	TAATT	2	10	388827	388836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016829	TTTAA	2	10	388996	389005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016829	ATTTG	2	10	389052	389061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016829	TCAAA	2	10	390236	390245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016829	TAATT	2	10	390404	390413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016829	TTAAT	2	10	390584	390593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016829	AATTA	2	10	390810	390819	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016829	TAAAT	2	10	395504	395513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016829	ATAAA	2	10	410588	410597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016829	TAAAA	2	10	410612	410621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016829	ATTTT	2	10	430937	430946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016829	TAAAA	2	10	431046	431055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016829	GTGTT	2	10	431452	431461	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016829	AAATT	2	10	431731	431740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016829	TAATT	2	10	432102	432111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016829	TCATA	2	10	438668	438677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016829	TTTTA	2	10	452127	452136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016829	TAAAA	2	10	455224	455233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016829	TAAAA	2	10	473839	473848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016829	CAAAA	2	10	477010	477019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016829	AAAAT	2	10	480498	480507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016829	TTTGT	2	10	491450	491459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016829	AATTA	2	10	497663	497672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016829	GGATT	2	10	502596	502605	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016829	TTTTG	2	10	509185	509194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016829	TAAAA	2	10	515317	515326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016829	TAAAA	2	10	516718	516727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016829	TAAAT	2	10	525788	525797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016829	ATAAA	2	10	536108	536117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016829	CTTTC	2	10	544663	544672	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_016829	ATAAA	2	10	553990	553999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016829	TTGAA	2	10	556638	556647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016829	TGAAA	2	10	558070	558079	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.