MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 5372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	CTT	2	6	1468	1473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016829	T	6	6	1472	1477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016829	GTT	2	6	1479	1484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016829	T	6	6	1483	1488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016829	TATTGT	2	12	1514	1525	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016829	T	6	6	1525	1530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016829	ATAAA	2	10	1542	1551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016829	TAAT	2	8	1552	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016829	CAAA	2	8	7198	7205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016829	A	6	6	7203	7208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016829	TTTG	2	8	7214	7221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016829	AAATA	2	10	7224	7233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016829	T	12	12	7844	7855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016829	T	7	7	7877	7883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016829	ATT	2	6	9304	9309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016829	T	6	6	9308	9313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016829	AAT	2	6	9314	9319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016829	A	15	15	9327	9341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016829	T	7	7	9535	9541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016829	T	6	6	9544	9549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016829	A	6	6	9569	9574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016829	CCT	2	6	15189	15194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016829	A	7	7	15215	15221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016829	GAA	2	6	15230	15235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016829	T	7	7	15247	15253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016829	T	6	6	15288	15293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016829	AAT	2	6	17412	17417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016829	T	7	7	17424	17430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016829	T	7	7	18143	18149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016829	TAT	2	6	18171	18176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016829	A	6	6	18187	18192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016829	A	7	7	18200	18206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016829	A	7	7	18209	18215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016829	ATTTTT	2	12	18225	18236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016829	A	6	6	18272	18277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016829	A	6	6	18281	18286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016829	A	14	14	18314	18327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016829	T	8	8	18342	18349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016829	GAAAC	2	10	18389	18398	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016829	AAAAC	2	10	18434	18443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016829	TTA	2	6	18448	18453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016829	T	6	6	18463	18468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016829	CGCT	2	8	18496	18503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016829	CATG	2	8	18516	18523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016829	ACCTA	2	10	18574	18583	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016829	TTAT	2	8	18634	18641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016829	ATG	2	6	18645	18650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016829	TTAG	2	8	18702	18709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016829	GAT	2	6	18736	18741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016829	GCA	2	6	18809	18814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016829	TTC	2	6	18875	18880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016829	CTG	2	6	18891	18896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016829	GAA	2	6	18905	18910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016829	A	6	6	18909	18914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016829	TTA	2	6	18948	18953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016829	CAG	2	6	18977	18982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016829	ATT	2	6	19018	19023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016829	T	6	6	19044	19049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016829	GAA	2	6	19168	19173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016829	TA	3	6	19202	19207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016829	GAT	2	6	19276	19281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016829	TGG	2	6	19289	19294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016829	AAT	2	6	19295	19300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016829	AGT	2	6	19338	19343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016829	TCT	2	6	19449	19454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016829	GTC	2	6	19509	19514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016829	TCGTG	2	10	19518	19527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016829	TTAAG	2	10	19582	19591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016829	AGG	2	6	19619	19624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016829	GAC	2	6	19633	19638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016829	ATC	2	6	19644	19649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016829	AC	3	6	19671	19676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016829	A	6	6	19731	19736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016829	GCTAC	2	10	19807	19816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016829	AC	3	6	19841	19846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016829	TGA	2	6	19923	19928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016829	CCT	2	6	19980	19985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016829	TTA	2	6	20015	20020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016829	TAT	2	6	20117	20122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016829	T	6	6	20133	20138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016829	TAAAT	2	10	20157	20166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016829	AAT	2	6	20218	20223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016829	TAAG	2	8	20256	20263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016829	TGG	2	6	20270	20275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016829	TGA	2	6	20403	20408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016829	TAG	2	6	20453	20458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016829	GAAAA	2	10	20465	20474	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016829	AAT	2	6	20477	20482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016829	AGT	2	6	20492	20497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016829	GCGA	2	8	20499	20506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016829	TAG	2	6	20576	20581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016829	AAG	2	6	20582	20587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016829	ACC	2	6	20698	20703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016829	AGT	2	6	20814	20819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016829	A	6	6	20897	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016829	GGA	2	6	21013	21018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016829	GTA	2	6	21026	21031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016829	GGC	2	6	21168	21173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016829	AAC	2	6	21268	21273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016829	AAC	2	6	21334	21339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016829	AGC	2	6	21357	21362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016829	AAT	2	6	21412	21417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016829	TGG	2	6	21509	21514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016829	ACA	2	6	21658	21663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016829	ATG	2	6	21692	21697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016829	CAA	2	6	21746	21751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016829	TA	3	6	21758	21763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016829	T	6	6	21869	21874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016829	GAAC	2	8	21890	21897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016829	AC	3	6	21896	21901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016829	GCGA	2	8	21925	21932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016829	G	7	7	22017	22023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016829	CT	3	6	22046	22051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016829	ACG	2	6	22065	22070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016829	CGG	2	6	22155	22160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016829	ATT	2	6	22206	22211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016829	ACC	2	6	22426	22431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016829	GTG	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016829	CCT	2	6	22513	22518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016829	CGG	2	6	22648	22653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016829	CTGGAG	2	12	22774	22785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016829	CGT	2	6	22844	22849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016829	TGA	2	6	22890	22895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016829	GCT	2	6	22898	22903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016829	AAGTGT	2	12	23081	23092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016829	AT	3	6	23120	23125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016829	ATT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016829	T	7	7	23224	23230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016829	TTG	2	6	23232	23237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016829	TTG	2	6	23254	23259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016829	TAA	2	6	23261	23266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016829	AAATT	2	10	23267	23276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016829	A	7	7	23293	23299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016829	TAA	2	6	24298	24303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016829	A	7	7	24310	24316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016829	A	6	6	24326	24331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016829	CTT	2	6	24345	24350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016829	CTT	3	9	24355	24363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016829	T	6	6	24368	24373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016829	CTT	2	6	25803	25808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016829	T	6	6	25807	25812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016829	TTG	2	6	25830	25835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016829	A	7	7	25840	25846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016829	AATTT	2	10	25848	25857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016829	T	7	7	25855	25861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016829	TA	3	6	25863	25868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016829	ATT	2	6	25877	25882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016829	T	6	6	25881	25886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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