MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae 309

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016807	TGGTAA	2	12	14289	14300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016807	TATTTT	2	12	15803	15814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016807	TACTTT	2	12	46405	46416	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016807	AAAAAT	2	12	47060	47071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016807	TTTTAA	2	12	61936	61947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016807	TCTTAA	2	12	69072	69083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016807	AAATTT	2	12	107181	107192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016807	TAAATA	2	12	110422	110433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016807	GGCGAA	2	12	119036	119047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016807	ACGGGC	2	12	127825	127836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016807	CAAGCT	2	12	129397	129408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016807	GGAAGG	2	12	132470	132481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016807	AAAATA	2	12	134900	134911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016807	AGAAAA	2	12	144682	144693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016807	GTTTTC	2	12	164292	164303	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016807	CACCGC	2	12	165872	165883	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016807	GGCAGT	2	12	166125	166136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016807	TTAAAC	2	12	178347	178358	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016807	CCCAGC	2	12	190019	190030	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016807	TTTTTA	2	12	194698	194709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016807	CAAGCT	2	12	245920	245931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016807	TTTTTC	2	12	251853	251864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016807	ATTTTG	2	12	251930	251941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016807	CTTTTT	2	12	264239	264250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016807	GTTTGG	2	12	264288	264299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016807	TAGTTT	2	12	282886	282897	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016807	GATTTT	2	12	320422	320433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016807	AACAGT	2	12	322471	322482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016807	AAAATG	2	12	333814	333825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016807	TACCCG	2	12	359046	359057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016807	TCATTT	2	12	362576	362587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016807	AAATTA	2	12	362621	362632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016807	ATTTAA	2	12	371217	371228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016807	TAAAAT	2	12	406290	406301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016807	AGAAAA	2	12	413769	413780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016807	GCAAAT	2	12	439276	439287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016807	TAAAAG	2	12	481758	481769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016807	GCAACT	2	12	488547	488558	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016807	CAAGCT	2	12	492983	492994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016807	AAAATA	2	12	493505	493516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016807	CAAATA	2	12	493605	493616	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016807	TTTTTA	2	12	520041	520052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016807	AATATA	2	12	559302	559313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016807	CAGTGG	2	12	566802	566813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016807	ATTGTT	2	12	578325	578336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016807	ATCTTA	2	12	581660	581671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016807	AGGTGA	2	12	591329	591340	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016807	CAAGCT	2	12	603011	603022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016807	ATTTAA	2	12	619668	619679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016807	AATTTT	2	12	685401	685412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016807	TAATAT	2	12	685413	685424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016807	AAATAA	2	12	692623	692634	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016807	ATTTAA	2	12	717325	717336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016807	CTGTTT	2	12	775048	775059	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016807	AAAAGT	2	12	776795	776806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016807	GAAAAA	2	12	781752	781763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016807	CCTTTT	2	12	798462	798473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.