MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016804	GAG	2	6	1132382	1132387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_016804	GCC	2	6	1134030	1134035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2003	NC_016804	CTG	2	6	1135432	1135437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_016804	CCG	2	6	1135442	1135447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_016804	ACC	2	6	1135448	1135453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_016804	CCG	2	6	1136232	1136237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_016804	CCT	2	6	1138829	1138834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_016804	TGC	2	6	1138888	1138893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_016804	ACG	2	6	1138904	1138909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_016804	TTG	2	6	1139005	1139010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_016804	CCGGA	2	10	1139017	1139026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2012	NC_016804	CG	3	6	1139068	1139073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_016804	CAA	2	6	1144437	1144442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_016804	GAT	2	6	1144454	1144459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_016804	GCCA	2	8	1145276	1145283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_016804	CCGT	2	8	1145292	1145299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2017	NC_016804	GCA	2	6	1145300	1145305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_016804	ACG	2	6	1145309	1145314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_016804	G	6	6	1148771	1148776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2021	NC_016804	CGG	2	6	1148911	1148916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_016804	GGGCA	2	10	1148966	1148975	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_016804	GGT	2	6	1148981	1148986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_016804	G	6	6	1152463	1152468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2029	NC_016804	GCCG	2	8	1152669	1152676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2030	NC_016804	CGGG	2	8	1159607	1159614	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2031	NC_016804	CGG	2	6	1159626	1159631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_016804	CGA	2	6	1160104	1160109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2034	NC_016804	AGT	2	6	1161220	1161225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_016804	AAC	2	6	1161239	1161244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_016804	CA	3	6	1161250	1161255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2040	NC_016804	GTT	2	6	1161946	1161951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_016804	GGT	2	6	1161978	1161983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_016804	TTCCGT	2	12	1163243	1163254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_016804	GTT	2	6	1163276	1163281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_016804	GCC	2	6	1163293	1163298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2045	NC_016804	TG	4	8	1164152	1164159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_016804	GCCG	2	8	1164166	1164173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2047	NC_016804	TG	3	6	1164194	1164199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_016804	T	6	6	1164292	1164297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2051	NC_016804	CG	3	6	1164392	1164397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_016804	GC	3	6	1164398	1164403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_016804	GC	3	6	1164653	1164658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_016804	GAC	2	6	1164731	1164736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_016804	TTC	2	6	1164793	1164798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2057	NC_016804	CGT	2	6	1164933	1164938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_016804	GGTC	2	8	1164960	1164967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2059	NC_016804	GGC	2	6	1165037	1165042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2061	NC_016804	TGC	2	6	1165151	1165156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_016804	CTG	2	6	1165172	1165177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_016804	CAGC	2	8	1165303	1165310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_016804	CAG	2	6	1165393	1165398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_016804	CGC	2	6	1165401	1165406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2066	NC_016804	AGGT	2	8	1165409	1165416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_016804	GCG	2	6	1165508	1165513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2070	NC_016804	GATCT	2	10	1165564	1165573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2099	NC_016804	GCC	2	6	1171761	1171766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2101	NC_016804	TCG	2	6	1171797	1171802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2116	NC_016804	GCA	2	6	1175545	1175550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_016804	GT	3	6	1175590	1175595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_016804	CGAG	2	8	1175650	1175657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2119	NC_016804	CGG	2	6	1175667	1175672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2121	NC_016804	GCC	2	6	1175776	1175781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2122	NC_016804	GATCC	2	10	1175893	1175902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2123	NC_016804	TCG	2	6	1175916	1175921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2126	NC_016804	GTG	2	6	1176044	1176049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_016804	GCG	2	6	1176086	1176091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_016804	GGC	2	6	1176095	1176100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_016804	CGATC	2	10	1176103	1176112	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2130	NC_016804	CGG	2	6	1176118	1176123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_016804	GTAG	2	8	1176139	1176146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_016804	GCCT	2	8	1176173	1176180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2133	NC_016804	GC	3	6	1176181	1176186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_016804	GC	3	6	1176196	1176201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2135	NC_016804	GGCC	2	8	1176209	1176216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2136	NC_016804	CGG	2	6	1176370	1176375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2162	NC_016804	CGG	2	6	1179405	1179410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2260	NC_016804	TGG	2	6	1218100	1218105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2261	NC_016804	GAC	2	6	1218135	1218140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_016804	TGAT	2	8	1218153	1218160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_016804	GCC	2	6	1220737	1220742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2264	NC_016804	CGT	2	6	1220756	1220761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2265	NC_016804	CGC	2	6	1220831	1220836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2266	NC_016804	GGC	2	6	1220903	1220908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2267	NC_016804	GGCTG	2	10	1221918	1221927	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2268	NC_016804	TGC	2	6	1222179	1222184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2269	NC_016804	CTG	2	6	1222237	1222242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2270	NC_016804	GC	3	6	1223566	1223571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2271	NC_016804	CG	3	6	1223595	1223600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2272	NC_016804	CGG	2	6	1223604	1223609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2273	NC_016804	AGTTAC	2	12	1223639	1223650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2274	NC_016804	GC	3	6	1224492	1224497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2275	NC_016804	CGGC	2	8	1224514	1224521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2276	NC_016804	CTG	2	6	1224557	1224562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2280	NC_016804	GGGT	2	8	1224651	1224658	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2281	NC_016804	GAG	2	6	1224680	1224685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_016804	CCGGC	2	10	1226031	1226040	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2284	NC_016804	TGGC	2	8	1230333	1230340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2292	NC_016804	TCG	2	6	1233846	1233851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2293	NC_016804	CTG	2	6	1233860	1233865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2294	NC_016804	AGG	2	6	1233891	1233896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2332	NC_016804	CGGC	2	8	1263445	1263452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2373	NC_016804	TGA	2	6	1273828	1273833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2387	NC_016804	GGATC	2	10	1277420	1277429	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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