MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_016804	CCA	2	6	3908533	3908538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_016804	CCAG	2	8	3908596	3908603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7503	NC_016804	GCTG	2	8	3908688	3908695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7504	NC_016804	GCC	2	6	3908704	3908709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7505	NC_016804	CCGA	2	8	3908718	3908725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7506	NC_016804	TCG	2	6	3908753	3908758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_016804	GC	3	6	3908819	3908824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7508	NC_016804	CCGG	2	8	3908858	3908865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7509	NC_016804	CG	3	6	3908957	3908962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7510	NC_016804	TCCA	2	8	3908982	3908989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7511	NC_016804	TCGGC	2	10	3908998	3909007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7512	NC_016804	GGC	2	6	3910786	3910791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_016804	CGG	2	6	3911655	3911660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_016804	ACG	2	6	3911670	3911675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_016804	CGG	2	6	3912534	3912539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_016804	TCC	2	6	3913784	3913789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_016804	AGG	2	6	3915636	3915641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_016804	GTT	2	6	3915656	3915661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_016804	CAGC	2	8	3915689	3915696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7520	NC_016804	GATC	2	8	3915714	3915721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7521	NC_016804	GCC	2	6	3915729	3915734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7522	NC_016804	ACCA	2	8	3916697	3916704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7523	NC_016804	CGC	2	6	3918993	3918998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7524	NC_016804	CGT	2	6	3920598	3920603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_016804	GA	3	6	3920644	3920649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_016804	CGG	2	6	3922384	3922389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_016804	TCGA	2	8	3922434	3922441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7528	NC_016804	CGC	2	6	3922463	3922468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7529	NC_016804	GCCCG	2	10	3922691	3922700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7530	NC_016804	GT	3	6	3923464	3923469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_016804	GCC	2	6	3923519	3923524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7532	NC_016804	GGA	2	6	3923566	3923571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_016804	ACC	2	6	3923576	3923581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7534	NC_016804	GC	3	6	3923606	3923611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7535	NC_016804	GGT	2	6	3923618	3923623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_016804	TCG	2	6	3923644	3923649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_016804	GGC	2	6	3923670	3923675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_016804	TGC	2	6	3923720	3923725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_016804	CTGG	2	8	3923730	3923737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_016804	CGC	2	6	3923775	3923780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7541	NC_016804	GCG	2	6	3923808	3923813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_016804	CGA	3	9	3923851	3923859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_016804	CCGGC	2	10	3923912	3923921	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7544	NC_016804	GCG	2	6	3923936	3923941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_016804	CTG	2	6	3923951	3923956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_016804	GGT	2	6	3923992	3923997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_016804	GGC	2	6	3924055	3924060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_016804	CGCT	2	8	3927285	3927292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7549	NC_016804	ATT	2	6	3927319	3927324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_016804	TTG	2	6	3927336	3927341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_016804	GCG	2	6	3927392	3927397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_016804	GCG	2	6	3927482	3927487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_016804	GGC	2	6	3928835	3928840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_016804	AGT	2	6	3928892	3928897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_016804	TCAG	2	8	3930737	3930744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7556	NC_016804	CCCGA	2	10	3933594	3933603	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7557	NC_016804	GACAT	2	10	3936231	3936240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7558	NC_016804	TGC	2	6	3936241	3936246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_016804	GTG	2	6	3936275	3936280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_016804	GCG	2	6	3936283	3936288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_016804	CGG	2	6	3936301	3936306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_016804	TGT	2	6	3936309	3936314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_016804	CTTG	2	8	3943773	3943780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7564	NC_016804	GCG	2	6	3945012	3945017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_016804	GAT	2	6	3945039	3945044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_016804	CG	3	6	3945061	3945066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7567	NC_016804	CAAG	2	8	3947369	3947376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7568	NC_016804	TGCT	2	8	3947377	3947384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7569	NC_016804	CCT	2	6	3949789	3949794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_016804	GGT	2	6	3949845	3949850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_016804	CGG	2	6	3949867	3949872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_016804	GCC	2	6	3953009	3953014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7573	NC_016804	GAC	2	6	3953040	3953045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_016804	CGT	2	6	3953063	3953068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7576	NC_016804	CCG	2	6	3953987	3953992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7579	NC_016804	CGT	2	6	3954027	3954032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_016804	CTC	2	6	3955227	3955232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7581	NC_016804	AGTG	2	8	3955243	3955250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_016804	TCG	3	9	3955265	3955273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_016804	TGGA	2	8	3956015	3956022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_016804	CGG	2	6	3956099	3956104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_016804	TTC	2	6	3956146	3956151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7587	NC_016804	GCG	4	12	3956205	3956216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_016804	GAG	2	6	3956225	3956230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_016804	CAT	2	6	3966698	3966703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7593	NC_016804	AG	3	6	3970660	3970665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_016804	GTC	3	9	3974586	3974594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_016804	AC	3	6	3974620	3974625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7596	NC_016804	GTC	2	6	3974680	3974685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7598	NC_016804	CAC	2	6	3974718	3974723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7599	NC_016804	CG	3	6	3974726	3974731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7600	NC_016804	GAC	2	6	3976502	3976507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_016804	CCG	2	6	3976560	3976565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7602	NC_016804	CTG	2	6	3976569	3976574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_016804	GGA	2	6	3976606	3976611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_016804	TACA	2	8	3977370	3977377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7605	NC_016804	CCG	2	6	3977456	3977461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7606	NC_016804	CG	3	6	3977494	3977499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7607	NC_016804	TGC	2	6	3982085	3982090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_016804	GCG	2	6	3982096	3982101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_016804	CG	4	8	3982100	3982107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7610	NC_016804	AAC	2	6	3983856	3983861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_016804	CCGGT	2	10	3983971	3983980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7612	NC_016804	CGC	2	6	3983984	3983989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7613	NC_016804	CGG	2	6	3984008	3984013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_016804	ACT	3	9	3984020	3984028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7616	NC_016804	TCG	2	6	3984643	3984648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_016804	CTCG	2	8	3984661	3984668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7618	NC_016804	C	7	7	3984679	3984685	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7619	NC_016804	CGCGG	2	10	3991426	3991435	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7620	NC_016804	CGC	2	6	3991510	3991515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7621	NC_016804	CCGG	2	8	3994015	3994022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7623	NC_016804	AGG	2	6	3994097	3994102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7625	NC_016804	CGG	2	6	3996392	3996397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7628	NC_016804	TTC	2	6	3999615	3999620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_016804	ACA	2	6	3999688	3999693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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