MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016804	GCG	2	6	3165965	3165970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_016804	CG	3	6	3165975	3165980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_016804	CCA	2	6	3165991	3165996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_016804	GCG	2	6	3166021	3166026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016804	CG	3	6	3166031	3166036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_016804	CCA	2	6	3166047	3166052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_016804	GCG	2	6	3166077	3166082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_016804	CG	3	6	3166087	3166092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_016804	CCA	2	6	3166103	3166108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_016804	GCG	2	6	3166133	3166138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016804	CG	3	6	3166143	3166148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_016804	CCA	2	6	3166159	3166164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_016804	GCG	2	6	3166189	3166194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_016804	CG	3	6	3166199	3166204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_016804	CCA	2	6	3166215	3166220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_016804	GCG	2	6	3166245	3166250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_016804	CG	3	6	3166255	3166260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_016804	CTT	2	6	3171911	3171916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_016804	GA	4	8	3171962	3171969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016804	TGA	2	6	3172884	3172889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_016804	GCG	2	6	3172898	3172903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_016804	TCA	2	6	3172921	3172926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016804	TGA	2	6	3172939	3172944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016804	GCG	2	6	3172953	3172958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016804	TCA	2	6	3173000	3173005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_016804	TGA	2	6	3173018	3173023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016804	GCG	2	6	3173032	3173037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016804	TCA	2	6	3173079	3173084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_016804	TGA	2	6	3173097	3173102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016804	GCG	2	6	3173111	3173116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_016804	TCA	2	6	3173165	3173170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016804	CCT	2	6	3175322	3175327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_016804	TGT	2	6	3175346	3175351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016804	TGG	2	6	3175387	3175392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016804	GT	3	6	3175398	3175403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016804	CGA	2	6	3175423	3175428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_016804	CTG	2	6	3175457	3175462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_016804	CGG	2	6	3175483	3175488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016804	CGT	2	6	3175505	3175510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_016804	ACCA	2	8	3176669	3176676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_016804	CGGCA	2	10	3176686	3176695	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6042	NC_016804	CAC	3	9	3176723	3176731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_016804	ACG	2	6	3176744	3176749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_016804	CGCC	2	8	3176794	3176801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6045	NC_016804	TGC	2	6	3176891	3176896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_016804	A	6	6	3177006	3177011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016804	CCG	2	6	3209586	3209591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_016804	ATC	2	6	3209632	3209637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_016804	CAC	2	6	3209699	3209704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_016804	CGA	2	6	3216107	3216112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_016804	ACG	2	6	3216218	3216223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016804	C	6	6	3216230	3216235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6053	NC_016804	GTT	2	6	3216331	3216336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016804	TGC	2	6	3216425	3216430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_016804	ATT	2	6	3216461	3216466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016804	CGC	2	6	3216518	3216523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_016804	GCG	2	6	3216528	3216533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_016804	CACAT	2	10	3216535	3216544	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6059	NC_016804	TGG	2	6	3216559	3216564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016804	CTG	2	6	3216588	3216593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_016804	CGA	3	9	3221223	3221231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016804	GTT	2	6	3221270	3221275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016804	GC	3	6	3221293	3221298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_016804	GAT	2	6	3221329	3221334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016804	ACG	2	6	3221484	3221489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_016804	CAA	2	6	3221580	3221585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_016804	CGC	2	6	3221588	3221593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_016804	CTG	2	6	3221705	3221710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_016804	AGG	2	6	3221802	3221807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_016804	GCC	2	6	3223621	3223626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_016804	CTT	2	6	3223632	3223637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_016804	TCC	2	6	3223648	3223653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_016804	CGG	2	6	3223719	3223724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_016804	CGA	2	6	3223725	3223730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_016804	CGT	2	6	3223731	3223736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_016804	TGC	2	6	3223737	3223742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_016804	CCA	2	6	3223764	3223769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_016804	GTC	2	6	3223777	3223782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_016804	CCA	2	6	3223834	3223839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_016804	ACC	2	6	3223846	3223851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_016804	GAA	2	6	3223852	3223857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016804	ACC	2	6	3223860	3223865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_016804	CCT	2	6	3224760	3224765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224786	3224797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_016804	CCT	2	6	3224817	3224822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224843	3224854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_016804	CCT	2	6	3224874	3224879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224900	3224911	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_016804	CCT	2	6	3224931	3224936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224957	3224968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_016804	CCT	2	6	3224988	3224993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_016804	TCGCCG	2	12	3225014	3225025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_016804	TTC	2	6	3234098	3234103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_016804	CTTC	2	8	3235985	3235992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_016804	AG	3	6	3236006	3236011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016804	GCTGC	2	10	3236018	3236027	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6097	NC_016804	CGCGA	2	10	3236080	3236089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6098	NC_016804	GCTG	2	8	3236176	3236183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6099	NC_016804	AC	3	6	3236200	3236205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_016804	GGCT	2	8	3236211	3236218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_016804	CTG	2	6	3236255	3236260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_016804	TTCG	2	8	3236295	3236302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_016804	CCG	2	6	3236382	3236387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_016804	CCA	2	6	3236401	3236406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_016804	GCG	2	6	3236430	3236435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_016804	CGC	2	6	3236567	3236572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_016804	CTA	2	6	3237788	3237793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_016804	CG	3	6	3237844	3237849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_016804	CG	3	6	3237852	3237857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_016804	CTTCT	2	10	3237916	3237925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6111	NC_016804	GCC	2	6	3240075	3240080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_016804	GCC	2	6	3240143	3240148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_016804	GAC	2	6	3240164	3240169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_016804	GAG	2	6	3240942	3240947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016804	GCT	2	6	3240971	3240976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_016804	CCT	2	6	3241004	3241009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_016804	CGCCAC	2	12	3241036	3241047	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_016804	CAG	2	6	3241049	3241054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_016804	AG	3	6	3241084	3241089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016804	CAG	2	6	3242085	3242090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_016804	ACC	2	6	3243830	3243835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_016804	GCG	2	6	3243860	3243865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_016804	GTG	2	6	3243920	3243925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016804	TGGCC	2	10	3244092	3244101	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6125	NC_016804	TCGA	2	8	3244116	3244123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_016804	TGC	2	6	3244271	3244276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_016804	GCC	2	6	3244314	3244319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_016804	GGC	2	6	3244321	3244326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_016804	GCC	2	6	3244367	3244372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_016804	CGCCGG	2	12	3244410	3244421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_016804	AATGC	2	10	3245593	3245602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6132	NC_016804	ACCG	2	8	3245620	3245627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6133	NC_016804	CAT	2	6	3246368	3246373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6135	NC_016804	AGTC	2	8	3246393	3246400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6136	NC_016804	TGA	2	6	3246437	3246442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6142	NC_016804	TGG	2	6	3248747	3248752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6146	NC_016804	CTT	2	6	3251017	3251022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6161	NC_016804	TCG	2	6	3253076	3253081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6165	NC_016804	TCG	2	6	3253175	3253180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6243	NC_016804	TC	3	6	3294458	3294463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6244	NC_016804	TGT	2	6	3296839	3296844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_016804	TGG	2	6	3296874	3296879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_016804	A	6	6	3296885	3296890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_016804	CAGCT	2	10	3296898	3296907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6248	NC_016804	TAC	2	6	3296969	3296974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_016804	CA	3	6	3297024	3297029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6250	NC_016804	CAG	2	6	3297033	3297038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_016804	CCA	2	6	3297135	3297140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6252	NC_016804	GAT	2	6	3297149	3297154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_016804	CCA	2	6	3297165	3297170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6254	NC_016804	GCG	2	6	3298428	3298433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_016804	CCA	2	6	3298471	3298476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6256	NC_016804	GCC	2	6	3298492	3298497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6257	NC_016804	GGC	2	6	3298525	3298530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6388	NC_016804	GTC	2	6	3365255	3365260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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