MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016768	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016768	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016768	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016768	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016768	TCAA	2	8	25615	25622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016768	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016768	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016768	ACCA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016768	GCTA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016768	CTAC	2	8	47321	47328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016768	CTGG	2	8	52818	52825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016768	CGGT	2	8	79309	79316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016768	CGGT	2	8	79494	79501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016768	CTGG	2	8	87330	87337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016768	CGCA	2	8	89631	89638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016768	CGCT	2	8	97761	97768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016768	CCTG	2	8	97808	97815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016768	GCGA	2	8	97852	97859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016768	ACCG	2	8	99575	99582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016768	ATCC	2	8	125710	125717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016768	GCGA	2	8	130798	130805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016768	CGGG	2	8	130841	130848	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016768	GCTC	2	8	131353	131360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016768	CGGG	2	8	134065	134072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016768	TTCT	2	8	139981	139988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016768	ACGC	2	8	140053	140060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016768	GGGC	2	8	140145	140152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016768	AGCA	2	8	141225	141232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016768	GCCG	2	8	144031	144038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016768	GCGT	2	8	148575	148582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016768	GCGG	2	8	149641	149648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016768	GCCG	2	8	152549	152556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016768	CCGG	2	8	155862	155869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016768	GCGT	3	12	155890	155901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016768	GGCT	2	8	158036	158043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016768	CGCA	2	8	158062	158069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016768	TCGT	2	8	161753	161760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016768	CCGG	2	8	161761	161768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016768	CCCG	2	8	161973	161980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_016768	ACTT	2	8	171450	171457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016768	TTGA	2	8	186660	186667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016768	CTGG	2	8	196645	196652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016768	CTGT	2	8	212197	212204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016768	GGCC	2	8	218285	218292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016768	CGGT	2	8	218621	218628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016768	GATG	2	8	219368	219375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016768	AACT	2	8	230563	230570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016768	GGAA	2	8	230738	230745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016768	ACGT	2	8	231490	231497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016768	ACAT	2	8	231557	231564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016768	GTGC	2	8	241270	241277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016768	GAAC	2	8	248956	248963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016768	CGCA	2	8	253565	253572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016768	GACG	2	8	255974	255981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016768	GCGG	2	8	272855	272862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016768	CGGC	2	8	274221	274228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016768	TAGA	2	8	288331	288338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016768	ACTT	2	8	292036	292043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016768	TCGT	2	8	293662	293669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016768	AACT	2	8	295712	295719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016768	AACC	2	8	295720	295727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016768	ATGC	2	8	296710	296717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016768	GACG	2	8	302028	302035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016768	GGTA	2	8	336302	336309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016768	GCCG	2	8	336389	336396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016768	TGGC	2	8	336401	336408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016768	GCCG	2	8	339377	339384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016768	TGGC	2	8	339389	339396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016768	CTGT	2	8	367374	367381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016768	AATC	2	8	378644	378651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016768	GGCC	2	8	389004	389011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016768	AAGG	2	8	390020	390027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016768	TGAC	2	8	398989	398996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016768	GTCA	2	8	399000	399007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016768	ATCG	2	8	419970	419977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016768	GCCA	2	8	420061	420068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016768	GTCC	2	8	420087	420094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016768	ACGG	2	8	420173	420180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016768	GAGC	2	8	426955	426962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016768	GAGC	2	8	427006	427013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016768	GAGC	2	8	427057	427064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016768	TCCG	2	8	456149	456156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016768	GGAT	2	8	468432	468439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016768	CGAG	2	8	468575	468582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016768	CAAC	2	8	480524	480531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016768	AGAA	2	8	491031	491038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016768	GCGG	2	8	503407	503414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016768	ACCG	2	8	505287	505294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016768	CGGG	2	8	505324	505331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016768	GAGG	2	8	507280	507287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016768	GCGT	2	8	507366	507373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016768	ACGG	2	8	510616	510623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016768	GATG	2	8	515590	515597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016768	CTGA	2	8	516214	516221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016768	GCTG	2	8	521723	521730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016768	CCGT	2	8	528768	528775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016768	CGGC	2	8	534080	534087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016768	CGGC	2	8	538823	538830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016768	GACG	2	8	538833	538840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016768	CCGG	2	8	561074	561081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016768	AGCA	2	8	565218	565225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016768	CGAC	2	8	565888	565895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016768	CGCC	2	8	577778	577785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_016768	GCAT	2	8	577861	577868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016768	GTTT	2	8	586571	586578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016768	GCCG	2	8	591585	591592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016768	GCTA	2	8	596887	596894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016768	GCGT	2	8	604773	604780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016768	CCGA	2	8	604798	604805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016768	CCGA	2	8	608801	608808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016768	GTCC	2	8	611356	611363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016768	GCCC	2	8	625856	625863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016768	AGCC	2	8	630337	630344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016768	CCGG	2	8	635861	635868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016768	TGCC	2	8	640298	640305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016768	ATCG	2	8	640984	640991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016768	CGCC	2	8	641243	641250	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_016768	GCCG	2	8	651840	651847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016768	TGGC	2	8	655130	655137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016768	CCAG	2	8	657840	657847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016768	CGGT	2	8	658584	658591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016768	CGGC	2	8	663791	663798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016768	TTGC	2	8	665885	665892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016768	GTCG	2	8	665956	665963	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016768	CGGC	2	8	668785	668792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016768	GTGG	2	8	668802	668809	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016768	GCCG	2	8	672291	672298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016768	CGAA	2	8	676385	676392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016768	CGGC	2	8	677410	677417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016768	CCGG	2	8	679416	679423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016768	TTCA	2	8	684702	684709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016768	CGGA	2	8	695932	695939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016768	TCCG	2	8	697304	697311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016768	CGGG	2	8	697396	697403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016768	CCCA	2	8	704531	704538	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_016768	ACCG	2	8	704628	704635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016768	CCGC	2	8	707243	707250	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_016768	GGTC	2	8	714280	714287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016768	CGGC	2	8	728637	728644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016768	CATG	2	8	728651	728658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016768	CACC	2	8	728883	728890	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_016768	GCTG	2	8	730548	730555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016768	GACT	2	8	732215	732222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016768	AGGT	2	8	732223	732230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016768	TGCC	2	8	733818	733825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016768	AAGG	2	8	735311	735318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016768	CGCA	2	8	736564	736571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016768	AGGA	2	8	749675	749682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016768	CGGC	2	8	755308	755315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016768	TCGA	2	8	755356	755363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_016768	CGGC	2	8	2195733	2195740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_016768	AGTG	2	8	2196509	2196516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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