MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 plasmid pMARPI01

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016748	TCC	2	6	47	52	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016748	GGA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016748	CCT	2	6	790	795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016748	TAT	2	6	850	855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016748	ATT	2	6	902	907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016748	TAT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016748	ATC	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016748	CCT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016748	TAT	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016748	TAT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016748	TAT	2	6	1150	1155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016748	ATA	2	6	1161	1166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016748	TTA	2	6	1265	1270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016748	AGG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016748	TAT	2	6	2106	2111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016748	AGA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016748	GGA	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016748	CAG	2	6	3639	3644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016748	GGC	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016748	GCC	2	6	7392	7397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016748	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016748	TAA	2	6	7693	7698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016748	ATA	2	6	7809	7814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016748	AAG	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016748	AAG	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016748	CGT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016748	TTA	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016748	AAC	2	6	8404	8409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016748	TCC	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016748	ATA	2	6	8761	8766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016748	CCT	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016748	TAA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016748	AAT	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016748	ATG	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016748	GAA	2	6	9056	9061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016748	AAG	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016748	TAA	2	6	9952	9957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016748	TAT	2	6	9971	9976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016748	TAT	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016748	TAG	2	6	10103	10108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016748	TTA	2	6	10128	10133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016748	ATT	2	6	10252	10257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016748	AAT	2	6	10583	10588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016748	GTT	2	6	10646	10651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016748	AAT	2	6	10752	10757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016748	ATA	3	9	10821	10829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016748	TAT	2	6	10833	10838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016748	ATC	2	6	10868	10873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016748	TAG	2	6	10894	10899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016748	AAG	2	6	10922	10927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016748	AAG	2	6	10949	10954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016748	TTA	3	9	11072	11080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016748	GTA	2	6	11089	11094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016748	AAG	2	6	11135	11140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016748	AGA	2	6	11184	11189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016748	GAA	2	6	11221	11226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016748	CTC	2	6	11244	11249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016748	GCT	2	6	11260	11265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016748	ATA	2	6	11266	11271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016748	TTA	2	6	11361	11366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016748	TGA	2	6	11410	11415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016748	ATA	2	6	11806	11811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016748	AAT	2	6	12509	12514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016748	AAG	2	6	12553	12558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016748	CAT	2	6	12640	12645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016748	ATA	2	6	12756	12761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.