MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma putrefaciens KS1 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015946	GAATAT	2	12	2745	2756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015946	TTTTAG	2	12	4299	4310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015946	TATAAT	2	12	4660	4671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015946	ATTTAA	2	12	12324	12335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015946	TAAAAA	2	12	26564	26575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015946	CATTTA	2	12	29727	29738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015946	ATTTTT	2	12	30162	30173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015946	AATTTA	2	12	31912	31923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015946	TTAATC	2	12	36444	36455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015946	ATTATA	2	12	40990	41001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015946	TTTAAG	2	12	44852	44863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015946	TTTTAA	2	12	48087	48098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015946	TTTCTT	2	12	98143	98154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015946	AAGCAA	2	12	105581	105592	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015946	ATAAAA	2	12	105962	105973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015946	GTTTTT	2	12	116351	116362	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015946	CTAAAA	2	12	122378	122389	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015946	AATTAA	2	12	149389	149400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015946	AATGTG	2	12	150894	150905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015946	TAACTA	2	12	150906	150917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015946	TAAACC	2	12	152354	152365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015946	ATATTG	2	12	153352	153363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015946	TAATCT	2	12	185016	185027	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015946	ATTCTT	2	12	187011	187022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015946	AATTAA	2	12	197108	197119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015946	TATTAA	2	12	208010	208021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015946	AATTTT	2	12	234185	234196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015946	CAATAA	2	12	234455	234466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015946	ATTTTA	2	12	234563	234574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015946	ATAGTT	2	12	239885	239896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015946	ATTTAT	2	12	240407	240418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015946	AAATTT	2	12	240451	240462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015946	ATTTTA	2	12	243421	243432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015946	CCAGCA	2	12	245265	245276	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015946	TCTATT	2	12	246061	246072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015946	AAATTA	2	12	246525	246536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015946	CTGATC	2	12	247117	247128	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015946	TAATAC	2	12	248129	248140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015946	AAGAAA	2	12	248417	248428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015946	TTGAAC	2	12	252564	252575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015946	AATATA	2	12	257814	257825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015946	TTAATA	2	12	258319	258330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015946	AATTAC	2	12	258340	258351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015946	AATAAA	2	12	259809	259820	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015946	ATATTA	2	12	285615	285626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015946	GGAGTT	2	12	302773	302784	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015946	CTAAAA	2	12	324323	324334	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015946	TTATAA	2	12	369687	369698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015946	TAAATT	2	12	396016	396027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015946	AATTAA	2	12	426812	426823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015946	TAAAAA	2	12	429635	429646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015946	TAAAAT	2	12	429950	429961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015946	TTAAAA	2	12	430357	430368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015946	TATCAT	2	12	446199	446210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015946	ATTTTA	2	12	455131	455142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015946	AAAAAT	2	12	467823	467834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015946	TCTTTT	2	12	468429	468440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015946	TAAAAA	2	12	509908	509919	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015946	ATTATA	2	12	518916	518927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015946	ATATTA	2	12	524409	524420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015946	TTTTAT	2	12	525623	525634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015946	ATTCTA	2	12	552613	552624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015946	TAAAAA	2	12	552677	552688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015946	TAAAAA	2	12	555185	555196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015946	AATTAA	2	12	555219	555230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015946	AATTTC	2	12	562156	562167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015946	CAAAAG	2	12	569482	569493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015946	AGATTA	2	12	569799	569810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015946	TGAGTT	2	12	572447	572458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015946	AGACTT	2	12	573207	573218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015946	GATTTT	2	12	576336	576347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015946	GATTTT	2	12	577339	577350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015946	TCATTG	2	12	582950	582961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015946	TTTATT	2	12	584542	584553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015946	TTTATT	2	12	593051	593062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015946	TCAATT	2	12	597357	597368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015946	TAATTT	2	12	615689	615700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015946	AAATGA	2	12	619432	619443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015946	ACAATT	2	12	626279	626290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015946	ATTGAA	2	12	651710	651721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015946	AATATT	2	12	680892	680903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015946	TAAAAA	2	12	687411	687422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015946	ATTTTT	2	12	687503	687514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015946	ATTTAA	2	12	689360	689371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015946	ATTTAA	2	12	691303	691314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015946	ATTAAA	2	12	697836	697847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015946	CTTTCT	2	12	706080	706091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015946	TTTAAT	2	12	728861	728872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015946	TTTTAA	2	12	729028	729039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015946	ATTTTT	2	12	733070	733081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015946	GATAAT	2	12	734790	734801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015946	ATGCAC	2	12	753285	753296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015946	TTTATT	2	12	753407	753418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015946	CACTTA	2	12	755615	755626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015946	TAATTA	2	12	763544	763555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015946	TTTTTA	2	12	768428	768439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015946	TTTAAT	2	12	786847	786858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015946	TATAAA	2	12	787808	787819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015946	AAAATA	2	12	796819	796830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015946	ATAAAT	2	12	802456	802467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015946	TATTAA	2	12	808392	808403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015946	TTCAAT	2	12	811324	811335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015946	GTTCAA	2	12	814350	814361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.