MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015945	AAAAAG	2	12	46044	46055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015945	CGAAGT	2	12	68661	68672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015945	CTTTTT	2	12	74022	74033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015945	TAAAAA	2	12	79889	79900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015945	ATTCCA	2	12	92386	92397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015945	ACTTGA	2	12	134317	134328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015945	CAAATA	2	12	142759	142770	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015945	TATAAA	2	12	159761	159772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015945	CTTTAT	2	12	177296	177307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015945	CTTCCA	2	12	188653	188664	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015945	TGAACT	2	12	270460	270471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015945	CCAAAA	2	12	271766	271777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015945	TGGTTT	2	12	358987	358998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015945	AAAAAC	2	12	385128	385139	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015945	ACAATT	2	12	422131	422142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015945	TATATT	2	12	436520	436531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015945	AGAAAA	2	12	494033	494044	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015945	AAAAGC	2	12	509660	509671	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015945	CAAGTT	2	12	636591	636602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015945	TGTAAA	2	12	671312	671323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015945	AAAAGG	2	12	689276	689287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015945	CTTGAA	6	36	693157	693192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015945	ATTTTA	2	12	788830	788841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015945	AATTGA	2	12	789665	789676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015945	AAAATA	2	12	790779	790790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015945	GATAAT	2	12	807593	807604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015945	TCAACG	2	12	817237	817248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015945	CAAGTT	2	12	853718	853729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015945	ATTTTG	2	12	868453	868464	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015945	ACTTGA	2	12	957612	957623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015945	TGTTAA	2	12	969296	969307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015945	TTCACC	2	12	988392	988403	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015945	TAAAAA	2	12	994978	994989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015945	CTAAAT	2	12	997462	997473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015945	AAATAA	2	12	1037907	1037918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015945	ACAAAA	2	12	1037944	1037955	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015945	AATTAA	2	12	1038197	1038208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015945	AATATA	2	12	1108618	1108629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015945	TACAAA	2	12	1127036	1127047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015945	TCCTTA	2	12	1135759	1135770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015945	CGAAAA	2	12	1144231	1144242	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015945	TAATAT	2	12	1207790	1207801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015945	TTTTAA	2	12	1207932	1207943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015945	CAAAAT	2	12	1216392	1216403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015945	TAAAAA	2	12	1246584	1246595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015945	CTTGAA	2	12	1316866	1316877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015945	TTTCTT	2	12	1320273	1320284	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015945	AGAAAC	2	12	1320428	1320439	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015945	ACTTAA	2	12	1325653	1325664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015945	TGAACT	2	12	1371880	1371891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015945	CCTTTG	2	12	1467596	1467607	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015945	CAATAT	2	12	1496945	1496956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015945	TGGCAG	2	12	1568131	1568142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015945	CTTGAA	2	12	1570159	1570170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015945	TTGATG	2	12	1570322	1570333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015945	AGTGCA	2	12	1574250	1574261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015945	TTATCA	2	12	1595499	1595510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015945	ACTGTT	2	12	1622498	1622509	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015945	TAAAAA	2	12	1636618	1636629	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015945	AAATCA	2	12	1671347	1671358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015945	TTACCG	2	12	1713180	1713191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015945	GACGAA	2	12	1718829	1718840	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015945	TTTTTG	2	12	1729914	1729925	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015945	ATTTTG	2	12	1769037	1769048	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015945	CGAAGT	2	12	1783906	1783917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015945	GATTTT	2	12	1801991	1802002	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015945	CCAAAG	4	24	1850604	1850627	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015945	CTAAAA	2	12	1867136	1867147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015945	TCAAGG	2	12	1878210	1878221	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015945	AATTTG	2	12	1880604	1880615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015945	CGAAGT	2	12	1972625	1972636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015945	TTTAAG	2	12	1975252	1975263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015945	TAAAAC	2	12	1985020	1985031	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015945	AATGTT	2	12	2072220	2072231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015945	CTGGTA	2	12	2098413	2098424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015945	AGTCGA	2	12	2098952	2098963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015945	CGAAGC	2	12	2101841	2101852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015945	TTAAAT	2	12	2129946	2129957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015945	AAGGGT	2	12	2134391	2134402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015945	TTTTTA	2	12	2179871	2179882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015945	AGTTCA	3	18	2233443	2233460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015945	GAACTT	2	12	2249799	2249810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015945	GGTAAA	2	12	2265884	2265895	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015945	GAAAAT	2	12	2280241	2280252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015945	ATAAAA	2	12	2353391	2353402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015945	ATTTTT	2	12	2353431	2353442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015945	CCAAAA	2	12	2378141	2378152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015945	AGTAAC	2	12	2405685	2405696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015945	AAATCA	2	12	2414400	2414411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015945	CGTTGA	2	12	2468766	2468777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015945	ATGAAA	2	12	2582271	2582282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015945	AAAAAC	2	12	2590721	2590732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015945	AAATTT	2	12	2611166	2611177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015945	AAAATT	2	12	2624614	2624625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015945	GATTTT	2	12	2649364	2649375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015945	AATTAA	2	12	2708732	2708743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015945	TTTCAG	2	12	2783106	2783117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015945	ACGCTA	2	12	2788652	2788663	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015945	TGGGAG	2	12	2795718	2795729	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015945	ATAAAA	2	12	2815656	2815667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015945	CAAGGC	2	12	2827536	2827547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015945	TGTCCG	2	12	2841457	2841468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015945	GCAAAT	2	12	2845045	2845056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015945	TAAAGA	2	12	2848518	2848529	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015945	TTAATT	2	12	2930096	2930107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015945	ATAAGT	2	12	2932034	2932045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015945	AATTAA	2	12	2960187	2960198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015945	TGGAAC	2	12	2983779	2983790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015945	AATTTT	2	12	2984395	2984406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015945	AACAGG	2	12	2993064	2993075	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015945	TACTAA	2	12	3002403	3002414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015945	CACCAA	2	12	3005846	3005857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015945	TGGTAT	2	12	3056645	3056656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015945	GTTGGA	2	12	3124801	3124812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015945	ATGTTT	2	12	3232028	3232039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015945	ATTTAA	2	12	3237060	3237071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015945	TCAAGT	2	12	3302012	3302023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015945	GCAGTA	2	12	3302077	3302088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015945	TATTCT	2	12	3315009	3315020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015945	ACAAGC	2	12	3333790	3333801	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015945	TAAAAA	2	12	3369863	3369874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015945	ATATTT	2	12	3375654	3375665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015945	TGTTAT	2	12	3448581	3448592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015945	TCCAGA	2	12	3452098	3452109	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015945	TCAAGT	2	12	3478310	3478321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015945	AGGTGG	2	12	3493841	3493852	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015945	CGAAAA	2	12	3516194	3516205	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015945	TCAATC	2	12	3516401	3516412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015945	ACTGCC	2	12	3516617	3516628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015945	CACTGC	2	12	3516734	3516745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015945	TCAAGT	2	12	3555836	3555847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015945	ACTTGA	2	12	3579138	3579149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_015945	TTCAAG	2	12	3599686	3599697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015945	TCAAGT	2	12	3616587	3616598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015945	ACTGCT	2	12	3616723	3616734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015945	CTTTAT	2	12	3616857	3616868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015945	TAACCG	2	12	3630273	3630284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015945	TCCAAT	2	12	3630454	3630465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015945	AATCAT	2	12	3630882	3630893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_015945	TGTTCT	2	12	3652577	3652588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_015945	GCATTG	2	12	3676079	3676090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_015945	TTCGTT	2	12	3763595	3763606	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_015945	ACCTCA	2	12	3783786	3783797	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015945	AGCGAA	2	12	3832654	3832665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_015945	TTTTTG	2	12	3834660	3834671	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.