MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015873	TTCC	2	8	10299	10306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015873	TGAA	2	8	13939	13946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015873	AGTT	2	8	18462	18469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015873	CTCC	2	8	19135	19142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015873	AGAA	2	8	19181	19188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015873	GAGG	2	8	19268	19275	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015873	ACCT	2	8	36695	36702	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015873	TATT	2	8	40927	40934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015873	GGCC	2	8	43294	43301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015873	ACTC	2	8	44767	44774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015873	GAAT	2	8	45618	45625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015873	CTTT	2	8	45628	45635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015873	CTTG	2	8	46124	46131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015873	CTTT	2	8	47397	47404	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015873	AGTT	2	8	50702	50709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015873	CTGA	2	8	50777	50784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015873	TCAA	2	8	51446	51453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015873	ATGA	2	8	51535	51542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015873	TGCC	2	8	51562	51569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015873	CAAA	2	8	54145	54152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015873	GTTA	2	8	55849	55856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015873	GAAA	2	8	55860	55867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015873	GGAT	2	8	57983	57990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015873	TATT	2	8	58035	58042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015873	CATT	2	8	75438	75445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015873	TTTC	2	8	75582	75589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015873	TGTT	2	8	75814	75821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015873	AAAT	2	8	75831	75838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015873	ATGG	2	8	80846	80853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015873	ATTT	2	8	83648	83655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015873	TTCA	2	8	94194	94201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015873	CTTT	2	8	94293	94300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015873	CCGT	2	8	97333	97340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015873	TTTA	2	8	112046	112053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015873	AGGC	2	8	113384	113391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015873	TTAT	2	8	113449	113456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015873	AATG	2	8	113607	113614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015873	TTCA	2	8	113693	113700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015873	ATTA	2	8	117880	117887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015873	CGTT	2	8	124227	124234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015873	TCGT	2	8	124254	124261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015873	TATG	2	8	129099	129106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015873	AGTT	2	8	131773	131780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015873	TAAT	2	8	134730	134737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015873	TTCA	2	8	137603	137610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015873	CCGT	2	8	147949	147956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015873	AGAA	2	8	156333	156340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015873	CCAA	2	8	158542	158549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015873	TGGA	2	8	163836	163843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015873	GCCT	2	8	163870	163877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015873	CTGA	2	8	165294	165301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015873	CATA	2	8	168687	168694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015873	TAAC	2	8	174054	174061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015873	CAAA	2	8	174269	174276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015873	GTTA	2	8	175973	175980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015873	GAAA	2	8	175984	175991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015873	TTAA	2	8	181595	181602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015873	CTTT	2	8	182900	182907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015873	ACTA	2	8	185606	185613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015873	ATCC	2	8	187957	187964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015873	TGGC	2	8	188029	188036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015873	AAGA	2	8	189334	189341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015873	GTAT	2	8	193685	193692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015873	TCAG	2	8	194812	194819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015873	GGGC	2	8	198548	198555	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015873	AAAC	2	8	204637	204644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015873	TCTG	2	8	207245	207252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015873	TTAC	2	8	207329	207336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015873	GGTC	2	8	207917	207924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015873	TCCG	2	8	208289	208296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015873	ACCT	2	8	209116	209123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015873	CCTT	2	8	209155	209162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015873	CCTG	2	8	209357	209364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015873	AACT	2	8	209934	209941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015873	TCGC	2	8	210372	210379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015873	CTTA	2	8	210597	210604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015873	AATG	2	8	210730	210737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015873	GGCT	2	8	210853	210860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015873	CAAT	2	8	211316	211323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015873	ATTG	2	8	212366	212373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015873	TTCA	2	8	212425	212432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015873	GCCG	2	8	212639	212646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015873	TCGT	2	8	212682	212689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015873	TCAG	2	8	227452	227459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015873	TCAG	2	8	228064	228071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015873	TCAG	2	8	228210	228217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015873	CCGG	2	8	230281	230288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015873	AGAC	2	8	232041	232048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015873	TGAT	2	8	234779	234786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015873	GCCT	2	8	239939	239946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015873	TTTA	2	8	242992	242999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015873	TGGT	2	8	244352	244359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015873	AAGC	2	8	245596	245603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015873	AAAG	2	8	245914	245921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015873	ATCC	2	8	246198	246205	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015873	GCTG	2	8	246277	246284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015873	GCTT	2	8	246510	246517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015873	AAGA	2	8	247413	247420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015873	AAGA	2	8	247746	247753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015873	CTAT	2	8	248053	248060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015873	ATGA	2	8	248132	248139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015873	ATTG	2	8	250451	250458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015873	TAAT	2	8	250673	250680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015873	AATA	2	8	251187	251194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015873	TAAC	2	8	255859	255866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015873	CTTT	2	8	265786	265793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015873	GAAT	2	8	266220	266227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015873	TCCT	2	8	270172	270179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015873	AGCT	2	8	270321	270328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015873	TTGA	2	8	270509	270516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015873	AGCC	2	8	270670	270677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015873	AACA	2	8	274271	274278	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015873	GCAA	2	8	280292	280299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015873	CCTT	2	8	280305	280312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015873	TTGA	2	8	280725	280732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015873	AACG	2	8	280799	280806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015873	CGGC	2	8	289204	289211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015873	TTTA	2	8	290928	290935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015873	ATAA	2	8	291162	291169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015873	TAGA	2	8	291194	291201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015873	CAAA	2	8	292426	292433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015873	CTAA	2	8	297946	297953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015873	TTAA	2	8	297983	297990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015873	TTTC	2	8	299247	299254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015873	GAAC	2	8	304069	304076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015873	GAAA	2	8	310471	310478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015873	CCCT	2	8	323923	323930	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_015873	TTCG	2	8	323932	323939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015873	TGCC	2	8	324294	324301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015873	AGCC	2	8	324382	324389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015873	AAAG	2	8	338768	338775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015873	GATA	2	8	339778	339785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015873	GTTT	2	8	339790	339797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015873	CTGG	2	8	349265	349272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015873	CAAA	2	8	349336	349343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015873	GCAC	2	8	349365	349372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015873	CCAG	2	8	349429	349436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015873	GCAG	2	8	350337	350344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015873	TGCC	2	8	355414	355421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015873	CATT	2	8	363820	363827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015873	ACAG	2	8	375421	375428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015873	ATCA	2	8	375433	375440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015873	ATTA	2	8	380403	380410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015873	CAAT	2	8	380426	380433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015873	CATT	2	8	381488	381495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015873	GCAG	2	8	384101	384108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015873	CAGG	2	8	385870	385877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015873	CGTC	2	8	385935	385942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015873	CTCC	2	8	386275	386282	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_015873	CTTT	2	8	389666	389673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015873	ACTG	2	8	391122	391129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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