MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 10353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015848	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015848	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015848	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015848	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015848	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015848	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015848	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015848	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015848	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015848	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015848	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015848	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015848	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015848	TCG	2	6	10809	10814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015848	TCC	2	6	10894	10899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015848	GGC	2	6	10969	10974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015848	GTC	2	6	10976	10981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015848	CCT	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015848	ACCCG	2	10	11226	11235	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015848	CGG	2	6	11267	11272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015848	ACG	2	6	11329	11334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015848	ACC	2	6	11372	11377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015848	ACC	3	9	11442	11450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015848	GCC	2	6	11479	11484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015848	GCAC	2	8	11555	11562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015848	CCG	2	6	11584	11589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015848	CGA	2	6	11641	11646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015848	ACT	2	6	11688	11693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015848	CAT	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015848	GAC	2	6	11810	11815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015848	GCC	2	6	12262	12267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015848	CGG	2	6	12342	12347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015848	GCCC	2	8	12400	12407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015848	TCG	2	6	12981	12986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015848	CAC	2	6	13524	13529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015848	CGACC	2	10	13619	13628	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_015848	ATTC	2	8	13638	13645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015848	CGG	2	6	13649	13654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015848	GAC	2	6	13979	13984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015848	C	6	6	23154	23159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_015848	GC	3	6	23170	23175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015848	TCG	2	6	23201	23206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015848	GGT	2	6	23763	23768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015848	TCG	2	6	25405	25410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015848	TCAA	2	8	25443	25450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015848	GAGC	2	8	25471	25478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015848	GGCC	2	8	25485	25492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015848	CCG	2	6	25506	25511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015848	CTA	2	6	25541	25546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015848	TCC	2	6	25558	25563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015848	GTT	2	6	25565	25570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015848	TCG	3	9	25685	25693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015848	GCC	2	6	25699	25704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015848	AAC	2	6	26811	26816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015848	CGT	2	6	26829	26834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015848	CTT	2	6	26880	26885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015848	CGAGC	2	10	26897	26906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015848	CCT	2	6	27379	27384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015848	TA	3	6	27455	27460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015848	GTA	2	6	27494	27499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015848	AC	3	6	29589	29594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015848	GCG	2	6	31016	31021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015848	ACCGCG	2	12	31022	31033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015848	ACCA	2	8	31057	31064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015848	CGG	2	6	31068	31073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015848	CAA	2	6	31103	31108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015848	GAG	2	6	31109	31114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015848	GGC	2	6	31806	31811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015848	TCG	2	6	31866	31871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015848	TGC	3	9	31875	31883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015848	AC	3	6	31928	31933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015848	CAC	2	6	31938	31943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015848	GAT	2	6	31967	31972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015848	TGG	2	6	33132	33137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015848	G	6	6	33136	33141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015848	GCTA	2	8	33788	33795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015848	CGG	2	6	33847	33852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015848	TGG	2	6	33929	33934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015848	CGG	2	6	34000	34005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015848	GGT	2	6	34061	34066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015848	GT	3	6	34112	34117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015848	TCA	2	6	38896	38901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015848	CG	3	6	38917	38922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015848	GC	3	6	38927	38932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015848	CT	3	6	38967	38972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015848	CG	3	6	38974	38979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015848	GC	3	6	38984	38989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015848	CT	3	6	39023	39028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015848	CG	3	6	39030	39035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015848	GC	3	6	39040	39045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015848	CT	3	6	39079	39084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015848	CG	3	6	39086	39091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015848	GC	3	6	39096	39101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015848	CAC	2	6	39876	39881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015848	TCG	2	6	39898	39903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015848	GCC	2	6	41272	41277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015848	GGT	2	6	41333	41338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015848	GAT	2	6	41341	41346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015848	CCG	3	9	41965	41973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015848	AGC	2	6	41984	41989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015848	GCGTC	2	10	41990	41999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015848	GCC	3	9	42414	42422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015848	CGT	2	6	43449	43454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015848	GTG	2	6	43526	43531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015848	CGG	2	6	46525	46530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015848	CGG	2	6	46592	46597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015848	CTAC	2	8	47265	47272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015848	GCT	2	6	47382	47387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015848	ATCGG	2	10	47397	47406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015848	GTG	2	6	50046	50051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015848	CCT	2	6	51781	51786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015848	ACG	2	6	51812	51817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015848	AT	3	6	51849	51854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015848	ACA	2	6	51860	51865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015848	TAG	2	6	52752	52757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015848	CTGG	2	8	52762	52769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015848	CCG	2	6	52786	52791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015848	CAA	2	6	52800	52805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015848	GGT	2	6	52824	52829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015848	CGT	2	6	52838	52843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015848	GTC	2	6	53309	53314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015848	GCG	2	6	53317	53322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015848	CG	3	6	53326	53331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015848	CGA	2	6	53369	53374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015848	TCC	2	6	53389	53394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015848	GC	3	6	53464	53469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015848	CGC	2	6	53482	53487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015848	GAG	2	6	53499	53504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015848	GCC	2	6	53520	53525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015848	CCG	2	6	53538	53543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015848	G	6	6	53545	53550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015848	TGG	2	6	53558	53563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015848	GCC	2	6	53582	53587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015848	C	6	6	53592	53597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_015848	GCCG	2	8	53616	53623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015848	TGC	2	6	57451	57456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015848	CGC	2	6	58078	58083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015848	TCG	2	6	58087	58092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015848	GGT	2	6	58115	58120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015848	CCT	2	6	58187	58192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_015848	AGG	2	6	58225	58230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015848	TGA	2	6	58231	58236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015848	GAA	3	9	58588	58596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015848	GCC	2	6	58605	58610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_015848	GCC	2	6	65585	65590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_015848	GTT	2	6	103177	103182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015848	AGGTC	2	10	103184	103193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_015848	CGG	2	6	103251	103256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_015848	GAC	2	6	104062	104067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_015848	CG	3	6	104092	104097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_015848	GCC	3	9	104117	104125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_015848	GAG	2	6	104160	104165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015848	GTG	3	9	107215	107223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015848	TGG	2	6	107256	107261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015848	GAG	2	6	108856	108861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015848	GGC	2	6	108871	108876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_015848	GAGAA	2	10	110284	110293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015848	CG	3	6	121255	121260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
277	NC_015848	GAT	2	6	123270	123275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015848	GAG	2	6	123352	123357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_015848	CTC	2	6	125741	125746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_015848	CGG	2	6	127417	127422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015848	GC	3	6	127525	127530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_015848	CCT	2	6	127834	127839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_015848	GCACG	2	10	127879	127888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
285	NC_015848	ATCC	2	8	129142	129149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_015848	GC	4	8	129191	129198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
287	NC_015848	CGT	2	6	129253	129258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_015848	CGT	2	6	129546	129551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_015848	GAC	2	6	129608	129613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_015848	CGT	2	6	129733	129738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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300	NC_015848	GCC	2	6	129890	129895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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311	NC_015848	CCG	2	6	130249	130254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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319	NC_015848	CGG	2	6	130651	130656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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330	NC_015848	ACC	2	6	130908	130913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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332	NC_015848	GCG	2	6	131031	131036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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410	NC_015848	CAC	2	6	134068	134073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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412	NC_015848	CGGG	2	8	134273	134280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
413	NC_015848	ACG	2	6	134330	134335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_015848	G	6	6	134438	134443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
415	NC_015848	CGA	2	6	134445	134450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_015848	CGG	2	6	134779	134784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_015848	GGT	2	6	134796	134801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_015848	CGA	2	6	143570	143575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_015848	TGT	2	6	147451	147456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_015848	TCC	2	6	151342	151347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_015848	GTG	2	6	151369	151374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015848	CAG	2	6	151380	151385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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484	NC_015848	GAG	3	9	157960	157968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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