MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis Hubei-1 chromosome

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015725	AATT	2	8	1472	1479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015725	TCCC	2	8	3005	3012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015725	ATTT	2	8	3127	3134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015725	TATT	2	8	21067	21074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015725	TGAA	3	12	22689	22700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015725	TTTA	2	8	24676	24683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015725	ATTA	2	8	26638	26645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015725	ATTT	2	8	51262	51269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015725	TAAA	2	8	51270	51277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015725	AAGA	2	8	51405	51412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015725	ATAA	2	8	52172	52179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015725	CAAC	2	8	55398	55405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015725	AAGT	2	8	56414	56421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015725	ACTT	2	8	56424	56431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015725	GTTT	2	8	56432	56439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015725	ACAA	2	8	56543	56550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015725	ATGT	2	8	56554	56561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015725	AATT	2	8	56567	56574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015725	TAAT	2	8	58995	59002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015725	AGAA	2	8	60196	60203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015725	ATTT	2	8	60211	60218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015725	AAAT	2	8	63170	63177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015725	TATT	2	8	67799	67806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015725	AATT	2	8	72109	72116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015725	AATT	2	8	77005	77012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015725	TAAA	2	8	78875	78882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015725	TTTA	2	8	102563	102570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015725	ATAA	2	8	105104	105111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015725	ATTA	2	8	105633	105640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015725	TTTA	2	8	108568	108575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015725	AACT	2	8	109386	109393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015725	ATTT	2	8	111719	111726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015725	AATA	2	8	111758	111765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015725	CTTT	2	8	115894	115901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015725	TAAT	2	8	117946	117953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015725	TTTA	2	8	118122	118129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015725	TACA	2	8	118200	118207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015725	AAAG	2	8	118302	118309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015725	GCTT	2	8	128205	128212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015725	CAAA	2	8	128763	128770	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015725	TTTA	2	8	146458	146465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015725	TTTA	2	8	155049	155056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015725	ATAA	3	12	155408	155419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015725	ATGA	2	8	160606	160613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015725	TTAT	2	8	160705	160712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015725	TAAT	2	8	162178	162185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015725	CAAA	2	8	162263	162270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015725	ACAA	2	8	162465	162472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015725	TAAT	2	8	168834	168841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015725	ATTA	2	8	176231	176238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015725	AATT	2	8	180257	180264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015725	ATTG	2	8	182112	182119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015725	ATAA	2	8	183397	183404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015725	ATTT	2	8	183425	183432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015725	GCAA	2	8	183446	183453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015725	GATA	2	8	188904	188911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015725	AATT	2	8	191063	191070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015725	GTTT	2	8	191129	191136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015725	CTTT	2	8	195447	195454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015725	TTTA	2	8	197102	197109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015725	AGAA	2	8	200009	200016	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015725	ATAA	2	8	204043	204050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015725	GTAT	2	8	205959	205966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015725	ACTT	2	8	206121	206128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015725	TACA	2	8	206216	206223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015725	TAAT	2	8	206227	206234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015725	ACTA	2	8	211054	211061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015725	TTAT	2	8	215250	215257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015725	ATTA	2	8	216976	216983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015725	ATTA	2	8	223711	223718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015725	TTAA	2	8	225430	225437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015725	ATAA	2	8	227528	227535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015725	AAAT	2	8	228152	228159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015725	TTTA	2	8	232467	232474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015725	TTTA	2	8	232641	232648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015725	ATAA	2	8	234253	234260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015725	ACTT	2	8	237530	237537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015725	TAAA	2	8	238486	238493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015725	TTTA	2	8	239198	239205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015725	AGCT	2	8	239212	239219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015725	TATT	2	8	243243	243250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015725	TTTA	2	8	243988	243995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015725	TAAA	2	8	244012	244019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015725	ATTT	2	8	244188	244195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015725	CTAA	2	8	244216	244223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015725	AATA	2	8	244569	244576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015725	TGAA	2	8	244579	244586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015725	TAAA	2	8	256234	256241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015725	TTGA	2	8	256340	256347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015725	ATTG	2	8	256510	256517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015725	TTTA	2	8	258171	258178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015725	CTAT	2	8	260621	260628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015725	ATTT	2	8	260629	260636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015725	ATAA	2	8	262193	262200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015725	ATAA	2	8	262256	262263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015725	TATT	2	8	262342	262349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015725	TAAT	2	8	272296	272303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015725	AATT	2	8	274616	274623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015725	ATTA	2	8	274718	274725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015725	ATTT	2	8	275250	275257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015725	ATTA	3	12	276716	276727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015725	ATTT	2	8	276809	276816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015725	GCCT	2	8	276968	276975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015725	GTAG	2	8	277504	277511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015725	GCAA	2	8	279400	279407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015725	AATT	2	8	283019	283026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015725	TTAT	2	8	283075	283082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015725	TATT	2	8	284706	284713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015725	AAAT	2	8	286699	286706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015725	CATG	2	8	286889	286896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015725	TCCC	2	8	287159	287166	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_015725	TAAT	2	8	287249	287256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015725	CTTT	2	8	287271	287278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015725	ACCA	2	8	288136	288143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015725	ATTT	2	8	294177	294184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015725	TAAT	2	8	294211	294218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015725	CATA	2	8	294584	294591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015725	ATTT	2	8	307384	307391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015725	ACTT	2	8	308576	308583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015725	TGCT	2	8	310732	310739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015725	TAAA	2	8	324761	324768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015725	AAAT	2	8	326221	326228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015725	TCAA	2	8	326296	326303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015725	TTAA	2	8	327697	327704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015725	TAAA	2	8	328774	328781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015725	TATT	2	8	332177	332184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015725	TTAA	2	8	334380	334387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015725	TTTA	2	8	335847	335854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015725	TTAT	2	8	341634	341641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015725	ACAA	2	8	351097	351104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015725	TTAT	2	8	354255	354262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015725	TAAT	2	8	354996	355003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015725	CTTT	2	8	358736	358743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015725	TATT	2	8	372792	372799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015725	GATA	3	12	382656	382667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015725	AATT	2	8	382693	382700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015725	ACTT	2	8	383938	383945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015725	TGCT	2	8	385088	385095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015725	ATTA	2	8	388202	388209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015725	ATAA	2	8	395404	395411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015725	ACTT	2	8	397722	397729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015725	CTTA	2	8	397911	397918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015725	AATA	2	8	397960	397967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015725	CTTT	2	8	400359	400366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015725	ATTT	2	8	402730	402737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015725	ATAG	2	8	403353	403360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015725	CTAT	2	8	403370	403377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015725	GTTT	2	8	406544	406551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015725	AATT	2	8	407217	407224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015725	ATAC	2	8	408564	408571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015725	AAAT	2	8	409662	409669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015725	CTTT	2	8	411113	411120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.