MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	ATTATC	2	12	210	221	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015676	ATTGTA	2	12	27061	27072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015676	TGATGG	2	12	41941	41952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015676	GTAACA	2	12	42774	42785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015676	TAATCT	2	12	59854	59865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015676	AGGTGG	2	12	75366	75377	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015676	ATTTAT	2	12	96933	96944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015676	GTGTTT	2	12	106269	106280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015676	TCAATA	2	12	124943	124954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015676	TTAAAA	2	12	136791	136802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015676	TAAGTT	2	12	142972	142983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015676	AAGATT	2	12	143744	143755	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015676	AAATGA	2	12	174622	174633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015676	CAACAG	2	12	204330	204341	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015676	GTAGGT	2	12	204559	204570	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015676	CTAATA	2	12	209858	209869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015676	ATCTGT	2	12	223174	223185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015676	TGATGG	2	12	267696	267707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015676	GTAACA	2	12	268528	268539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015676	TCATTT	2	12	288479	288490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015676	CTGGAT	2	12	292976	292987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015676	TATATC	2	12	317162	317173	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015676	ATATTA	2	12	321927	321938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015676	TTTCCT	2	12	331904	331915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015676	TCTTTG	2	12	333515	333526	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015676	TTCTGC	2	12	333572	333583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015676	ATTTGA	2	12	350457	350468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015676	GATTCT	2	12	362313	362324	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015676	TTGATT	2	12	362356	362367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015676	AAATTT	2	12	372826	372837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015676	AATTTG	2	12	401368	401379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015676	TTAATA	2	12	422794	422805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015676	AGATAT	2	12	427813	427824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015676	ACAGAT	2	12	434609	434620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015676	TTACTG	2	12	454787	454798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015676	TTTAAT	2	12	481896	481907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015676	AATAGA	2	12	501974	501985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015676	TACAGC	2	12	533087	533098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015676	TTTATT	2	12	550152	550163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015676	ATGTAT	2	12	580925	580936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015676	ACCACA	2	12	591467	591478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015676	ATAATT	2	12	599237	599248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015676	TACAAT	2	12	603001	603012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015676	ATTTTT	2	12	604723	604734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015676	CACAAA	2	12	608806	608817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015676	ATTTAT	2	12	619626	619637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015676	ATATGT	2	12	651234	651245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015676	TTGTAG	2	12	662995	663006	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015676	TAAAAA	2	12	663790	663801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015676	ATTAAT	2	12	670225	670236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015676	ATTTTT	2	12	672899	672910	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015676	AAAAAT	2	12	730388	730399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015676	TAAATT	2	12	733375	733386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015676	ATAATT	2	12	735741	735752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015676	TAATGT	2	12	781242	781253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015676	TTCTTA	2	12	781268	781279	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015676	TCTACT	2	12	799540	799551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015676	ATATGA	2	12	815526	815537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015676	AGTATC	2	12	843202	843213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015676	ATCTAA	2	12	870485	870496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015676	AATTTA	2	12	890566	890577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015676	ATTTAT	2	12	891905	891916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015676	ACAAAT	2	12	899130	899141	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015676	TAATTA	2	12	908243	908254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015676	TCATAC	2	12	920023	920034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015676	CATAAA	2	12	945500	945511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015676	TATTTA	2	12	961186	961197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015676	TAATTT	2	12	981551	981562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015676	ATTTTT	2	12	994730	994741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015676	TTTATA	2	12	1007094	1007105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015676	CTTTAT	2	12	1008897	1008908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015676	ATTTTT	2	12	1010436	1010447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015676	ATATTT	2	12	1070734	1070745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015676	TTTAAT	2	12	1070953	1070964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015676	TAAAAT	2	12	1080616	1080627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015676	ATTTTA	2	12	1092622	1092633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015676	ATCTCC	2	12	1113375	1113386	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015676	GAATAT	2	12	1119761	1119772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015676	AATATA	2	12	1124226	1124237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015676	TATAAT	2	12	1125411	1125422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015676	TTTAAT	2	12	1144852	1144863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015676	ATTACT	2	12	1151390	1151401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015676	ATTTTT	2	12	1173755	1173766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015676	TCAATT	2	12	1187275	1187286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015676	TTATAT	2	12	1224762	1224773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015676	CTGTTA	2	12	1235122	1235133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015676	CCATCA	2	12	1235955	1235966	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015676	ACCCGT	2	12	1238026	1238037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015676	ATAAAA	2	12	1241661	1241672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015676	AAAATT	2	12	1246910	1246921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015676	ATATGT	2	12	1259219	1259230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015676	TATAAT	2	12	1259699	1259710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015676	CAAAAT	2	12	1260057	1260068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015676	TACTAT	2	12	1264389	1264400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015676	CTTTCA	2	12	1294660	1294671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015676	TATTTC	2	12	1298404	1298415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015676	CAGTAA	2	12	1324150	1324161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015676	ATTATA	2	12	1333828	1333839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015676	AATAAA	2	12	1348854	1348865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015676	TTTGAT	2	12	1352163	1352174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015676	ATTTTC	2	12	1382931	1382942	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015676	CCTTAG	2	12	1408489	1408500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015676	TTGTAA	2	12	1410313	1410324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015676	GAAAAA	2	12	1447040	1447051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015676	AATTTT	2	12	1447666	1447677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015676	TTGATC	2	12	1451712	1451723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015676	ATAAAA	2	12	1472265	1472276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015676	TTAGTC	2	12	1562595	1562606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015676	ATTCAT	2	12	1562784	1562795	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015676	CCTTCC	2	12	1567283	1567294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015676	AAAATA	2	12	1595366	1595377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015676	ATCAAT	2	12	1595445	1595456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015676	TCAATC	2	12	1617852	1617863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015676	AACCAA	2	12	1623835	1623846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015676	TGCAAA	2	12	1684182	1684193	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015676	TATAAA	2	12	1686644	1686655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015676	ATTAAA	2	12	1701696	1701707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015676	AAAATA	2	12	1718391	1718402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015676	TAAAAA	2	12	1718442	1718453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015676	TATTTT	2	12	1726121	1726132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015676	ACCTGA	2	12	1731993	1732004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015676	ATCTTA	2	12	1732023	1732034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015676	ATTTGT	2	12	1763278	1763289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015676	AAATTG	2	12	1763356	1763367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015676	TATAAA	2	12	1821118	1821129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015676	AATTTA	2	12	1836464	1836475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015676	ATAAAA	2	12	1961843	1961854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015676	AATATT	2	12	1971226	1971237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015676	AAATAT	2	12	2049502	2049513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015676	CCAGCA	2	12	2072277	2072288	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015676	TAATTA	2	12	2127824	2127835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.