MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 1078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	ATTT	2	8	1506	1513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015676	ATAG	2	8	4819	4826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015676	GTTT	2	8	8535	8542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015676	TTTC	2	8	8640	8647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015676	TAAT	2	8	11260	11267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015676	ATTA	2	8	12450	12457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015676	AACT	2	8	15821	15828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015676	GATG	2	8	18270	18277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015676	ATTC	2	8	22247	22254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015676	CGTA	2	8	27391	27398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015676	ATTC	2	8	29475	29482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015676	ATTT	2	8	29498	29505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015676	ATTT	2	8	39211	39218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015676	ATGC	2	8	39356	39363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015676	TCAT	2	8	39385	39392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015676	GCTG	2	8	40008	40015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015676	CGAG	2	8	40649	40656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015676	CATT	2	8	41239	41246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015676	AATC	2	8	41597	41604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015676	TTCC	2	8	42320	42327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015676	GTAG	2	8	43564	43571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015676	GTGG	2	8	43597	43604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015676	CATC	2	8	44534	44541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015676	TACA	2	8	44560	44567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015676	TTTG	2	8	46339	46346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015676	TTCT	2	8	49410	49417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015676	ATGA	2	8	55617	55624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015676	TAAA	2	8	55627	55634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015676	TCAT	2	8	59911	59918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015676	ATTG	2	8	59929	59936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015676	CCTG	2	8	64032	64039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015676	CTGC	2	8	64136	64143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015676	TGTT	2	8	75508	75515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015676	TTAT	2	8	75931	75938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015676	CAAG	2	8	75971	75978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015676	ATTA	2	8	77034	77041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015676	TAAT	2	8	79393	79400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015676	GAAT	2	8	79451	79458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015676	GAGG	2	8	79465	79472	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015676	TATG	2	8	81826	81833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015676	TAAA	2	8	94555	94562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015676	ATTT	2	8	94864	94871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015676	CCTG	2	8	101996	102003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015676	GTAT	2	8	102011	102018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015676	CAGG	2	8	103550	103557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015676	AGAT	2	8	106175	106182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015676	CAGG	2	8	109405	109412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015676	ACAT	2	8	109423	109430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015676	CTGA	2	8	114547	114554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015676	TAAA	2	8	114691	114698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015676	ATTT	2	8	114702	114709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015676	TAAA	2	8	114809	114816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015676	ATTT	2	8	116458	116465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015676	ATTA	2	8	116573	116580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015676	AAAC	2	8	116675	116682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015676	TCAA	2	8	121057	121064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015676	GAAC	2	8	121640	121647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015676	TAAA	2	8	121770	121777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015676	ATTT	2	8	122063	122070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015676	ATAA	2	8	122335	122342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015676	AAAC	2	8	123162	123169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015676	ATTT	2	8	124285	124292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015676	ATTG	2	8	124305	124312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015676	TGAA	2	8	124539	124546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015676	ATTT	2	8	128706	128713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015676	AAAC	2	8	128717	128724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015676	AATA	2	8	131147	131154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015676	AATA	2	8	131307	131314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015676	TTCT	2	8	135125	135132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015676	ATTT	3	12	136652	136663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015676	ATTG	2	8	137059	137066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015676	TATT	2	8	138745	138752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015676	TCTT	2	8	139023	139030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015676	TTAC	2	8	139126	139133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015676	CAAT	2	8	139182	139189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015676	ATTC	2	8	139248	139255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015676	GATA	2	8	139383	139390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015676	GATA	2	8	139450	139457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015676	GATA	2	8	139517	139524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015676	GATA	2	8	139584	139591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015676	GATA	2	8	139651	139658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015676	GATA	2	8	139718	139725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015676	GATA	2	8	139785	139792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015676	AAGT	2	8	139848	139855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015676	TCAA	2	8	140008	140015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015676	TAAA	2	8	141069	141076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015676	ATGG	2	8	143060	143067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015676	TGAA	2	8	143268	143275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015676	TAAT	2	8	143586	143593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015676	TCTT	2	8	144108	144115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015676	CATA	2	8	144186	144193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015676	ATTT	2	8	144287	144294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015676	TTAT	2	8	146254	146261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015676	TAGT	2	8	146492	146499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015676	CAAA	2	8	149714	149721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015676	TTAT	2	8	155398	155405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015676	TTAG	2	8	158198	158205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015676	TAAA	2	8	163095	163102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015676	TCAT	2	8	164219	164226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015676	TTCA	2	8	165095	165102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015676	TTAC	2	8	174541	174548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015676	TTGA	2	8	183834	183841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015676	CTTT	2	8	184508	184515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015676	GAAT	2	8	185271	185278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015676	CCGA	2	8	185390	185397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015676	ATGT	2	8	190716	190723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015676	ATGA	2	8	195474	195481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015676	TATT	2	8	195576	195583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015676	AGGA	2	8	204518	204525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015676	TTCC	2	8	204736	204743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015676	TCTG	2	8	208345	208352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015676	ACAA	2	8	209891	209898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015676	TCTG	2	8	209935	209942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015676	TTGT	2	8	209992	209999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015676	TAAT	2	8	211671	211678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015676	ATGA	2	8	225879	225886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015676	ACTG	2	8	226768	226775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015676	AGAA	2	8	226923	226930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015676	CTAT	2	8	230449	230456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015676	TAAG	2	8	232965	232972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015676	GATT	2	8	232982	232989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015676	ATTG	2	8	233119	233126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015676	CTGA	2	8	234922	234929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015676	TCCC	2	8	235318	235325	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_015676	TAAT	2	8	235349	235356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015676	TAAT	2	8	235388	235395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015676	AGAC	2	8	239899	239906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015676	AATC	2	8	239942	239949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015676	TCTG	2	8	241105	241112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015676	ATTT	2	8	241419	241426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015676	TTGT	2	8	241752	241759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015676	GATT	2	8	248479	248486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015676	CTAA	2	8	248496	248503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015676	AATA	2	8	249908	249915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015676	ACCA	2	8	250504	250511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015676	ATAA	2	8	252478	252485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015676	TTCA	2	8	252523	252530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015676	GTCT	2	8	252547	252554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015676	TGGT	2	8	252693	252700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015676	ATCT	2	8	257097	257104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015676	CTGG	2	8	259929	259936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015676	GTAG	2	8	260001	260008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015676	CATT	2	8	261452	261459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015676	TTTC	2	8	264509	264516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015676	GCTG	2	8	265762	265769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015676	CGAG	2	8	266403	266410	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015676	CATT	2	8	266994	267001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015676	AATC	2	8	267352	267359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015676	TTCC	2	8	268075	268082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015676	GTAG	2	8	269318	269325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015676	GTGG	2	8	269351	269358	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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