MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015576	GCGTGC	2	12	180906	180917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015576	ACCGCC	2	12	231889	231900	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015576	AGATTC	2	12	283212	283223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015576	GGCGGA	2	12	288914	288925	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015576	ACGCCT	2	12	331880	331891	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015576	GCGCCG	2	12	331910	331921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015576	AACGCA	2	12	443338	443349	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015576	CACCGA	2	12	590556	590567	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015576	GCTGTT	2	12	598575	598586	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015576	GCGATC	2	12	603280	603291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015576	GCCGCT	2	12	660730	660741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015576	GGCCGC	2	12	664786	664797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015576	AACCCC	2	12	718202	718213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015576	TCTGGC	2	12	745126	745137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015576	ACCCGG	2	12	750181	750192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015576	GGGGCG	2	12	800367	800378	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015576	CCCCAG	2	12	812820	812831	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015576	CTTCTC	2	12	816207	816218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015576	AGCCGA	2	12	903957	903968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015576	CGGGGG	2	12	904073	904084	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015576	AACTCG	2	12	1038295	1038306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015576	GCTCCA	2	12	1045989	1046000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015576	GCCAGC	2	12	1087872	1087883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015576	AGTGGC	2	12	1107321	1107332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015576	GTCGGA	2	12	1122143	1122154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015576	CGGCCG	2	12	1211989	1212000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015576	GTGCCG	2	12	1246767	1246778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015576	CTCGAT	2	12	1328499	1328510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015576	CACCGG	2	12	1329992	1330003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015576	GCTGAA	2	12	1338694	1338705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015576	CGCCGG	2	12	1351408	1351419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015576	GGGTGA	2	12	1399718	1399729	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015576	CAAACA	2	12	1403245	1403256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015576	AACCGA	2	12	1406093	1406104	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015576	TGTTGA	2	12	1460207	1460218	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015576	AGCGCA	2	12	1468774	1468785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015576	CGTTCC	2	12	1492201	1492212	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015576	GGGCGA	2	12	1566698	1566709	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015576	GGAGCG	2	12	1644370	1644381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015576	GACCGA	2	12	1644719	1644730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015576	GCCGGA	2	12	1709646	1709657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015576	CGCCGA	2	12	1754102	1754113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015576	TCACGT	2	12	1760602	1760613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015576	GACCAC	2	12	1865997	1866008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015576	CGGGTT	2	12	1866069	1866080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015576	GGTTGA	2	12	1905398	1905409	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015576	GGGTGA	2	12	2010076	2010087	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015576	CAAACA	2	12	2013603	2013614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015576	GGATCG	3	18	2014087	2014104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015576	ACGGCG	2	12	2035024	2035035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015576	CGGTGC	2	12	2111025	2111036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015576	GGCGGA	2	12	2225286	2225297	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015576	GATGCT	2	12	2231558	2231569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015576	CGACCG	2	12	2235237	2235248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015576	GTCACC	2	12	2305156	2305167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015576	GCCCGC	2	12	2344328	2344339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015576	CGCATC	2	12	2400063	2400074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015576	AACCCA	2	12	2400170	2400181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015576	CCGCCA	2	12	2400212	2400223	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015576	CGCATC	2	12	2410227	2410238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015576	AACCCA	2	12	2410334	2410345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015576	CCGCCA	2	12	2410376	2410387	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015576	GCGCCG	2	12	2446957	2446968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015576	CAGTCG	2	12	2448736	2448747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015576	CGGCGA	2	12	2588157	2588168	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015576	TCGGCG	2	12	2652167	2652178	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015576	TCGCAG	2	12	2859998	2860009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015576	GGTAGG	2	12	2970448	2970459	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015576	CGCCGG	2	12	3014963	3014974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015576	ATCGTA	2	12	3020742	3020753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015576	CGCCGG	2	12	3022327	3022338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015576	CCAGCG	2	12	3040117	3040128	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015576	ACTTTT	2	12	3050344	3050355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015576	AGTCGA	2	12	3141696	3141707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015576	CGGCAA	2	12	3145559	3145570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015576	CCGGCC	2	12	3210858	3210869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015576	ACCCGG	2	12	3257804	3257815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015576	GGGCTG	2	12	3313940	3313951	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015576	TCCCCG	2	12	3323187	3323198	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015576	TCGCCG	2	12	3327971	3327982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015576	GCAATC	2	12	3339639	3339650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015576	AGGGCC	2	12	3359232	3359243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015576	CGACCC	2	12	3372025	3372036	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015576	CGCGAG	2	12	3487938	3487949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015576	GCCGGC	2	12	3490600	3490611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015576	CGCCAC	2	12	3491335	3491346	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015576	CGACTA	2	12	3497791	3497802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015576	GCGCGG	2	12	3498878	3498889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015576	CGTCGC	2	12	3529344	3529355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015576	TCCGGG	2	12	3605268	3605279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015576	GTCGAC	2	12	3666112	3666123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015576	GGACGC	2	12	3684442	3684453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015576	GATCGC	2	12	3793965	3793976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015576	CGACGC	2	12	3800579	3800590	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015576	GGCCGG	2	12	3822080	3822091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015576	ACCCCG	2	12	3866343	3866354	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015576	TGGCGC	2	12	3889569	3889580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015576	GCGATC	2	12	3986367	3986378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015576	ACCCGG	2	12	3986636	3986647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015576	CATCGT	2	12	3986725	3986736	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015576	CACGTC	2	12	4021295	4021306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015576	GAAGTT	2	12	4022666	4022677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015576	ATGTCG	2	12	4040246	4040257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015576	CGACGG	2	12	4059682	4059693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015576	CTGTAC	2	12	4132524	4132535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015576	CGCCAA	2	12	4145269	4145280	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015576	GCGGGG	2	12	4253474	4253485	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015576	CGCAGC	2	12	4283942	4283953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015576	CCCGGC	2	12	4285058	4285069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015576	TGGCGG	2	12	4285106	4285117	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015576	ATCCCA	2	12	4308120	4308131	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015576	CCCGGC	2	12	4321520	4321531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015576	CCCGAA	2	12	4321820	4321831	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015576	CCTCAA	2	12	4365167	4365178	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015576	CCGGCC	2	12	4387255	4387266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015576	GCGCCG	2	12	4410123	4410134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015576	GGCAGC	2	12	4435746	4435757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015576	CCGAGG	2	12	4442671	4442682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015576	CGCAAC	2	12	4463105	4463116	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015576	CACCGA	2	12	4471254	4471265	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015576	ACCGGC	2	12	4529368	4529379	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015576	GTACCG	2	12	4547399	4547410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015576	TCGCCA	2	12	4581551	4581562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015576	GCTGGT	2	12	4587681	4587692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015576	GGTTAG	2	12	4591100	4591111	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015576	CGTCCA	2	12	4594741	4594752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015576	GCAGCC	2	12	4642258	4642269	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.