MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	TAGAT	2	10	1545	1554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015574	ACAAA	2	10	5472	5481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015574	TATAT	2	10	11709	11718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015574	ATTTA	2	10	16693	16702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015574	TAATA	2	10	22647	22656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015574	TATAA	2	10	26293	26302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015574	TAAAA	2	10	27797	27806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015574	TTTAA	2	10	28355	28364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015574	ATAAA	2	10	28440	28449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015574	AATTA	2	10	28476	28485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015574	ATTTA	2	10	33185	33194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015574	TATCA	2	10	33763	33772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015574	ATTTA	2	10	37070	37079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015574	ATTTA	2	10	58778	58787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015574	ATTTT	2	10	61389	61398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015574	TAAAA	2	10	61440	61449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015574	TATAT	2	10	63157	63166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015574	TTTTA	2	10	63167	63176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015574	CTTAT	2	10	64148	64157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015574	TGTAA	2	10	75189	75198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015574	TTAAT	2	10	75989	75998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015574	TCTTA	2	10	76047	76056	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015574	TTTAA	2	10	76609	76618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015574	ATTTT	2	10	80257	80266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015574	TCATT	2	10	88570	88579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015574	TAAAA	2	10	92301	92310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015574	TTTAT	2	10	95522	95531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015574	AAATA	2	10	95917	95926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015574	TGAAA	2	10	101268	101277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015574	ATTTA	2	10	101368	101377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015574	AGATC	2	10	107111	107120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015574	TTTAA	2	10	110857	110866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015574	TTTTA	2	10	115366	115375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015574	CTTTA	2	10	117323	117332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015574	TTTAC	2	10	117557	117566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015574	AAAAT	2	10	128828	128837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015574	TGTTA	2	10	130475	130484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015574	TGTTT	2	10	146666	146675	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015574	ATATC	2	10	167684	167693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015574	TTATA	2	10	173613	173622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015574	TTTAA	2	10	181589	181598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015574	GTTAT	2	10	187943	187952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015574	TTGAT	2	10	188419	188428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015574	TAAAT	2	10	190386	190395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015574	AAGAT	2	10	190467	190476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015574	TATCT	2	10	193148	193157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015574	TAAAT	2	10	197635	197644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015574	TTGAA	2	10	197892	197901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015574	AATTA	2	10	197909	197918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015574	AATTA	2	10	201245	201254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015574	ATTTT	2	10	207855	207864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015574	AATAA	2	10	207951	207960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015574	ATATA	2	10	207968	207977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015574	TAATT	2	10	210081	210090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015574	GATGT	2	10	210124	210133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015574	ATATA	2	10	212524	212533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015574	AAATT	2	10	215331	215340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015574	TTGGA	2	10	218350	218359	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015574	TTTTA	2	10	218384	218393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015574	ATTTT	2	10	218463	218472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015574	ATTTG	2	10	223396	223405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015574	TAATT	2	10	224808	224817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015574	TAAAT	2	10	228014	228023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015574	TTTAA	2	10	230167	230176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015574	TTAAA	2	10	231896	231905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015574	TTTTA	2	10	236019	236028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015574	GGTTT	2	10	240605	240614	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015574	TCTTA	2	10	242712	242721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015574	TTTAA	2	10	255906	255915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015574	TATAT	2	10	258500	258509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015574	ATATT	2	10	261265	261274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015574	TAAAT	2	10	261481	261490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015574	TAGCC	2	10	276006	276015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015574	ATATT	2	10	276114	276123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015574	TTAAA	2	10	276731	276740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015574	TTGAG	2	10	280464	280473	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015574	TAAAA	2	10	283153	283162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015574	TGATA	2	10	286398	286407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015574	AATCA	2	10	287918	287927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015574	GTATA	2	10	291236	291245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015574	TATAC	2	10	291364	291373	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015574	ATAAA	2	10	293708	293717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015574	TAAAT	2	10	299804	299813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015574	CAATG	2	10	309262	309271	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015574	TCCAA	2	10	309949	309958	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015574	TAAGT	2	10	313144	313153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015574	TAATT	2	10	314395	314404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015574	AATTT	2	10	314550	314559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015574	ATTTT	2	10	320203	320212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015574	TAATT	2	10	323087	323096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015574	TAAAA	2	10	324052	324061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015574	TTTAA	2	10	329156	329165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015574	ATTTT	2	10	329324	329333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015574	GTTTT	2	10	334807	334816	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015574	TAAAC	2	10	345365	345374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015574	ATTTC	2	10	346214	346223	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015574	TTTAA	2	10	350616	350625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015574	GAAAT	2	10	350813	350822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015574	TTATT	2	10	352270	352279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015574	TTTTA	2	10	359308	359317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015574	AATTT	2	10	361940	361949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015574	ACTCA	2	10	366560	366569	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015574	ATTTT	2	10	368446	368455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015574	AGGTT	2	10	371458	371467	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015574	AATAA	2	10	371505	371514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015574	ATTAC	2	10	380610	380619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015574	TATCT	2	10	389047	389056	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015574	GATTT	2	10	397598	397607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015574	TTATA	2	10	406651	406660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015574	TTTGA	2	10	406734	406743	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015574	ACTCC	2	10	408161	408170	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_015574	TTATT	3	15	408977	408991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015574	TAAAT	2	10	415147	415156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015574	TTAAA	2	10	415897	415906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015574	TAATA	2	10	426855	426864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015574	TAAAA	2	10	428198	428207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015574	ATTTA	2	10	432906	432915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015574	GAAAA	2	10	434887	434896	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015574	TAAAT	2	10	437102	437111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015574	CTAAA	2	10	438269	438278	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015574	CATTT	2	10	441001	441010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015574	AAAAT	2	10	443374	443383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015574	AATTA	2	10	446841	446850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015574	AAATG	2	10	446915	446924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015574	ATTAG	2	10	447737	447746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015574	ATTTT	2	10	452283	452292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015574	CAAAT	2	10	452400	452409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015574	AATTT	2	10	453939	453948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015574	AAAAT	2	10	463485	463494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015574	ATTTT	2	10	466182	466191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015574	TAAAA	2	10	466456	466465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015574	TCAAT	2	10	471164	471173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015574	AATTT	2	10	475500	475509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015574	AATCT	2	10	475535	475544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015574	AATTT	2	10	475562	475571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015574	TATTG	2	10	475951	475960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015574	TAAAT	2	10	476220	476229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015574	ATTTT	2	10	479001	479010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015574	ATTAA	2	10	480714	480723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015574	TATAT	2	10	482921	482930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015574	TGAAA	2	10	483493	483502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015574	AGACT	2	10	483653	483662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015574	AAAAT	2	10	487196	487205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015574	TTAAA	2	10	487216	487225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015574	TTCAT	2	10	487265	487274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015574	ATTAT	2	10	491573	491582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015574	TAAAA	2	10	491674	491683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015574	TTATT	2	10	493359	493368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015574	TCTTT	2	10	493392	493401	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_015574	AAATT	2	10	1303777	1303786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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