MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 1817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	AATA	2	8	1551	1558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015572	GTTT	2	8	3795	3802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015572	CTTA	2	8	6632	6639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015572	ATGA	2	8	6791	6798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015572	TAGT	2	8	11641	11648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015572	ACCA	2	8	19904	19911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015572	AGCC	2	8	20364	20371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015572	TCAG	2	8	20375	20382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015572	TTAT	2	8	20405	20412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015572	CCTG	2	8	29797	29804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015572	CGAC	2	8	30190	30197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015572	TTTG	2	8	31009	31016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015572	ATTT	2	8	40239	40246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015572	AGCA	2	8	41784	41791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015572	CGGG	2	8	47700	47707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015572	TCAC	2	8	48141	48148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015572	CAAG	2	8	48224	48231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015572	TCCA	2	8	48266	48273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015572	GCCG	2	8	48283	48290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015572	TTGG	2	8	48446	48453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015572	GTTG	2	8	53031	53038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015572	TTTG	2	8	53129	53136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015572	TTTG	2	8	53288	53295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015572	CTAT	2	8	53363	53370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015572	CTTT	2	8	55785	55792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015572	GATT	2	8	56093	56100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015572	CCGA	2	8	56317	56324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015572	CCTG	2	8	56465	56472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015572	GGGA	2	8	58623	58630	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015572	AAGG	2	8	63785	63792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015572	CTGA	2	8	64095	64102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015572	ATGC	2	8	65154	65161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015572	ATTA	2	8	65268	65275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015572	TGTT	2	8	65370	65377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015572	CTCA	2	8	65381	65388	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015572	TGAT	2	8	69860	69867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015572	CGCT	2	8	70028	70035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015572	GCTA	2	8	70057	70064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015572	TCAC	2	8	70679	70686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015572	CAGA	2	8	71664	71671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015572	GCAG	2	8	73931	73938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015572	AACC	2	8	73999	74006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015572	CTGT	2	8	74040	74047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015572	TTCA	2	8	74229	74236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015572	TGGA	2	8	74780	74787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015572	CTGT	2	8	76110	76117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015572	CTGC	2	8	76284	76291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015572	AGGC	2	8	76345	76352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015572	ATTT	2	8	76526	76533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015572	GAAA	2	8	80217	80224	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015572	CAAG	2	8	80242	80249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015572	GTTG	2	8	80292	80299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015572	CAAT	2	8	80719	80726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015572	TTGC	2	8	83230	83237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015572	TGCT	2	8	86806	86813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015572	GACG	2	8	89277	89284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015572	GGCA	2	8	90311	90318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015572	GTCT	2	8	95257	95264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015572	TTTC	2	8	95425	95432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015572	TGAA	2	8	95588	95595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015572	GTTA	2	8	96934	96941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015572	GTGC	2	8	121606	121613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015572	TGGT	2	8	124592	124599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015572	AATT	2	8	124776	124783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015572	ATCG	2	8	128647	128654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015572	AAAT	2	8	130315	130322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015572	ATTT	2	8	133464	133471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015572	CGGC	2	8	136866	136873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015572	ATTT	2	8	147035	147042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015572	CCAA	2	8	154552	154559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015572	TCCT	2	8	156439	156446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015572	TGCG	2	8	161214	161221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015572	CTCG	2	8	163264	163271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015572	AGGT	2	8	163348	163355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015572	CGCT	2	8	164295	164302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015572	CGGC	2	8	166042	166049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015572	AGTC	2	8	168414	168421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015572	TGAC	2	8	169075	169082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015572	GCAA	2	8	176213	176220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015572	GCAG	2	8	177507	177514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015572	CTTC	2	8	177619	177626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015572	CAAT	2	8	177749	177756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015572	GATT	2	8	177758	177765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015572	GATT	2	8	177785	177792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015572	TTAT	2	8	185246	185253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015572	AATT	2	8	185327	185334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015572	TAAT	2	8	185355	185362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015572	TTGT	2	8	185470	185477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015572	ATTT	2	8	185508	185515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015572	ATTT	2	8	185792	185799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015572	TCTA	2	8	185873	185880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015572	TAAC	2	8	187251	187258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015572	ATAG	2	8	193737	193744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015572	TGCC	2	8	193994	194001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015572	GTAA	2	8	195728	195735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015572	ATTG	2	8	195754	195761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015572	GGTT	2	8	199712	199719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015572	CCGC	2	8	199949	199956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_015572	CTAA	2	8	209663	209670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015572	TCCA	2	8	211424	211431	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015572	AGTA	2	8	219272	219279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015572	CATG	2	8	219387	219394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015572	TCTG	2	8	220188	220195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015572	TAAA	2	8	220244	220251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015572	TTAG	2	8	229076	229083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015572	CATG	2	8	229140	229147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015572	GACT	2	8	229201	229208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015572	GTCG	2	8	236708	236715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015572	AGTG	2	8	243872	243879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015572	GAAG	2	8	245101	245108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015572	AATT	2	8	245816	245823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015572	ACCA	2	8	246762	246769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015572	ACAG	2	8	246784	246791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015572	CCAC	2	8	251391	251398	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_015572	TTGA	2	8	257587	257594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015572	CAGG	2	8	257624	257631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015572	ATGT	2	8	257924	257931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015572	TGCG	2	8	258026	258033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015572	CGAA	2	8	258095	258102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015572	TCAC	2	8	266380	266387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015572	CGTT	2	8	268447	268454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015572	TTCT	2	8	294239	294246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015572	ATAA	2	8	296962	296969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015572	ATCG	2	8	297002	297009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015572	CTAT	2	8	307686	307693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015572	TGGT	2	8	312936	312943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015572	TTTA	2	8	315416	315423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015572	TGTT	2	8	321174	321181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015572	TGGC	2	8	327584	327591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015572	TTGA	2	8	329424	329431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015572	GAAA	2	8	330759	330766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015572	CAAA	2	8	330884	330891	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015572	GTTG	3	12	331472	331483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015572	GGCG	2	8	337995	338002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015572	ATAA	2	8	338146	338153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015572	GGCA	2	8	341706	341713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015572	CGGC	2	8	342117	342124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015572	GGAT	2	8	342290	342297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015572	GCAG	2	8	345271	345278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015572	TGTT	2	8	345335	345342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015572	GAAA	2	8	345477	345484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015572	GAAG	2	8	345539	345546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015572	AGGT	2	8	345663	345670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015572	TTAA	2	8	345918	345925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015572	CGAA	2	8	345984	345991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015572	CGCC	2	8	348109	348116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_015572	CAGC	2	8	348162	348169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015572	GGTG	2	8	348442	348449	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015572	GTAT	2	8	348476	348483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015572	ATCA	2	8	348686	348693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015572	GGTT	2	8	348789	348796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015572	CGAA	2	8	351031	351038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_015572	AGCT	2	8	371530	371537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_015572	TAAT	2	8	387603	387610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015572	TGGT	2	8	1259230	1259237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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