MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 10998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015572	A	7	7	1827358	1827364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015572	GTT	2	6	1827397	1827402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015572	GAAT	2	8	1827461	1827468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015572	CCG	2	6	1827483	1827488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_015572	GGCC	2	8	1827489	1827496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_015572	CTTGG	2	10	1827537	1827546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4007	NC_015572	GCA	2	6	1827563	1827568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015572	CGC	2	6	1827574	1827579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_015572	GTC	2	6	1833845	1833850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_015572	GAA	2	6	1833861	1833866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015572	AGT	2	6	1833874	1833879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015572	CCGGC	2	10	1833961	1833970	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4013	NC_015572	TGC	2	6	1834048	1834053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015572	CGGT	2	8	1834092	1834099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_015572	GGC	2	6	1834125	1834130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015572	TTG	2	6	1834154	1834159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015572	AGC	3	9	1834188	1834196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_015572	GC	4	8	1834195	1834202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_015572	TG	3	6	1834604	1834609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015572	GCAA	2	8	1834610	1834617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_015572	AATT	2	8	1835547	1835554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015572	CAT	2	6	1836446	1836451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015572	AAT	2	6	1836452	1836457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015572	TGC	2	6	1836523	1836528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015572	CG	3	6	1836532	1836537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_015572	T	7	7	1836571	1836577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015572	GAT	2	6	1836591	1836596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015572	ACG	2	6	1836653	1836658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_015572	T	6	6	1836680	1836685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015572	GCCCAT	2	12	1836706	1836717	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_015572	CG	3	6	1836724	1836729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_015572	TCA	2	6	1836871	1836876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_015572	GTCG	2	8	1836895	1836902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_015572	CAT	2	6	1836920	1836925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_015572	ATGG	2	8	1841983	1841990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015572	TAT	2	6	1842036	1842041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015572	TAAG	2	8	1842056	1842063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015572	GTC	2	6	1842067	1842072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015572	TTA	2	6	1842141	1842146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015572	TAT	3	9	1842151	1842159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015572	TTG	2	6	1842207	1842212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015572	TTA	2	6	1842213	1842218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015572	TCCC	2	8	1842241	1842248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4044	NC_015572	A	8	8	1842315	1842322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015572	A	7	7	1842336	1842342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015572	T	6	6	1842348	1842353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015572	GTC	2	6	1844812	1844817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015572	TTGG	2	8	1844826	1844833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015572	AAC	2	6	1844834	1844839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_015572	GTA	2	6	1852768	1852773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015572	GCG	2	6	1852794	1852799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015572	T	6	6	1852921	1852926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015572	T	6	6	1858147	1858152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015572	T	6	6	1858731	1858736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015572	AGT	2	6	1858737	1858742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015572	CGG	2	6	1858763	1858768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015572	TTG	2	6	1861070	1861075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015572	AAC	2	6	1861154	1861159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_015572	TCC	2	6	1865142	1865147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_015572	AGGG	2	8	1865176	1865183	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015572	T	7	7	1865186	1865192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015572	AAT	2	6	1865645	1865650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015572	AAT	2	6	1866631	1866636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015572	ATAA	2	8	1867148	1867155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015572	T	6	6	1867630	1867635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015572	ATA	2	6	1867636	1867641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015572	ATTG	2	8	1868493	1868500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015572	ATG	2	6	1872973	1872978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015572	T	6	6	1872984	1872989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015572	TA	3	6	1874452	1874457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015572	CGT	2	6	1874471	1874476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_015572	TGA	2	6	1874482	1874487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015572	AAT	2	6	1874500	1874505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015572	T	6	6	1875892	1875897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015572	CCG	2	6	1875924	1875929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_015572	TGT	2	6	1876016	1876021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015572	CGC	2	6	1876058	1876063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_015572	T	6	6	1876097	1876102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015572	GTT	2	6	1877406	1877411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015572	ATTT	2	8	1878324	1878331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015572	T	6	6	1878329	1878334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015572	CTT	2	6	1878343	1878348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015572	GCA	2	6	1878349	1878354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015572	GGGAGA	2	12	1880371	1880382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015572	CGG	2	6	1882197	1882202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015572	TAA	2	6	1882227	1882232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015572	CCT	2	6	1882302	1882307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_015572	GTC	2	6	1882319	1882324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015572	TGT	2	6	1883822	1883827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015572	T	7	7	1883895	1883901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015572	GAA	2	6	1883933	1883938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015572	CTA	2	6	1884328	1884333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_015572	CAG	2	6	1884354	1884359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_015572	AAG	2	6	1886870	1886875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015572	TGT	2	6	1886921	1886926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015572	AAC	2	6	1886953	1886958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_015572	CGG	2	6	1886996	1887001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015572	TGC	2	6	1887085	1887090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_015572	CAA	2	6	1887094	1887099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_015572	ATT	2	6	1887119	1887124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015572	AGGA	2	8	1891202	1891209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015572	T	6	6	1891277	1891282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015572	GCCG	2	8	1891288	1891295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_015572	CGG	2	6	1891299	1891304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_015572	TCT	2	6	1891682	1891687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_015572	CT	3	6	1891686	1891691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_015572	ATG	3	9	1891696	1891704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015572	TGG	2	6	1891986	1891991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015572	ATC	2	6	1892012	1892017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015572	TAA	2	6	1892037	1892042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015572	TCC	2	6	1892585	1892590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_015572	GTT	2	6	1892593	1892598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015572	A	7	7	1894523	1894529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015572	ACC	2	6	1894579	1894584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_015572	CCA	2	6	1894590	1894595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_015572	GGT	2	6	1894602	1894607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015572	ATT	2	6	1894668	1894673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015572	CGG	2	6	1898754	1898759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015572	TTA	2	6	1898766	1898771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015572	GTT	2	6	1902405	1902410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015572	TTA	2	6	1902535	1902540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015572	TGAT	2	8	1902550	1902557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015572	ATA	2	6	1902560	1902565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015572	AT	3	6	1902567	1902572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015572	TTAA	2	8	1902609	1902616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015572	TCG	2	6	1903079	1903084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_015572	AGA	2	6	1903144	1903149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015572	GTGA	2	8	1903150	1903157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_015572	GGT	2	6	1903576	1903581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015572	T	6	6	1903607	1903612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015572	CGCTC	2	10	1903620	1903629	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4132	NC_015572	GA	3	6	1904130	1904135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4231	NC_015572	GTTT	2	8	1962207	1962214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_015572	AAT	2	6	1972553	1972558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_015572	TA	3	6	1972624	1972629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_015572	TAA	2	6	1972637	1972642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_015572	A	6	6	1972930	1972935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_015572	ATG	2	6	1972969	1972974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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