MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 9613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015562	GAA	2	6	295918	295923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015562	TGAT	2	8	295924	295931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015562	AGA	2	6	295994	295999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015562	CAAA	2	8	296000	296007	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_015562	AGT	2	6	296015	296020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015562	CAAA	2	8	296051	296058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_015562	A	6	6	296056	296061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015562	TA	3	6	296170	296175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015562	TCTT	2	8	296178	296185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_015562	TAC	2	6	296204	296209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015562	AAGA	2	8	296236	296243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015562	A	6	6	296358	296363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015562	A	6	6	296375	296380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015562	A	7	7	296396	296402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015562	TA	3	6	296451	296456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015562	TTAA	2	8	296470	296477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015562	AAG	2	6	296507	296512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015562	AGCGA	2	10	296521	296530	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_015562	TGA	2	6	296547	296552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015562	T	6	6	296601	296606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015562	TTTTA	2	10	296672	296681	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015562	T	6	6	296687	296692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015562	TAT	2	6	296705	296710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015562	TTAT	2	8	296723	296730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015562	TCC	2	6	298649	298654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_015562	A	9	9	298755	298763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015562	AAAGA	2	10	298774	298783	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015562	TAAAA	2	10	298807	298816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015562	A	8	8	298813	298820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015562	TAAA	2	8	299505	299512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015562	AAAAT	2	10	299534	299543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015562	ATC	2	6	300927	300932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015562	TAA	2	6	300937	300942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015562	TAA	2	6	300946	300951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015562	TTC	2	6	300965	300970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_015562	GAT	3	9	300984	300992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015562	GAA	2	6	301106	301111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015562	ATT	2	6	301117	301122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015562	ATAA	2	8	301139	301146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015562	ACTC	2	8	301229	301236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_015562	T	6	6	301267	301272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015562	TA	4	8	301294	301301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015562	AATGA	2	10	301302	301311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015562	AT	3	6	301328	301333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015562	T	6	6	304868	304873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015562	TCT	2	6	304883	304888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_015562	GTT	2	6	306042	306047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015562	T	7	7	306054	306060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015562	ATTA	2	8	306099	306106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015562	TAA	2	6	306121	306126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015562	TTC	2	6	306131	306136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_015562	AAC	2	6	306149	306154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_015562	A	6	6	306177	306182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015562	GAATA	2	10	306198	306207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015562	ATA	2	6	307137	307142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015562	ATT	2	6	307147	307152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015562	ATT	2	6	307156	307161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015562	A	6	6	307163	307168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015562	A	6	6	307176	307181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015562	TGA	2	6	307218	307223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015562	TGA	2	6	307250	307255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015562	CCT	2	6	308154	308159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_015562	AAAATT	2	12	308177	308188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015562	ATAA	2	8	308208	308215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015562	ATA	2	6	308259	308264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015562	TTAAAA	2	12	308286	308297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_015562	TGT	2	6	308320	308325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015562	ATTG	2	8	308352	308359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015562	TA	4	8	308390	308397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015562	T	6	6	309033	309038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015562	TAAAAA	2	12	309048	309059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015562	CAC	2	6	310406	310411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_015562	A	6	6	310432	310437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015562	A	6	6	310439	310444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015562	AGG	2	6	310477	310482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_015562	TGG	2	6	310545	310550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015562	AGG	2	6	312498	312503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015562	AAT	2	6	312517	312522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015562	TCA	2	6	314344	314349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015562	T	6	6	314352	314357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015562	TCC	2	6	314378	314383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_015562	TAC	2	6	314404	314409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1587	NC_015562	T	7	7	315748	315754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015562	T	6	6	315790	315795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015562	ATT	2	6	315818	315823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015562	TCA	2	6	315824	315829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015562	ATT	3	9	316780	316788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015562	TAT	2	6	316791	316796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015562	A	6	6	316888	316893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015562	GAA	2	6	316899	316904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015562	AAAT	2	8	316928	316935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015562	CAAA	2	8	316983	316990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1598	NC_015562	AGT	2	6	317690	317695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1600	NC_015562	ATAA	2	8	317832	317839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015562	C	6	6	317848	317853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1602	NC_015562	TAA	2	6	317890	317895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015562	TTGT	2	8	317910	317917	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015562	TA	3	6	317925	317930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015562	TTAAG	2	10	317948	317957	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015562	A	6	6	317991	317996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015562	A	7	7	318000	318006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015562	A	6	6	318416	318421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015562	TGC	2	6	318461	318466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_015562	TGA	2	6	318467	318472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015562	CA	3	6	318543	318548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_015562	TAAA	2	8	318553	318560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015562	AGA	2	6	318595	318600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015562	T	6	6	318779	318784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015562	ACC	2	6	319875	319880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_015562	T	6	6	319881	319886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015562	TA	4	8	319901	319908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015562	ATT	2	6	319964	319969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015562	GAA	2	6	319982	319987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_015562	AT	3	6	320156	320161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015562	TAAA	2	8	320174	320181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015562	AT	3	6	320221	320226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015562	TAAAA	2	10	320240	320249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015562	TGG	2	6	320251	320256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015562	G	6	6	320261	320266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_015562	TTG	2	6	320389	320394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015562	TTAT	2	8	320429	320436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015562	T	6	6	320457	320462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015562	T	6	6	320574	320579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015562	AAGG	2	8	320612	320619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015562	ATT	2	6	320626	320631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_015562	TAC	2	6	320758	320763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_015562	CAA	2	6	320767	320772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_015562	AAT	2	6	320787	320792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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