MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	TAAAA	2	10	407	416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015517	ATTTT	2	10	2349	2358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015517	TATAA	2	10	2842	2851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015517	ATTTT	2	10	5734	5743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015517	TCTTT	2	10	5917	5926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015517	TTGGA	2	10	9058	9067	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015517	TAAAA	2	10	9735	9744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015517	GAAGT	2	10	9747	9756	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015517	ATAAC	2	10	9780	9789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015517	ATTTT	2	10	10346	10355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015517	ATTGA	2	10	13658	13667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015517	CAATT	2	10	13852	13861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015517	TATAG	2	10	14033	14042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015517	TGAAT	2	10	14517	14526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015517	ACTTC	2	10	15729	15738	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015517	AAATT	2	10	16367	16376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015517	TAGCA	2	10	19061	19070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015517	TATAG	2	10	23491	23500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015517	GAAGA	2	10	23541	23550	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015517	TAGTA	2	10	23583	23592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015517	TAATT	2	10	23792	23801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015517	ATAAA	2	10	24467	24476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015517	TTATT	2	10	25511	25520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015517	GATAA	2	10	28017	28026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015517	CCAAT	2	10	32644	32653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015517	TATTT	2	10	33161	33170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015517	AAAGA	2	10	36654	36663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015517	TAAAT	2	10	36910	36919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015517	AAAAT	2	10	37200	37209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015517	ATTTA	2	10	37434	37443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015517	AAATA	2	10	37889	37898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015517	TATAA	2	10	38177	38186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015517	TATCT	2	10	39126	39135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015517	AAATT	2	10	39773	39782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015517	TTATT	2	10	39824	39833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015517	TTGAA	2	10	39904	39913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015517	TATCT	2	10	43247	43256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015517	AATAA	2	10	48226	48235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015517	TTATT	2	10	48337	48346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015517	ATAAA	2	10	54676	54685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015517	ATATT	2	10	62986	62995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015517	ATAAA	2	10	66198	66207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015517	ATAAA	2	10	69400	69409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015517	TAAAA	2	10	73326	73335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015517	TAAGC	2	10	73407	73416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015517	ATTTT	2	10	75261	75270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015517	TTTAA	2	10	75296	75305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015517	TTAAT	2	10	75445	75454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015517	GTAAA	2	10	75942	75951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015517	AAGGA	2	10	76024	76033	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015517	AAATT	2	10	76187	76196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015517	TTCTT	2	10	81150	81159	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015517	TTAAA	2	10	82711	82720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015517	ATAAA	3	15	82790	82804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015517	TTTAT	2	10	86183	86192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015517	TTAAA	2	10	86379	86388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015517	AAGAA	2	10	100335	100344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015517	CTTAT	2	10	102746	102755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015517	AATAA	2	10	102945	102954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015517	ATTTC	2	10	103940	103949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015517	TAATA	2	10	104171	104180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015517	TAAAA	2	10	104348	104357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015517	ATTAA	2	10	104891	104900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015517	AGTTA	2	10	108891	108900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015517	AATAA	2	10	112803	112812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015517	GGTAG	2	10	113835	113844	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015517	ATTTT	2	10	113886	113895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015517	ATTTT	2	10	116714	116723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015517	TAAAT	2	10	118510	118519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015517	ATTTA	2	10	119148	119157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015517	AAAAT	2	10	120944	120953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015517	ATTTT	2	10	121035	121044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015517	ATTAA	2	10	123261	123270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015517	CTACC	2	10	123823	123832	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015517	AGATA	2	10	128749	128758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015517	TAACT	2	10	128767	128776	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015517	ATTAT	2	10	137383	137392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015517	TTTTA	2	10	139953	139962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015517	CAATA	2	10	143265	143274	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015517	TTTTA	2	10	151501	151510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015517	TTAAA	2	10	160700	160709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015517	AAATA	2	10	161045	161054	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015517	TTAAT	2	10	162000	162009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015517	TAAAT	2	10	162787	162796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015517	TAATT	2	10	165739	165748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015517	TTTAT	2	10	169512	169521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015517	TAATT	2	10	175569	175578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015517	ATTGA	2	10	175969	175978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.