MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	TAGA	2	8	7	14	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015517	TTTA	2	8	302	309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015517	AGAA	2	8	363	370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015517	AATA	2	8	526	533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015517	AATA	2	8	1908	1915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015517	TAGA	2	8	1962	1969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015517	AATT	2	8	2046	2053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015517	AATT	2	8	2154	2161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015517	ATTA	2	8	2294	2301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015517	ATTG	2	8	2588	2595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015517	GACT	2	8	2660	2667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015517	TAGT	2	8	2793	2800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015517	ATAA	2	8	5144	5151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015517	GTTT	2	8	5218	5225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015517	ATTT	2	8	5226	5233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015517	TAAT	2	8	5603	5610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015517	TATT	2	8	5710	5717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015517	AAAG	2	8	6031	6038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015517	TTTG	2	8	8963	8970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015517	TTAA	2	8	9008	9015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015517	TATT	2	8	9144	9151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015517	TAAA	2	8	9445	9452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015517	ACTT	2	8	9485	9492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015517	GTTT	2	8	9616	9623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015517	AATA	2	8	9709	9716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015517	TTTA	2	8	10405	10412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015517	ATCA	2	8	10571	10578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015517	ACAA	2	8	10614	10621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015517	ATTG	2	8	10810	10817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015517	TTCT	2	8	13415	13422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015517	AAAC	2	8	13494	13501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015517	TTTA	2	8	13551	13558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015517	TTTG	2	8	13834	13841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015517	TAAT	2	8	13927	13934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015517	GATA	2	8	13958	13965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015517	ATAA	2	8	14052	14059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015517	ACTT	2	8	14403	14410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015517	TTAT	2	8	14562	14569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015517	ATAA	2	8	15526	15533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015517	AAAG	2	8	15747	15754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015517	AGAT	2	8	16590	16597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015517	AAAT	2	8	16824	16831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015517	ATTA	2	8	16991	16998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015517	TTTA	2	8	19238	19245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015517	GAAA	2	8	19270	19277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015517	TATT	2	8	20270	20277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015517	ATTA	2	8	24420	24427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015517	ATTT	2	8	24453	24460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015517	ATTA	2	8	25198	25205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015517	AATT	2	8	25272	25279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015517	TATT	2	8	25564	25571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015517	GAAA	2	8	27485	27492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015517	AATT	2	8	27802	27809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015517	ATGA	2	8	27937	27944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015517	TTAA	2	8	31145	31152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015517	AATG	2	8	31174	31181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015517	AATT	2	8	31821	31828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015517	TTGT	2	8	32202	32209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015517	TGCT	2	8	32699	32706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015517	ATGA	2	8	32819	32826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015517	ATCT	2	8	33261	33268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015517	GTAA	2	8	35634	35641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015517	ATTA	2	8	36507	36514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015517	ATTA	2	8	36530	36537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015517	TCAA	2	8	36642	36649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015517	ATTA	2	8	37145	37152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015517	ATCA	2	8	37241	37248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015517	ATTA	2	8	37693	37700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015517	TATT	2	8	37911	37918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015517	AATT	2	8	38141	38148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015517	GATA	2	8	38912	38919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015517	TAAA	2	8	39238	39245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015517	CTTT	2	8	39290	39297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015517	TTTG	2	8	39579	39586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015517	TTAT	3	12	39614	39625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015517	TTCT	2	8	39637	39644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015517	AGTT	2	8	39836	39843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015517	ATAA	2	8	39987	39994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015517	ATAA	2	8	42891	42898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015517	AGAA	2	8	43080	43087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015517	TAAT	2	8	43262	43269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015517	GGGA	2	8	43280	43287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015517	TAGT	2	8	45789	45796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015517	AAAT	2	8	45838	45845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015517	TTTA	2	8	45865	45872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015517	TGTA	2	8	48315	48322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015517	TATT	2	8	48350	48357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015517	ATTT	2	8	48380	48387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015517	ATAA	2	8	48393	48400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015517	TAAT	2	8	48475	48482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015517	ATCA	2	8	52482	52489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015517	TTAT	2	8	52710	52717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015517	TCTA	2	8	52860	52867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015517	AAGA	2	8	52921	52928	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015517	ATTT	2	8	52950	52957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015517	TTCC	2	8	54533	54540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015517	TTAA	2	8	54592	54599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015517	TTTA	2	8	54710	54717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015517	ATAG	2	8	61221	61228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015517	AAGC	2	8	61271	61278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015517	TTTA	2	8	61286	61293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015517	TGCT	2	8	61301	61308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015517	ATAG	2	8	61392	61399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015517	TTTA	2	8	61491	61498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015517	ATTT	2	8	61510	61517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015517	TTAA	2	8	61529	61536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015517	AAAT	2	8	61541	61548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015517	TAAT	2	8	61554	61561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015517	ATTT	2	8	61668	61675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015517	ATGA	2	8	62795	62802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015517	TATT	2	8	62821	62828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015517	TACA	2	8	62978	62985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015517	TGTA	2	8	63007	63014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015517	AATT	2	8	63015	63022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015517	AATG	2	8	63061	63068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015517	ATTA	2	8	68934	68941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015517	TAAC	2	8	68955	68962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015517	AAAT	2	8	68975	68982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015517	ATAA	2	8	69137	69144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015517	ATAA	2	8	69277	69284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015517	AAAT	2	8	69524	69531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015517	GTTT	2	8	71984	71991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015517	TAAA	2	8	72075	72082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015517	AATT	2	8	72239	72246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015517	TTAG	2	8	72623	72630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015517	GGTT	2	8	72892	72899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015517	AAAT	2	8	75177	75184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015517	AATT	2	8	75237	75244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015517	ATTT	3	12	75334	75345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015517	TTTA	2	8	75562	75569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015517	ATTT	2	8	75634	75641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015517	AGAT	2	8	75665	75672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015517	AACT	2	8	75861	75868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015517	TAAA	2	8	77314	77321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015517	GTAA	2	8	78388	78395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015517	AATA	2	8	79457	79464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015517	TAAA	2	8	79472	79479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015517	ATTG	2	8	79921	79928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015517	AAAT	2	8	79993	80000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015517	AAAG	2	8	80004	80011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015517	AAGA	2	8	82530	82537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015517	ATTA	2	8	82554	82561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015517	AAGT	2	8	82567	82574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015517	CATT	2	8	82648	82655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015517	TAAA	2	8	82787	82794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015517	TCAA	2	8	82813	82820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015517	CTAT	2	8	82850	82857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015517	ATTT	2	8	85450	85457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015517	ATTT	2	8	85504	85511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015517	TTAT	2	8	85729	85736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015517	CATA	2	8	85871	85878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015517	GTAA	2	8	85882	85889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015517	AAAT	2	8	85906	85913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015517	TAAT	2	8	86093	86100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015517	TAAT	2	8	86132	86139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015517	TACT	2	8	86394	86401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.