MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 4457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015435	TA	3	6	1217759	1217764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015435	TTA	2	6	1217779	1217784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015435	TTG	2	6	1217804	1217809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015435	A	7	7	1217827	1217833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015435	ATTAT	2	10	1217890	1217899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015435	TAA	2	6	1217936	1217941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015435	TTA	2	6	1218004	1218009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015435	AAG	2	6	1218056	1218061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015435	TCT	2	6	1218082	1218087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_015435	TCT	2	6	1218156	1218161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_015435	TCAA	2	8	1218182	1218189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_015435	AGTT	2	8	1218190	1218197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015435	ATCTG	2	10	1218397	1218406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_015435	GAG	2	6	1218435	1218440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015435	TAA	2	6	1219997	1220002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015435	ACT	2	6	1220027	1220032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015435	GCGAT	2	10	1220039	1220048	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3018	NC_015435	AGA	2	6	1220053	1220058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015435	AG	4	8	1220081	1220088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015435	TA	3	6	1220099	1220104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015435	TCC	2	6	1220197	1220202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_015435	TAAAT	2	10	1220280	1220289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015435	CTAA	2	8	1220570	1220577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_015435	GGAAA	2	10	1220603	1220612	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015435	ATA	2	6	1220686	1220691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015435	GAG	2	6	1220735	1220740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015435	GCG	2	6	1220799	1220804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_015435	TTG	2	6	1220819	1220824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015435	TA	3	6	1220881	1220886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_015435	CGT	2	6	1220891	1220896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015435	TTA	2	6	1220927	1220932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015435	TTA	2	6	1220969	1220974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015435	GAA	2	6	1220982	1220987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015435	AGA	2	6	1221023	1221028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015435	TGT	2	6	1222174	1222179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015435	TGAA	2	8	1222202	1222209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015435	ATTC	2	8	1222883	1222890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_015435	AGT	2	6	1224219	1224224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015435	GAA	2	6	1224268	1224273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015435	AAAT	2	8	1224326	1224333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015435	CAT	2	6	1225332	1225337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015435	CT	3	6	1225343	1225348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_015435	TAA	2	6	1225378	1225383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015435	AG	3	6	1225399	1225404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015435	TCA	2	6	1225477	1225482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015435	GAA	2	6	1225532	1225537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015435	GAC	2	6	1225553	1225558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_015435	TTC	2	6	1225561	1225566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_015435	TAT	2	6	1225780	1225785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015435	AAC	2	6	1227019	1227024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015435	A	6	6	1227032	1227037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015435	CAA	2	6	1227702	1227707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015435	AGGG	2	8	1227807	1227814	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015435	GAT	2	6	1227849	1227854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015435	ATTTC	2	10	1227869	1227878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3056	NC_015435	TAA	2	6	1227903	1227908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015435	AAG	2	6	1227924	1227929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015435	AGG	2	6	1227950	1227955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015435	TTA	2	6	1229914	1229919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015435	TA	3	6	1229944	1229949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015435	ATA	2	6	1230469	1230474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015435	ATT	2	6	1230479	1230484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015435	ATT	2	6	1230655	1230660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015435	GAT	2	6	1230662	1230667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015435	TGA	2	6	1230669	1230674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015435	CTG	2	6	1231437	1231442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015435	TTA	2	6	1231981	1231986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015435	GTA	2	6	1234378	1234383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015435	CTAAT	2	10	1234404	1234413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3070	NC_015435	T	6	6	1236461	1236466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015435	ACC	2	6	1239211	1239216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_015435	TAAAT	2	10	1239279	1239288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015435	ATA	2	6	1239293	1239298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015435	TTAAA	2	10	1240832	1240841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015435	AATAAA	2	12	1244283	1244294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015435	ATG	2	6	1247645	1247650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015435	ATA	2	6	1249266	1249271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015435	GAA	2	6	1249308	1249313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015435	A	6	6	1250292	1250297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015435	ATCGA	2	10	1250636	1250645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3081	NC_015435	TTTC	2	8	1250684	1250691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_015435	AT	3	6	1250693	1250698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015435	TAA	2	6	1250716	1250721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015435	AACA	2	8	1250815	1250822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_015435	ATA	2	6	1250835	1250840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015435	TAAT	2	8	1251081	1251088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015435	GT	3	6	1251147	1251152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015435	TAT	2	6	1251193	1251198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015435	TTA	2	6	1251199	1251204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015435	CT	3	6	1252002	1252007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_015435	TTC	2	6	1252033	1252038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_015435	AAC	2	6	1252103	1252108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015435	GAT	2	6	1252114	1252119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015435	TAA	2	6	1252135	1252140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015435	GAG	2	6	1252142	1252147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015435	CGC	2	6	1252205	1252210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_015435	TCT	2	6	1252211	1252216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_015435	TCC	2	6	1252219	1252224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_015435	TCA	2	6	1252241	1252246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015435	CCTA	2	8	1252323	1252330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_015435	TTC	2	6	1252383	1252388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015435	ATC	3	9	1252741	1252749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015435	ATTA	3	12	1252834	1252845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015435	TCT	2	6	1252847	1252852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_015435	AGAA	2	8	1252855	1252862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015435	AATC	2	8	1253060	1253067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_015435	TCGT	2	8	1253106	1253113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_015435	GGA	2	6	1253155	1253160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015435	AGA	2	6	1253257	1253262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015435	TCT	2	6	1253293	1253298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_015435	GTT	2	6	1253311	1253316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015435	TAA	2	6	1253348	1253353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015435	TAGCC	2	10	1253428	1253437	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3114	NC_015435	TAT	2	6	1253467	1253472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015435	TA	3	6	1256855	1256860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015435	AG	3	6	1256886	1256891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015435	ATA	2	6	1256907	1256912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015435	AATTA	2	10	1257032	1257041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015435	TA	3	6	1257044	1257049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015435	TA	3	6	1257125	1257130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015435	ATT	2	6	1259711	1259716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015435	CTT	2	6	1259729	1259734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015435	CGG	2	6	1261877	1261882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_015435	CCT	2	6	1261896	1261901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_015435	A	6	6	1265795	1265800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015435	TTA	2	6	1265815	1265820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015435	TCC	2	6	1266904	1266909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_015435	CTT	2	6	1266911	1266916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015435	CTA	2	6	1266952	1266957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015435	TAA	2	6	1266966	1266971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015435	TAAAA	2	10	1269887	1269896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015435	A	6	6	1269893	1269898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_015435	TAC	2	6	1340416	1340421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3255	NC_015435	TAATA	2	10	1340461	1340470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_015435	TTA	2	6	1340813	1340818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_015435	TAA	3	9	1343138	1343146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_015435	AGA	2	6	1343154	1343159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_015435	AGT	2	6	1346008	1346013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_015435	A	6	6	1348350	1348355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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