MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 4457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015435	ATT	2	6	1008286	1008291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_015435	GCC	2	6	1008327	1008332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_015435	CGT	2	6	1008545	1008550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_015435	GTGAGT	2	12	1008592	1008603	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015435	GAAA	2	8	1008776	1008783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_015435	TGC	2	6	1008799	1008804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_015435	GAAA	2	8	1008964	1008971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_015435	CAT	2	6	1008988	1008993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_015435	ACG	2	6	1008996	1009001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_015435	TTCG	2	8	1009052	1009059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_015435	GTA	2	6	1009067	1009072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015435	CGT	2	6	1009312	1009317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_015435	CGGT	2	8	1009325	1009332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_015435	AG	3	6	1009367	1009372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_015435	GTA	2	6	1009442	1009447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_015435	GATT	2	8	1009614	1009621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015435	TTA	2	6	1009629	1009634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015435	TGT	2	6	1009679	1009684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_015435	TA	3	6	1009805	1009810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015435	TC	3	6	1009812	1009817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2521	NC_015435	GAAA	2	8	1009859	1009866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_015435	TGA	2	6	1010221	1010226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_015435	AGGA	2	8	1010252	1010259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015435	TAG	2	6	1010411	1010416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_015435	ACA	2	6	1010580	1010585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_015435	TAT	2	6	1010599	1010604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_015435	CCA	2	6	1010705	1010710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_015435	AC	3	6	1010766	1010771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_015435	T	7	7	1011353	1011359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_015435	ACC	2	6	1011418	1011423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_015435	AAGC	2	8	1011458	1011465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_015435	GAG	2	6	1011470	1011475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015435	CT	3	6	1011490	1011495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_015435	TA	3	6	1011595	1011600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_015435	AGGT	2	8	1012033	1012040	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_015435	CTC	2	6	1012160	1012165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_015435	ACT	2	6	1012222	1012227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_015435	TAA	2	6	1012605	1012610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_015435	TCGTAG	2	12	1012620	1012631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2540	NC_015435	TAT	2	6	1012635	1012640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_015435	CAA	2	6	1012685	1012690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_015435	CCCT	2	8	1013727	1013734	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2543	NC_015435	GGCT	2	8	1013777	1013784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_015435	AGG	2	6	1013789	1013794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015435	CG	3	6	1013801	1013806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_015435	AGG	2	6	1013863	1013868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_015435	CCG	2	6	1013961	1013966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_015435	GACGA	2	10	1013974	1013983	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2549	NC_015435	CTTT	2	8	1013994	1014001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_015435	GC	3	6	1014029	1014034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_015435	TGA	2	6	1014055	1014060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_015435	GCTC	2	8	1014061	1014068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_015435	AGG	2	6	1014134	1014139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_015435	GA	3	6	1014147	1014152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_015435	TC	3	6	1014197	1014202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_015435	AG	3	6	1014221	1014226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_015435	GAG	2	6	1014238	1014243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_015435	GA	3	6	1014327	1014332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_015435	CTTTA	2	10	1014394	1014403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2560	NC_015435	TGGT	2	8	1014489	1014496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_015435	GGC	2	6	1017371	1017376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_015435	ACT	2	6	1017408	1017413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_015435	CT	3	6	1017415	1017420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2564	NC_015435	TA	3	6	1017486	1017491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_015435	GAT	3	9	1017498	1017506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_015435	AATG	2	8	1018459	1018466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015435	TCT	2	6	1018490	1018495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_015435	T	6	6	1018540	1018545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_015435	TTGA	2	8	1018558	1018565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_015435	CGC	2	6	1018689	1018694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_015435	TGA	2	6	1018739	1018744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_015435	TAGA	2	8	1018768	1018775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_015435	GAG	2	6	1018793	1018798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_015435	CGC	2	6	1018808	1018813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_015435	TCC	2	6	1025162	1025167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_015435	AACA	2	8	1027631	1027638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_015435	ATG	2	6	1027654	1027659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_015435	CTA	2	6	1028514	1028519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_015435	ATT	2	6	1028585	1028590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_015435	TC	3	6	1028620	1028625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_015435	AATT	2	8	1028638	1028645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_015435	CT	3	6	1028717	1028722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_015435	TAACG	2	10	1028857	1028866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2584	NC_015435	TCA	2	6	1029031	1029036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_015435	GAA	2	6	1029110	1029115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_015435	TAGA	2	8	1029138	1029145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_015435	T	6	6	1029155	1029160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015435	TAA	2	6	1029165	1029170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_015435	TAAC	2	8	1029200	1029207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_015435	CGAG	2	8	1029279	1029286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_015435	CTA	2	6	1029311	1029316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_015435	AGC	2	6	1029326	1029331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_015435	C	6	6	1029581	1029586	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2594	NC_015435	TCAAT	2	10	1029634	1029643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2595	NC_015435	TC	4	8	1029813	1029820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_015435	TGA	2	6	1029822	1029827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_015435	TCC	2	6	1029856	1029861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_015435	CCT	2	6	1029880	1029885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_015435	ATCG	2	8	1030202	1030209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2600	NC_015435	GAG	2	6	1030231	1030236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_015435	GAA	2	6	1030238	1030243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_015435	T	6	6	1031183	1031188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_015435	TC	3	6	1031190	1031195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_015435	TACC	2	8	1031854	1031861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_015435	TAG	2	6	1031874	1031879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_015435	TGG	2	6	1037383	1037388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_015435	TGA	2	6	1038410	1038415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_015435	TTA	2	6	1041296	1041301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_015435	TAAA	2	8	1041351	1041358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_015435	GAT	2	6	1041370	1041375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_015435	AGGAC	2	10	1041390	1041399	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2612	NC_015435	TCG	2	6	1042092	1042097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015435	ATA	2	6	1045332	1045337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_015435	TA	3	6	1045347	1045352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015435	TAA	2	6	1045373	1045378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_015435	ATT	2	6	1045385	1045390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_015435	AT	5	10	1045393	1045402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_015435	GAAT	2	8	1045426	1045433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_015435	T	6	6	1045560	1045565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_015435	ATT	2	6	1045597	1045602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_015435	AG	3	6	1045830	1045835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_015435	TAT	2	6	1045881	1045886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_015435	TGAGA	2	10	1047326	1047335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_015435	ATG	2	6	1047418	1047423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_015435	GCGTT	2	10	1047443	1047452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2626	NC_015435	TAA	2	6	1047864	1047869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_015435	CAA	2	6	1047911	1047916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_015435	TA	3	6	1047973	1047978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_015435	ATAAA	2	10	1047995	1048004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_015435	TAA	2	6	1048045	1048050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_015435	GTGAA	2	10	1049939	1049948	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2633	NC_015435	TC	3	6	1050587	1050592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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